自閉癥又稱孤獨(dú)癥，是一種毀滅性的神經(jīng)系統(tǒng)失調(diào)導(dǎo)致的發(fā)育障礙，這種疾病被認(rèn)為是目前世界范圍內(nèi)影響兒童zui嚴(yán)重的公共健康問題之一。

         對于此類智力落后相關(guān)的復(fù)雜性疾病成因，常常需要進(jìn)行多方面多因素分析，基因組拷貝數(shù)變異（copy number variations, CNVs）就是其中的致病原因之一?；蚪M拷貝數(shù)變異CNVs是指染色體某段區(qū)域發(fā)生的重復(fù)（duplication）或者缺失，它與點(diǎn)突變（point mutation）的區(qū)別是前者是基因組某一段區(qū)域發(fā)生重復(fù)或缺失，而后者是基因組某一個位點(diǎn)發(fā)生變異。

           目前研究發(fā)現(xiàn)某些疾病與點(diǎn)突變有關(guān)，如很多單基因疾??；而有些疾病與基因組拷貝數(shù)的變化有關(guān)，比如一些三體綜合癥、1q21微缺失綜合征以及Miller-Dieker綜合征等；更多情況下很多復(fù)雜性疾病由點(diǎn)突變和拷貝數(shù)變異共同組成其致病原因，如孤獨(dú)癥，先天性心臟病等。

            染色體基因芯片分析（Chromosomal Microarray Analysis，CMA）能在全基因組范圍內(nèi)同時檢測很多種因染色體拷貝數(shù)變異而導(dǎo)致的疾病，因為其通量大，分辨率高，技術(shù)平臺日益成熟，目前染色體基因芯片已經(jīng)逐步應(yīng)用于多種疾病的臨床診斷和研究。

            研究人員在31.5%的患者樣品中檢測出了染色體的異常，其中發(fā)生異常改變zui多的是7號和17號染色體。這項研究表明基因組拷貝數(shù)變異是多發(fā)畸形和/或不明原因智力落后患者的主要致病原因之一，利用CytoScanHD芯片檢測患有此類疾病患者的基因變異，陽性率顯著高于常規(guī)染色體核型分析。

           以往經(jīng)典地針對多發(fā)畸形和智力落后患者的檢測手段主要是細(xì)胞遺傳學(xué)的方式。細(xì)胞遺傳學(xué)主要研究染色體畸變與遺傳病的關(guān)系，對于遺傳咨詢和產(chǎn)前診斷具有重要意義。目前主要的研究方法有: 1.染色體核型分析；2. FISH（fluorescence in situ hybridization）技術(shù)；3.基因組芯片雜交。

           其中基因組芯片雜交技術(shù)是FISH技術(shù)的一大延伸與重大飛躍，它通過單一的一次雜交，可對某一樣本整個基因組的染色體拷貝數(shù)量的變化進(jìn)行檢查。

           根據(jù)其原理有兩種類型芯片：一種是比較基因組芯片（comparative genomic in situ,CGH），其基本原理是用不同的熒光染料通過缺口平移法分別標(biāo)記患者樣本和正常樣本的DNA制成探針，并與正常樣本染色體進(jìn)行共雜交，以在染色體上顯示的患者與正常對照的熒光強(qiáng)度的不同來反映整個患者基因組DNA表達(dá)狀況的變化，再借助于圖像分析技術(shù)可對染色體拷貝數(shù)量的變化進(jìn)行定量研究,此類技術(shù)以Agilent和Nimblegen為代表；另外一種是基因分型陣列芯片（Genotyping array），其根本原理是不需要正常對照，它是根據(jù)自身相互間SNP位點(diǎn)對比，zui后和Hapmap數(shù)據(jù)庫正常人對比。此類技術(shù)以Affymetrix和Illumina為代表。

          基因芯片作為細(xì)胞遺傳學(xué)檢測手段中的一種，有相對以往經(jīng)典的遺傳學(xué)檢測*的優(yōu)勢：①能在全基因組范圍內(nèi)同時檢測很多種因染色體失衡而導(dǎo)致的疾??；②能同時檢測到染色體的缺失（deletion）和增加（duplication），并能準(zhǔn)確地測定其大??；③能檢測到≥10%水平的嵌合體；④分辨率高，相比傳統(tǒng)核型分析高出近千倍。染色體基因芯片分析檢測平臺及技術(shù)日益成熟，已經(jīng)逐步應(yīng)用于多種疾病的臨床診斷和研究，為分子診斷平臺的完善提供了重要的。