在某些情況下,蛋白質染色的影響可能會干擾后續分析。例如,當需要酶活性時,考馬斯染色;或者當氨基酸的共價修飾會產生虛假結果時,在氨基酸分析之前進行銀染色。在這些情況下,通常使用“導向帶”。引導條是與待分析泳道平行的泳道,包含尺寸標記或重復樣品。凝膠運行后,將導帶剪下并染色,然后與凝膠重新對齊并用作模板來引導條帶切除。該技術很簡單。常見的錯誤是染色后未能用電泳緩沖液重新平衡凝膠。由于許多污漬會導致凝膠收縮或膨脹,重新平衡對于準確和一致的重新調整是必要的。
在引導帶技術中,平行泳道被切除并染色以引導帶切除。
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