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關于WB實驗中的marker,你應該知道的事

來源:愛必信(上海)生物科技有限公司   2024年10月23日 11:42  

1、什么是蛋白marker?

 

蛋白Marker,也稱為蛋白質分子量標準(Protein Molecular Weight Marker),是用于蛋白質電泳分析中的一系列已知分子量的蛋白質混合物。它們通常包含多個不同分子量的蛋白質條帶,這些條帶在電泳過程中會根據分子量的大小和電荷差異遷移不同的距離,從而在凝膠上形成一系列有序的條帶。

 

2、Marker在WB中的作用?

 

分子量標定:Marker包含一系列已知分子量的蛋白質,通過與Marker上的帶狀蛋白質帶進行比較,可以精確地確定待測蛋白的分子量;

驗證電泳和轉印效果:Marker在電泳和轉印的過程中移動到膜上,可以幫助研究者驗證這些步驟的效果。通過檢查Marker的帶狀分布,可以確保電泳和轉印過程中沒有發生異常;

確定蛋白質遷移距離:通過測量Marker的遷移距離,可以估算待測蛋白質的遷移距離。這對于進一步的數據分析和結果解釋非常重要;

標定凝膠濃度:Marker還可以用于幫助研究者選擇適當的凝膠濃度。不同分子量的Marker在不同的凝膠濃度下會產生不同的遷移模式,因此可以根據Marker的遷移特性選擇合適的凝膠濃度。

 

3、Marker有哪些分類,各有什么特點?

 

● 天然蛋白Marker:

 

這類Marker是從自然來源提取的蛋白質,它們經歷了天然的修飾過程,如裂解、二硫鍵形成、糖基化或磷酸化,并保持其復雜的3D結構。天然蛋白Marker更接近其在體內的自然狀態,這使得它們在藥物開發和生物醫學研究中非常有用。天然蛋白Marker可以提供更準確的分子量估計,因為它們未經過重組或合成,保持了蛋白質的自然特性。abs9919非變性蛋白Marker (66-669kDa),經過非變性電泳后,用考馬斯亮藍染色后可以得到分布均勻、密度相近的4條帶,不適用于SDS-Page,因為在SDS存在下,含有多個亞單位的蛋白會不同程度解聚。

 

abs9919非變性蛋白Marker(66-669kDa)

 

● 變性Marker:

 

這類Marker在生產過程中經過了變性處理,通常是通過加熱和化學物質(如SDS)的處理,以確保蛋白質wan全展開成線性結構。變性Marker的優點在于它們提供了一致的蛋白質遷移特性,這對于精確的分子量估計和實驗重復性非常重要。由于變性處理,這類Marker的蛋白質保持一致的電荷和形狀,使得它們在電泳過程中的遷移更加可預測。

 

變性蛋白Marker一般可分為預染和非預染兩種

 

● 未預染蛋白Marker:

 

這類Marker包括寬分子量、高分子量和低分子量蛋白標準。它們是較簡單、較準確的一種,因為不附帶染料分子或標記分子,所以所示大小正好是蛋白原本的大小。缺點是在電泳過程中不可見,需要在電泳結束后經過染色才能看到,無法實時監控電泳過程。適合精確判斷蛋白大小,但操作相對麻煩,需要額外的染色步驟。如abs9840非預染蛋白Marker (14.4-97.4kDa),用考馬斯亮藍R-250染色可得分布均勻密度相同的六個條帶,產品含SDS, 不適合用于非變性膠。

 

abs9840非預染蛋白Marker(14.4-97.4kDa)

 

● 預染蛋白Marker:

 

這類Marker在生產時就結合了染料,因此在電泳過程中或轉膜時可以直接觀察到不同顏色的條帶。預染蛋白Marker方便實驗人員在電泳時、電泳后,以及轉膜后監測電泳情況和估計遷移率。又分為單色預染和多色預染。單色預染Marker通常會利用其中某些條帶加倍濃度來提示其大小,而多色預染Marker用不同的顏色來區別,更易于辨認 。需要注意的是,預染蛋白Marker與染料共價耦聯,所以在不同的緩沖條件下電泳時遷移特性可能會發生某些變化,可能導致一些偏差,因此不太適合精確定位蛋白。

