近年來,抗體藥、疫苗和細胞基因治療產品等生物制品因具有更強的特異性、能與分子靶點結合、療效好、副作用少等特點,獲得快速發展。然而生物制品成分多樣,結構復雜,生產工藝也各不相同,在制備過程中較容易受到污染和產生雜質。
常見的污染物是指帶入的外源性物質,如生物性原材料攜帶的病原微生物(eg.細菌、支原體、分枝桿菌、內源性病毒和外界污染的病毒)。雜質一般分為產品相關雜質和工藝相關雜質。產品相關雜質包括聚體、降解產物、電荷異構體、疏水變體、無活性的病毒顆粒、非目的范圍的多糖、包裝不完整的病毒樣顆粒等。工藝相關雜質包括細胞基質(宿主細胞蛋白、宿主細胞DNA)、細胞培養物(誘導劑、抗生素或培養基成分)或下游工藝殘留物。這些雜質和污染物等不僅會影響生物藥的藥效,還可能存在安全性隱患,因此藥物的研發和生產過程需要進行嚴格的質量管控。
其中,宿主細胞殘留DNA(HCD)和支原體的檢測是大多數生物制品質檢項目中普遍存在且又非常重要的兩個檢項。對于HCD和支原體的檢測主要包括四個大步驟:
1)制備待測樣本;
2)待測樣本的核酸提取;
3)qPCR反應體系配制和擴增;
4)數據分析。
圖1. 宿主細胞中殘留DNA檢測流程圖
由于生物制品的研發和生產過程需要經過離心、過濾、親和層析、離子交換等多個環節,因此這些生物制品的中間品、半成品和成品中的殘留DNA等雜質基本是微量的。此外,這些生物制品還通常是以高濃度的蛋白/核酸等形式存在的。若在這些情況下,直接采用定量PCR方法檢測外源性殘留DNA,則容易受核酸純度、樣本復雜性、qPCR反應抑制等因素影響,無法對微量殘留DNA進行準確定量。
2020年版《中華人民共和國藥典》三部通則3407外源性DNA殘留量測定法提到:供試品處理,可根據需要對供試品進行稀釋,也可按碘化鈉沉淀法或磁珠法等方法濃縮純化DNA。目前,磁珠法以其操作簡便、純度高且可以實現自動化等優勢,被廣泛應用在生物醫藥等領域質量安全控制檢測項目相關的樣本前處理中。
磁珠法的核酸提取,利用緩沖體系、磁珠親和吸附作用,可將生物制品中微量DNA從復雜的蛋白質、緩沖液和鹽混合物中高效回收,且殘留DNA的純度和靈敏度也能較好的保障。
磁珠法的核酸提取又分為手動提取和自動化提取兩種方案,通常樣本量少、實驗時間充足的情況下,選擇手動提取即可。但手動提取全程需要人力操作和時間精力的投入,無法同時開展其他的工作。此外,一旦待檢樣本數量增多,手動提取就較難滿足實際需求了,并且樣本量多時手動提取還容易產生人工誤差。
采用自動化的核酸提取儀器可以解決上述這些問題,并具有如下優點:
核酸純化系統可以快速、高效地提取純凈的核酸;
具有高通量性能,可以同時處理多個樣本;
通常具有自動化的功能,以減少實驗中的操作步驟和人工誤差;
通常配備了預裝的核酸提取試劑盒,簡化了實驗流程和樣品處理的體積;
采用無廢液和封閉式的處理方式,避免交叉污染,確保樣品的純凈性,同時減少操作的變異性。
手動提取
自動化提取
圖2. 手動提取和自動核酸提取操作流程圖
翌圣生物-全自動核酸提取儀
基于磁珠法樣本前處理手動提取和自動化核酸提取儀器的上述優勢,以及生物醫藥領域質量安全控制方向宿主細胞殘留DNA(HCD)和支原體的檢測對于樣本前處理和自動化核酸提取的需求。翌圣生物依托法規藥典要求,并結合市場需求,推出了一系列自動核酸提取儀(包括16、48、96通道)。
這些核酸提取儀器配套對應的預封裝磁珠法樣本前處理試劑盒,可實現核酸的高通量提取,為客戶提供樣本前處理、自動化核酸提取到殘留DNA和支原體污染檢測等全套完整解決方案。目前這些設備已經經過不同生物制品核酸殘留檢測、核酸安全性檢測等方法的適用性驗證,可廣泛應用于生物醫藥企業檢測實驗室中。
產品優勢
快速高通量:可任選16、48、96通道提取儀,可同時最多提取96個樣本,操作時間10min~60min;
試劑兼容性:基于翌圣核酸提取純化平臺,適配各種磁珠法提取試劑盒以及預封裝試劑盒;
污染控制:實驗艙具備負壓HEPA排氣過濾模塊,內置紫外消毒模塊,防止樣本污染;
體積小巧:儀器外觀設計簡潔,16和48通道儀器都相對小巧便攜,節約實驗空間;
樣品保護:有開機自檢、靜音運行、高溫報警、過溫保護等功能,減少樣品損失;
提醒功能:具備不上磁套提醒功能,避免磁棒套污染影響儀器壽命;
智能化操作系統:機載觸摸屏,界面簡潔,中英文雙系統自由切換。
解決的痛點
待檢測樣本量大,人力資源不夠用;
手提實驗操作步驟復雜和有人工誤差;
少量樣本,也可使用小通量提取儀,解放雙手。
應用實例
翌圣16通道核酸提取儀、搭配ABI 7500熒光定量PCR儀,在Vero殘留DNA檢測中的應用。
分別制備高中低濃度:30pg/μL、300fg/μL、3fg/μL的Vero殘留DNA試劑盒的標準品樣本,采用預封裝的磁珠法樣本前處理試劑盒搭配16通道自動化核酸提取儀器對樣本提取后檢測,每個樣本進行3個提取重復,每個提取做3個測試重復,分析樣本回收率和CV。對于不同濃度Vero DNA樣品回收率均在70%~130%之間,CV均<20%。
表1. 空白樣本加標回收率
用5份不同背景溶液(高蛋白、高核酸、高鹽、高低PH)對同一濃度樣本(300fg/μL的Vero殘留DNA試劑盒標準品)提取(采用預封裝的磁珠法樣本前處理試劑盒搭配16通道自動化核酸提取儀器),每種背景溶液進行3個提取重復,每個提取做3個測試重復,分析樣本回收率和CV。對于不同背景溶液的DNA樣本回收率均在70%~130%之間,CV均<20%。
