液相色譜應用廣泛的是反相色譜，其流動相的優化組合直接關系到分離效果。八十年代二元流動相組成優化依賴于容量因子(k’)的對數值與極性溶劑的摩爾分數關系，根據兩者線性關系，可以估算溶質的保留值。曾有人確定過14種二元溶劑系統的容量因子與流動相的關系。
          Scott,Snyder和Soczeuinski的色譜模型被應用于分離烷基酚和萘酚，使用m Bondapak NH2 固定相，Nurok和 Richard建立了一個簡單的方程來確定溶劑組成的優化，這種方法既可以用于TLC也可以用于HPLC。六種等離子強度溶劑的結合被應用于產生六種三元流動相，用于分離大范圍的化合物，這些混合物的極性通過增加極性溶劑來調節。Zima和Smolkova報道過在碳吸附劑上氨基酸保留值的酸堿效應及離子強度，并且給出一系列方程式預言這些兩性電解質的保留行為。Markl曾將有機磷和硫加入到流動相中可以調整硅膠表面，這些化合物吸附在硅膠表面由于氫鍵作用而改變了選擇性和溶質的保留值。
        Hitachi化學公司用于二甲基乙烯酰胺和二甲基聚丙烯酰胺流動相用無機酸調節PH 2 -6來分析PI2550使用二乙烯苯—苯乙烯作填料。Cole和Dorsey研究過在反相分離梯度洗脫過程中二次平衡保留時間問題，他們發現當加入3％1-丙醇到強溶劑和弱溶劑中去時，二次平衡時間大大縮短。在反相分離過程中，曾有人作過三種研究關于分配過程中熱力學驅動力。Sentell和Henderson研究過C18 相作為溫度和鍵合密度形狀選擇性并且發現低于室溫和高鍵合密度固定相可獲得較好的選擇性，他們建立了范德荷夫座標圖并且指出作為一種功能鍵合密度圖形的差異。
       Gheong和Carr曾使用對于烷基苯在水和4種最普通的有機混合溶劑的一系列無限稀溶液的活度系數的混合物中，觀測其保留過程。他們注意到非極性溶質在飽和的十六烷甲醇溶液中和在純十六烷溶液中測得的活度系數稍微不同，表面積對鍵合的體積比率在鍵合相色譜中至關重要。
      Park等曾利用Kamlet-Tafl溶劑化色譜圖途徑來研究保留過程，他們測得氫鍵給體對甲醇、乙醇、異丙醇、乙腈和四氫呋喃的水溶液的混合物的酸度進而研究單取代酚基于溶劑能量線性關系的保留值。聚合芳香烴的使用作為一種探測保留過程，尤其是對于相關的選擇性引起人們濃厚興趣。這些研究很成功，國際標準和技術協會已公布過這種標準參考材料作為評價反相柱的選擇性，其中有兩種觀點，Sander和Wise[8] 發表過杰出的論文論述選擇性及其評價這種性質途徑。Hoffman和Chang報道過一些溶質溶解在弱極性溶劑中再注射到強極性流動相時峰高和塔板數的增加，vukamanic 等注意到進樣溶劑的選擇能影響峰的完整性，包括產生裂峰和激變峰。已有各種各樣的途徑研究保留值和選擇性。有人曾連續使用同系物摸索選擇性，其它選擇性特征化的方法包括主要成分的分析和利用置換機理對于溶劑的模型吸附到鍵合相中熱力學處理。Kowalska 也利用甲醇—水流動相調整溶質保留值，Kaibara等人則研究過反相固定相同溶質的反應，也有人[9]嘗試過利用UNIFAC 法評價保留值，p－p 鍵反應的作用，用不同的三元溶劑系統計算等強度的流動相，用溶質和流動相分配系數描述溶質保留值，用體積特性參數如粘度、介電常數等關系反相保留值，還有用信息理論和“負熵”描述保留行為。Skelly等開發計算機輔助選擇內標物，可從90種內標物的數據庫中依據保留時間的排列次序擇其所用。
       溶劑化顯色現象尤其利用Kamlet-Talf 公式近年來成為探索色譜保留值時髦的工具。這可從最近連續的報道中可以看出。不管研究流動相還是固定相其氫鍵效應仍然非常重要。Carr研究小組[10]仔細地測量了甲醇、乙腈、2—丙醇和四氫呋喃(THF)水溶液混合物的氫鍵給體酸度并討論了相關的反相色譜保留值。Cheong和Choi[11]認為可以利用線性溶劑化能量關系預言保留值，為了獲得合理的關聯系數在保留值和溶質極性參數之間應排除強氫鍵力的溶質，他們假定可以利用在固定相上殘余氫氧根離子同這些化合物特殊的相互關系做到這點。