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真核生物的一切有核細胞(包括培養細胞)都能用來制備基因組 DNA。真核生物的DNA是以染色體的形式存在于細胞核內,因此,制備DNA的原則是既要將DNA與蛋白質、脂類和糖類等分離,又要保持DNA分子的完整。
實驗方法
- 小量制備
- 氯化銫法
實驗方法原理 | 提取DNA的一般過程是將分散好的組織細胞在含SDS(十二烷基硫酸鈉)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白質,再用酚和氯仿/異戊醇抽提分離蛋白質,得到的DNA溶液經乙醇沉淀使DNA從溶液中析出。 |
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實驗材料 | 細菌 |
試劑、試劑盒 | 溴化乙錠 氯化銫 丁醇 |
儀器、耗材 | 離心機 巴斯吸管 搖床 |
實驗步驟 | 1. 培養100 ml 細菌培養物至飽和狀態,用JA-20轉子4 000 g 離心10 min。 2. 用9.5 ml 的TE緩沖液重懸沉淀。 3. 加0.5 ml 10%的SDS和50 μl 20 mg/ml 的蛋白酶K,混合,于37℃溫育1 h。 4. 加1.8 ml 5 mol/l NaCl,充分混合,加入1. 5 ml CTAB/NaCl溶液,混合,于65℃溫育20 min。 5. 加等體積的氯仿/異戊醇抽提,室溫下6 000 g 離心10 min,用寬口吸管將上清液轉移至新管中。 6. 加化6體積的異丙醇,輕輕混合直至沉淀下來,用一個封口的巴斯德吸管將沉淀轉移至70%乙醇中冼滌。 7. 10 000 g 離心5 min,棄上清,用4 ml TE緩沖液重懸沉淀。 8. 用分光光度計檢測DNA的濃度,將其調節到50~100 μg/ml。 9. 每4 ml 緩沖液加人4.3 g CsCl,并使之溶解,加入200 μl 的10 mg/ml 的溴化乙錠。 10. 轉移至4 ml 快封口離心管中,調節體積,用TE緩祌液配制的CsCl平衡離心管,封住管口。 11. 用VTi80轉子于15℃,以420 000 g 離心4 h或 250 000 g。 12. 在長波紫外燈下觀察梯帶,用15號針頭和3 ml 塑料注射器移出條帶。 13. 用CsCl飽和的異丙醇或水飽和的丁醇離心抽提,以除去溴化乙錠。 14. 在2 L TE緩沖液中透折以除去CsCl,如果必要,沉淀DNA并重新溶解至所需要的濃度。 |