轉基因農產品的檢測，就是檢測農產品中有否外源基因，實質上是檢測啟動子、終止子、標記基因片斷、目的基因片斷、外源基因轉錄產物的豐度等。就方法而言，分為基因水平的檢測（各種PCR定性、定量方法和基因芯片技術）和基因轉錄水平檢測（酶聯免疫吸附反應技術、蛋白芯片技術以及Southen雜交Westen印跡法等），主要使用儀器按檢測程序分3部份：
　　（1） 用于DNA樣品制備的儀器設備：試劑盒、離心機、振蕩器等；
　　（2） 用于基因擴增的儀器設備： PCR儀、混合液，保真DNA聚合酶等；
　　（3） 分離、分析、檢定的儀器設備：電泳系統、成像分析系統、核酸（蛋白）測定儀、酶標儀、洗板機、定量PCR儀等。
　　這些儀器設備國外主要廠家BI0-RAD、Thermo-Life Sciences、GE等；國內雖尚無完整生產上述儀器的廠家，但上海的天能、天美、三科、新芝，杭州的郎基、博日，北京的六一等各生產上述部份儀器。