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DNA實驗技術:細菌中制備基因組DNA實驗

2013-8-22  閱讀(1009)

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標簽: 細菌 基因 DNA

真核生物的一切有核細胞(包括培養細胞)都能用來制備基因組 DNA。真核生物的DNA是以染色體的形式存在于細胞核內,因此,制備DNA的原則是既要將DNA與蛋白質、脂類和糖類等分離,又要保持DNA分子的完整。

實驗方法
  • 小量制備
  • 氯化銫法
實驗方法原理 提取DNA的一般過程是將分散好的組織細胞在含SDS(十二烷基硫酸鈉)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白質,再用酚和氯仿/異戊醇抽提分離蛋白質,得到的DNA溶液經乙醇沉淀使DNA從溶液中析出。
實驗材料
試劑、試劑盒
儀器、耗材
實驗步驟
1.  培養100 ml 細菌培養物至飽和狀態,用JA-20轉子4 000 g 離心10 min。

2.  用9.5 ml 的TE緩沖液重懸沉淀。

3.  加0.5 ml 10%的SDS和50 μl 20 mg/ml 的蛋白酶K,混合,于37℃溫育1 h。

4.  加1.8 ml 5 mol/l NaCl,充分混合,加入1. 5 ml CTAB/NaCl溶液,混合,于65℃溫育20 min。
 
5.  加等體積的氯仿/異戊醇抽提,室溫下6 000 g 離心10 min,用寬口吸管將上清液轉移至新管中。
 
6.  加化6體積的異丙醇,輕輕混合直至沉淀下來,用一個封口的巴斯德吸管將沉淀轉移至70%乙醇中冼滌。
 
7.  10 000 g 離心5 min,棄上清,用4 ml TE緩沖液重懸沉淀。

8.  用分光光度計檢測DNA的濃度,將其調節到50~100 μg/ml。

9.  每4 ml 緩沖液加人4.3 g CsCl,并使之溶解,加入200 μl 的10 mg/ml 的溴化乙錠。

10.  轉移至4 ml 快封口離心管中,調節體積,用TE緩祌液配制的CsCl平衡離心管,封住管口。

11.  用VTi80轉子于15℃,以420 000 g 離心4 h或 250 000 g。
 
12.  在長波紫外燈下觀察梯帶,用15號針頭和3 ml 塑料注射器移出條帶。

13.  用CsCl飽和的異丙醇或水飽和的丁醇離心抽提,以除去溴化乙錠。

14.  在2 L TE緩沖液中透折以除去CsCl,如果必要,沉淀DNA并重新溶解至所需要的濃度。

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