 

abs923預染蛋白Marker(10-245kDa)

 

● 預染發光Western Marker

 

傳統的Western Blot試驗需要使用預染蛋白Marker來跟蹤檢測陽性抗原信號和轉膜效率,但預染蛋白Marker無法在膠片上曝光,曝光信號需要根據膜上的預染蛋白Marker來判斷。absin新品abs90004 預染發光Western Marker由9種發光蛋白和9種預染蛋白組成;9中發光蛋白分別為23、30、36、44、50、62、90、120和160KDa,這些蛋白均可與抗體結合,因此能與抗原在同一張膜上曝出信號,陽性信號可以直接通過Western Marker的位置來判斷;9種預染蛋白分別為15、25、35、40、55、70、100、130和180KDa,其中70KDa為紅色,其他為藍色,轉膜完畢后在膜上肉眼可見。

1)可與抗原同時檢測信號,使Western blot結果判斷更加簡便;

2)發光marker沒有偶聯和標記其他分子,分子量更加準確;

3)綜合發光marker和預染marker的優勢,既能監測轉膜又能與抗原同時檢測。

 

HRP標記的Goat anti mouse IgG二抗(一抗:mouse anti P38)ECL化學發光檢測

 

多重熒光檢測

 

按照分子量又可以將marker分為高分子量、低分子量、寬分子量等。高分子量蛋白Marker是指那些用于檢測大分子量蛋白質的標記,通常包含的蛋白質分子量范圍較高,它們提供的分子量范圍通常從幾十kDa到幾百kDa不等。低分子量蛋白Marker是指用于檢測小分子量蛋白質的標記,通常包含的蛋白質分子量范圍較低,從幾kDa到幾十kDa的分子量范圍。寬分子量蛋白Marker是指覆蓋寬廣分子量范圍的標記,通常包含從低到高多個分子量的蛋白質。

 

4、如何選擇marker?需要考慮什么因素?

 

首先看實驗類型,非變性蛋白需要非變性蛋白marker,變性蛋白則需要變性marker,兩者不可以相互替換,然后看目的蛋白大小,選擇相應的marker,在可選條件下,寬分子量蛋白marker,是不錯的選擇,另外看實驗要求,如果需要在電泳和轉印過程中檢測,需要選擇預染marker,如果需要精確的條帶分子量大小,則需要非預染marker做參考,可以同時使用預染marker和非預染marker,除了以上因素,還需要考慮marker的使用體系,absin常見marker信息如下:

 


類型

非變性蛋白marker

非預染蛋白 Marker

藍色預染蛋白 Marker

多色預染蛋白Marker

預染發光Western Marker

貨號

abs9919

abs9840

abs9511

abs9859

abs922

abs923

abs924

abs90004

分離量范圍

66-669kDa

14.4-97.4kDa

3.3-31kDa

14.4-97.4kDa

10-180kDa

10-245kDa(Tris-glycine-SDS)

10-180kDa

發光蛋白:23-160kDa

預染蛋白:15-180kDa

條帶數量

4

6

5

6

10(10和17可能因為膠濃度原因跑不開)

12

10(10和17可能因為膠濃度原因跑不開)

9

條帶分子量

66、238、440、669

14.4、22、31、43、66.2、97.4

3.3、6.5、14.4、20.1、31

14.4、20.1、31、43、66.2、97.4

10, 17, 25, 33, 43, 55,75, 95, 130,180

11、17、20、25、35、48、63、75、100、135、180、135、180、245(Tris-glycine-SDS)