Carr小組[12] 另外也論述非常有價值的有關ET(30) 溶劑強度的限度，他們指出如果在整個溶劑范圍內即從100％水到100％有機改良劑存在非線性化性，同時也應該再次強調，這也適合于別的單一參數溶劑，包括體積百分數對k’作圖和溶劑強度參數S。三元流動相組成溶劑的選擇性及特性也是人們感興趣的研究內容。Levin 等[13] 提出一種在二元流動相相關實驗基礎上預言三元流動相的保留行為。Dzido 和Eegel-hardt 研究了單取代極性官能團芳香族烴類化合物選擇性的變化，并且解釋了分子形狀大小、溶質和改良劑間的相互關系以及溶劑化絡合物在固定相中先后次序的變化。Heron 和Tchapla[14] 研究了非水介質反相LC的溶劑選擇，發現Kaelble 三角圖比Snyder三角圖更為有效。
       各種各樣的研究有助于我們更好地理解流動相在保留過程中的作用。Chen和Pietrzyk表面選擇性、有效性、線性烷基苯磺酸的分離度能通過流動相離子強度和電解質陽離子的選擇得到提高。Busewski 等[15]研究了流動相組成關于烷基胺相的保留值和選擇性的影響，Seibert 和Poole應用一種溶劑化參數模型使（丙）腈硅烷固定相同甲醇、乙腈、2—丙醇和四氫呋喃流動相的保留性質特征化。流動相添加劑的研究也引起人們關注。McCrossen和Smpson研究戊腈和己腈作為流動相添加劑，發現加入少數的這類物質可引起保留值的明顯變化還能明顯改善有機胺的峰型。McCalley[16] 研究有機溶劑強度對一些基本化合物的峰型影響，發現THF和甲醇比乙腈作流動相有更好的色譜峰，盡管不同溶質的行為有相當大的變化。
       Olesik研究小組的興趣也繼續集中在流動相的“增強流動性”上。當少量的二氧化碳加到傳統的反相色譜流動相時，其粘度減少，擴散系數增大，柱效提高。Lee和Olesik研究了結合升高溫度可進一步增大擴散系數和柱效，Cui和Olesik[17] 報道過應用基礎化學對這些方法的改進，指出除了降低粘度外，二氧化碳也能破壞甲醇—水混合物的氫鍵。
液相色譜流動相的pH值
       采用反相色譜法分離弱酸（3≤pKa≤7）或弱堿（7≤pKa≤8）樣品時，通過調節流動相的pH值，以抑制樣品組分的解離，增加組分在固定相上的保留，并改善峰形的技術稱為反相離子抑制技術。對于弱酸，流動相的pH值越小，組分的k值越大，當pH值遠遠小于弱酸的pKa值時，弱酸主要以分子形式存在；對弱堿，情況相反。分析弱酸樣品時，通常在流動相中加入少量弱酸，常用50mmol/L磷酸鹽緩沖液和1%醋酸溶液；分析弱堿樣品時，通常在流動相中加入少量弱堿，常用50mmol/L磷酸鹽緩沖液和30mmol/L三乙胺溶液。
注：流動相中加入有機胺可以減弱堿性溶質與殘余硅醇基的強相互作用，減輕或消除峰拖尾現象。所以在這種情況下有機胺（如三乙胺）又稱為減尾劑或除尾劑。
液相色譜流動相的濾過：所有溶劑使用前都必須經0.45µm（或0.22µm）濾過，以除去雜質微粒，色譜純試劑也不例外（除非在標簽上標明"已濾過"）。
用濾膜過濾時，特別要注意分清有機相（脂溶性）濾膜和水相（水溶性）濾膜。有機相濾膜一般用于過濾有機溶劑，過濾水溶液時流速低或濾不動。水相濾膜只能用于過濾水溶液，嚴禁用于有機溶劑，否則濾膜會被溶解！溶有濾膜的溶劑不得用于HPLC。對于混合流動相，可在混合前分別濾過，如需混合后濾過，有機相濾膜。現在已有混合型濾膜出售。
液相色譜流動相的貯存：
流動相一般貯存于玻璃、聚四氟乙烯或不銹鋼容器內，不能貯存在塑料容器中。因許多有機溶劑如甲醇、乙酸等可浸出塑料表面的增塑劑，導致溶劑受污染。這種被污染的溶劑如用于HPLC系統，可能造成柱效降低。貯存容器一定要蓋嚴，防止溶劑揮發引起組成變化，也防止氧和二氧化碳溶入流動相。磷酸鹽、乙酸鹽緩沖液很易長霉，應盡量新鮮配制使用，不要貯存。如確需貯存，可在冰箱內冷藏，并在3天內使用，用前應重新濾過。容器應定期清洗，特別是盛水、緩沖液和混合溶液的瓶子，以除去底部的雜質沉淀和可能生長的微生物。因甲醇有防腐作用，所以盛甲醇的瓶子無此現象。