表2. 模擬樣本加標回收率
產品信息
翌圣質控產品推薦
產品定位 | 產品名稱 | 貨號 | 規格 |
宿主殘留DNA檢測 | CHO宿主細胞DNA殘留檢測試劑盒(3G) | 41332ES50/60 | 50T/100T |
HEK293宿主細胞DNA殘留檢測試劑盒(3G) | 41331ES50/60 | 50T/100T | |
Human宿主細胞DNA殘留檢測試劑盒 | 41331ES50/60 | 50T/100T | |
Vero宿主細胞DNA殘留檢測試劑盒(2G) | 41307ES50/60 | 50T/100T | |
E.coli宿主細胞DNA殘留檢測試劑盒(2G) | 41308ES50/60 | 50T/100T | |
漢遜酵母宿主細胞DNA殘留檢測試劑盒 | 41317ES50/60 | 50T/100T | |
MDCK宿主細胞DNA殘留檢測試劑盒 | 41319ES50/60 | 50T/100T | |
釀酒酵母宿主細胞DNA殘留檢測試劑盒 | 41324ES50/60 | 50T/100T | |
畢赤酵母宿主細胞DNA殘留檢測試劑盒 | 41328ES50/60 | 50T/100T | |
Sf9和桿狀病毒DNA殘留檢測試劑盒 | 41330ES50/60 | 50T/100T | |
質粒DNA殘留檢測試劑盒 | 41323ES50/60 | 50T/100T | |
殘留DNA片段分析 | Vero宿主細胞殘留DNA片段分析試劑盒 | 41314ES70/74 | 4×50T/4×100T |
HEK293宿主細胞殘留DNA片段分析試劑盒 | 41316ES70/74 | 4×50T/4×100T | |
Human宿主細胞殘留DNA片段分析試劑盒 | 41326ES70/74 | 4×50T/4×100T | |
CHO宿主細胞殘留DNA片段分析試劑盒 | 41334ES70/74 | 4×50T/4×100T | |
宿主殘留RNA檢測 | E.coli宿主細胞RNA殘留檢測試劑盒 | 41318ES50/60 | 50T/100T |
風險基因檢測 | SV40LTA&E1A殘留DNA檢測試劑盒 | 41310ES50/60 | 50T/100T |
CAR/TCR基因拷貝數檢測試劑盒 | 41313ES50/60 | 50T/100T | |
復制型慢病毒(RCL)檢測試劑盒 | 41311ES50/60 | 50T/100T | |
RCA (E1A)基因拷貝數檢測試劑盒 | 41321ES50/60 | 50T/100T | |
復制型腺相關病毒血清型2 (rcAAV2)檢測試劑盒 | 41327ES50/60 | 50T/100T | |
復制型逆轉錄病毒(RCR)檢測試劑盒 | 41329ES50/60 | 50T/100T | |
慢病毒物理滴度qPCR檢測試劑盒 | 41333ES50/60 | 50T/100T | |
HIV-1 p24 ELISA Kit | 99301ES24/48/96 | 24T/48T/96T | |
支原體檢測 | 支原體qPCR檢測試劑盒(探針法)(2G) | 40619ES25/60 | 25T/100T |
支原體qPCR檢測試劑盒(探針法) | 40618ES25/60 | 25T/100T | |
宿主殘留蛋白檢測 | E.coli HCP ELISA檢測試劑盒 | 36712ES48/96 | 48T/96T |
E.coli HCP ELISA檢測試劑盒(質粒) | 36721ES48/96 | 48T/96T | |
HEK293 HCP ELISA檢測試劑盒 | 36713ES48/96 | 48T/96T | |
畢赤酵母HCP ELISA檢測試劑盒 | 36720ES | 48T/96T | |
核酸酶殘留檢測 | 全能核酸酶檢測試劑盒 | 36701ES96 | 96T |
全能核酸酶(M級)檢測試劑盒 | 36702ES48/96 | 48T/96T | |
耐高鹽全能核酸酶ELISA試劑盒 | 36703ES48/96 | 48T/96T | |
其他蛋白殘留檢測 | Protein A ELISA檢測試劑盒 | 36716ES48/96 | 48T/96T |
BSA牛血清白蛋白ELISA檢測試劑盒 | 36722ES96 | 96T | |
T7 RNA聚合酶ELISA檢測試劑盒 | 36705ES48/96 | 48T/96T | |
無機焦磷酸酶ELISA檢測試劑盒 | 36706ES48/96 | 48T/96T | |
鼠源RNase抑制劑ELISA檢測試劑盒 | 36707ES48/96 | 48T/96T | |
牛痘病毒加帽酶ELISA檢測試劑盒 | 36709ES48/96 | 48T/96T | |
RNase/DNase殘留檢測 | RNase活性檢測試劑盒(熒光標記法) | 41309ES96/97 | 1×96T/5×96T |
DNase活性檢測試劑盒(熒光標記法) | 41322ES48/68 | 48T/192T |
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