10, 17, 25, 33, 43, 55,75, 95, 130,180

發光蛋白: 23、30、36、44、50、62、90、120 、 160

預染蛋白: 15、25、35、40、55、70、100、130 、 180

顏色

單色

單色

藍色

藍色

75紅色,25k綠色,其余藍色

25綠色,75橙紅色,其余藍色

72橙色,10綠色,其余藍色,10k條帶在15%以下膠濃度時深綠色

預染蛋白70KDa為紅色,其他為藍色,

推薦凝膠體系

非變性電泳

變性電泳

Tricine SDS-PAGE

Tris-Glycine,Bis-Tris,Tris-Acetate,藍色和綠色條帶表觀分子量無變化,橙色條帶和進口一致

Tris-Glycine,Bis-Tris,Tris-Acetate,藍色和綠色條帶表觀分子量無變化,橙色條帶和進口一致

Tris-Glycine
Bis-Tris MOPS
Bis-Tris MES

Tris-Glycine,Bis-Tris,Tris-Acetate,藍色和綠色條帶表觀分子量無變化,橙色條帶和進口一致

Tris-Glycine,Bis-Tris等

處理

需要考馬斯亮藍染色,不能加熱

需要考馬斯亮藍染色及上樣前沸水浴

無需染色,勿加熱

無需染色、無需加熱

無需染色、直接使用,不要煮沸、稀釋和加入還原劑處理

無需染色、無需加熱

無需染色、直接使用,不要煮沸、稀釋和加入還原劑處理

無需染色、直接使用,不要煮沸




 

非變性蛋白電泳好物推薦


貨號

產品名稱

規格

abs9116

免疫印跡及免疫沉淀用(WB/IP)裂解液

100mL

abs9360

Tris-Glycine電泳緩沖液(10×)

500mL

abs9618

Glass gel預制膠 Tris-Gly 15%, 10wells, 1.5mm

10片/盒

abs9954

非變性非還原性蛋白上樣緩沖液(5×)

1mL×5

abs9919

非變性蛋白 Marker(66-669kDa)

200uL

abs964

考馬斯亮藍染色試劑盒(常規型)

1kit




 

WB好物推薦


 

貨號

產品名稱

規格

樣本處理

abs9346

細胞漿、細胞核及細胞膜蛋白抽提試劑盒

50T

abs9116

免疫印跡及免疫沉淀用(WB/IP)裂解液

100mL

abs9162

廣譜型磷酸酶抑制劑混合物(100×儲液)

1mL

abs9161

廣譜型蛋白酶抑制劑混合物(不含EDTA,100×DMSO儲液)

1mL

蛋白定量

abs9232

BCA蛋白定量試劑盒

500T

配膠試劑盒,各類預制膠(參考前面表格)

上樣與電泳

abs953

上樣緩沖液(2×)

10mL

abs951

電泳液(10×)

100mL

abs923

預染蛋白Marker(10-245kDa)

500uL

轉膜

abs932

PVDF膜(0.45μm)

20張

abs960

NC膜(0.45μm)

20張

abs950

電轉液(10×)

100mL

封閉

abs9175

脫脂奶粉

500g

abs9157

牛血清白蛋白

100g

抗體稀釋與去除

abs954

WB專用一抗二抗稀釋液

100mL

abs967

Western一抗二抗去除液(強堿性)

500mL

顯色與檢測

abs920

ECL化學發光檢測試劑盒

25mL×2




 

 

Absin產品線:

爆款產品:試劑盒(mIHC、IHC、凋亡、ELISA、ChIP、Co-IP、TR-FRET、生化檢測、殘留檢測、多因子檢測);細胞培養(類器官試劑盒+基質膠,胎牛血清+培養添加劑+細胞因子)、分化試劑盒;分子(mRNA合成服務+提取試劑盒);化合物大包裝;輔助試劑、耗材/儀器、定制服務(抗體/多肽/蛋白/標記/檢測)...

特色產品:雞胚提取物CEE、B27、N2、霍亂毒素B亞單位CTB、牛腦垂體提取物BPE、百日咳毒素PTX、重組人胰島素Insulin、人源低密度脂蛋白LDL...

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