詳細介紹
FastPfu DNA polymerase高保真酶
PCR 反應用到的超保真 P6 DNA 聚合酶、buffer、dNTP Mixture 以及穩定劑以 2倍的終濃度進行混合。使用時,只需在制品溶液中加入模板和引物便可進行 PCR反應,大大簡化了操作過程,降低了 PCR操作過程中污染的可能性。P6 High-Fidelity DNA Polymerase 是基于 Pyrococcus furiosus 的高溫 DNA聚合酶,具有耐熱型 5´-3´ 的聚合酶活力以及 3´-5´的核酸外切酶活力,因此屬于高保真 DNA 聚合酶(其保真度達到普通 Taq 酶的 55 倍)。該酶經過生物工程改造后,其擴增能力、保真度都得到提升,并且具有廣泛的模板適應性,擴增速度達到 2-4 kb/min。優化的 Premix 針對 λ DNA 等簡單模板的有效擴增長度可達 40 kb,cDNA 有效擴增長度可達 15 kb,基因組有效擴增長度可達 20 kb。
FastPfu DNA polymerase高保真酶
無染料
2×P6 High-Fidelity Premix
Loading buffer
預混液應置于-20 ℃保存,避免反復凍融。
FastPfu DNA polymerase高保真酶
(1)性能檢測 1:
在 50 μL PCR 反應體系加入 25 μL premix、100 ng Human RP11 13M9-pBACe3.6 質粒,擴增 15 kb 的 DNA目的片段,在 30 個循環擴增后經 1%瓊脂糖凝膠檢測可在 15 kb 處檢測到非常亮且單一的目的條帶。
(2)性能檢測 2:
在 50 μL PCR 反應體系加入 25 μL premix、大腸桿菌菌落,擴增 5 kb 的 DNA 目的片段,在 30 個循環擴增后經 1%瓊脂糖凝膠檢測可在 5 kb 處檢測到較亮的單一目的條帶。
(3)大腸桿菌核酸殘留檢測:
在 20 μL 熒光定量 PCR 反應體系加入 10 μL premix(無染料)和大腸桿菌特異基因擴增引物(如 gapA);
在不加入大腸桿菌 DNA 模板的情況下,20 個循環內熒光信號值在基線范圍。
* 針對不同類型的模板,所需的模板量會有不同,如基因組和質粒,等等;需要根據實際情況,添加合適的模板量。
** 退火溫度需根據引
物和模板實際的 G+C 含量來作調整。 mix
2. PCR 反應參數(供參考)**:
(起始變性): 95 ℃ 5 min
(解鏈): 95 ℃ 30 sec
(退火): 55 ℃ 30 sec
(延伸): 72 ℃ x min (30-35 循環:2 kb/min)
(終延伸): 72 ℃ 7 min
(臨時保存): 16 ℃ 保溫
1. 在冰浴上設置 PCR 反應(供參考)*:
模板: < 500 ng
2× P6 High-Fidelity Premix: 25 μL
Primer 1/2: 0.2 - 1.0 μM (final conc.)
滅菌蒸餾水 Up to 50 μL
2× P6 High-Fidelity Premix 高保真酶?應用實例
P6 擴增速度測試
以pUC18質粒為模板擴增不同長度的DNA的片段,PCR反應程序設置為:95℃ 5min;98℃ 5sec, 55℃ 30sec, 72℃ 1sec;72℃ 5min(30 Cycles)。結果如下:
常規 PCR 擴增指南:
1. 簡單模板如質粒等可按照 5 sec/kb 設置程序。
2. 大多數模板的預變性溫度為 95 度,30 sec-5 min。
高 GC 含量模板預變性溫度為 98 度,30 sec-5 min。
3. 常規退火時間設置為 10 sec,復雜模板設置為 10 sec-30 sec。
P6 擴增不同長度的 DNA的片段
以 100 ng Human RP11 13M9-pBACe3.6 質粒為模板擴增不同長度的 DNA的片段,PCR 反應程序設置為: 95 ℃ 5min;98 ℃ 5 sec, 55 ℃ 30 sec, 72 ℃ 8 min;72 ℃ 10 min(30 Cycles)。結果如下:
長片段擴增指南:
1. 使用高質量的模板。
2. 增加引物長度提高退火溫度,退火/延伸合并成一步。
3. 添加適當濃度的 DMSO,一般不高于 5%。
4. 提高變性溫度為 98 度,縮短變性時間為 5 sec。
P6 擴增高 GC 含量和低 GC 含量 DNA的片段。
以人基因組為模板擴增不同 GC 含量的 DNA的片段,程序設置為:95 ℃ 5min;95 ℃ 30 sec, 55 ℃ 30 sec, 72 ℃ 1 sec;72 ℃ 5 min(30 Cycles)。結果如下:
高 GC 和低 GC 模板擴增指南
1. 使用高質量的模板。
2. 高 GC 模板可適當添加 DMSO,一般終濃度不高于 5%。
3. 高 GC 含量模板可適當提高退火溫度,還可使用 Touch down 的方法進行 PCR 擴增。
4. 低 GC 含量模板可以適當降低退火溫度。