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關于固相多肽合成這些雷你都避開了嗎?

來源:岐昱實業(上海)有限公司   2023年08月29日 10:31  
什么是固相多肽合成?



拿著這個問題問問生科和化學的學生們,哪怕自己沒有操作過,很多人也能回答得差不多。畢竟固相多肽合成的出現,極大地催生了相關學科的發展。




現在,一說合成多肽,反應就是用固相多肽合成技術,產率佳,純度高,質量穩定,對環境友好……這個技術的優勢簡直太多了!




也正是因為固相多肽合成如此“好用”,自1920年多肽藥物胰島素問世以來,多肽藥物就重塑了在現代制藥領域的地位。在過去的20多年里,將近有近超過60種多肽類藥物獲得批準。根據一項多肽行業的數據分析,2016年至2024年多肽治療的年增長率將達到9.1%。多肽行業的發展,除了固相多肽合成技術的進步之外,現實的需求也很強勁,比如代謝疾病和癌癥發病率持續增加,需要更多多肽藥物來進行治療。當然,需求大,自然來錢多,治療代謝性疾病的多肽類藥物,例如利拉魯肽(Victoza)和類胰高血糖素肽1(GLP-1)每年至少有20億美元的銷售額[1]。

咱們今天就來聊聊多肽藥物制備的那些事兒。




多肽藥物制備二三事

多肽泛指2~100個氨基酸經肽鍵連接形成的化合物,多肽藥物具有生物活性高,特異性強,副作用小等特點。

從合成角度看,多肽藥物的制備主要有化學合成、基因重組及天然提取三種方法,其中固相化學合成多肽技術擁有產率佳,純度高,質量穩定,環境友好等優勢,被廣泛應用于3~50個序列的多肽原料藥生產。

那么厲害的固相多肽合成,了解一下
多肽的化學合成主要通過以下三種反應:
(1) 有保護基氨基酸的脫保護反應;
(2) 羧基脫保護和氨基酸活化的并行反應-生成加入肽鏈的下一氨基酸;
(3) 偶聯反應-形成酰胺鍵并合成最終的多肽。
在反應(1)中,原料是有保護基的氨基酸;在反應(2)中,需要多種試劑活化氨基酸的羧基。



圖1. 固相多肽合成







無論什么反應,起始原料的純度都至關重要。在多肽固相合成中,原料Fmoc-氨基酸中的雜質主要源于Fmoc基團結合到氨基酸過程中的副反應,有以下三類:




二肽雜質
這類雜質源于在氨基酸上接入Fmoc基團的試劑和已經成形的Fmoc-氨基酸發生副反應。二肽雜質存在會導致目標氨基酸重復插接。



圖2 二肽雜質

β-丙氨酰類雜質
在氨基酸中引入Fmoc基團時,Fmoc-OSu會發生開環和重排,形成β-丙氨酰類雜質。此類雜質存在會導致另一分子的的β-丙氨酸殘基(B)或β-丙氨酸(A)取代目標氨基酸插接到肽段



圖3 β-丙氨酰類雜質

游離氨基酸雜質
游離氨基酸源于氨基酸與Fmoc試劑的不反應。游離氨基酸存在會導致多個目標氨基酸重復插接肽鏈,導致Fmoc基團在Fmoc-氨基酸衍生物儲存過程中自動催化裂解。

毫無疑問,這些雜質都會大大降低固相多肽合成的產率和純度,增大提純難度。

多肽合成中的“隱藏殺手”:乙酸
相比于氨基酸骨架的雜質,乙酸則更像是固相多肽合成的“天敵”。由于分子量小且也會被活化劑活化,具有高反應活性,即便痕量乙酸也會在固相合成過程中截斷延伸的肽鏈。

有很多人覺得一點點乙酸,無關緊要。那咱們來做個數學題:




Fmoc-Arg(Pbf)-OH受到低至0.1%的乙酸污染,就相當于1mol%的乙酸污染。但如果考慮到通常試劑用量會超出5倍,而高反應活性乙酸會先于氨基酸與肽段結合,則每次循環會造成高達5%的鏈終止。如果合成的多肽含有3%的精氨酸殘基,則意味著15%的鏈會終止。



圖4 乙酸對合成多肽的影響

下圖是實例展示。僅僅0.1%的乙酸污染對于21 mer多肽合成的影響;截斷的副產物采用“*”表示。



圖5 含有乙酸合成多肽的HPLC譜圖

Fmoc-氨基酸中的乙酸很難檢測,默克專門開發了標準Fmoc-氨基酸中乙酸定量的方法。

跟所有工業產品一樣,氨基酸原料的純度也存在批次差異。這里有個規律,純度越高,差異性就越小。




多肽批次間差異




談完原料,可以說說多肽了。




序列相同的多肽,不同批次間存在差異,這個無法避免。序列不同的多肽,本身的性質也有差異,比如聚集 – 疏水性多肽的濃度越高,聚集也越高,活性主要取決于聚集形態下的活性。




此外,穩定性也很重要。多肽在儲存過程中會有化學轉變。比如含有Asp-Gly的多肽導致形成iso-Asp,多肽中的Cys通過形成二硫鍵而交聯以及Met氧化成亞砜和焦谷氨酸形成。這些雜質有可能帶有細胞毒性,比如二硫蘇糖醇(DTT)。




除了純度之外,多肽的穩定性跟儲存有關,凍干狀態常比溶液更穩定;再一個影響穩定性的因素就是氨基酸組成和序列,所謂sequence depends!




下面是幾個典型的組成和序列導致的穩定性降低。

水解:含Asp (D)的多肽的常見問題。含有Asp-Pro (D-P)或Asp-Gly (D-G) 組合的多肽容易脫水,形成環狀亞胺中間體。另外,含有Ser (S) 的序列也可能形成可切割肽鏈的環狀亞胺中間體。




氧化:Cys (C)和Met (M)殘基是發生可逆氧化的主要氨基酸。甲硫氨酸殘基發生氧化后形成甲硫氨酸亞砜和/或甲硫氨酸砜,很難逆轉。




二酮和焦谷氨酸形成:二酮形成通常發生在甘氨酸(G)位于N末端第3位點時,Pro (P)或Gly (G)位于第1或第2位點時更易發生。如果Gln (Q)位于序列的N末端位點,則焦谷氨酸形成幾乎是不可避免的。這種轉變也可能發生在N末端位點含有Asn (N)的多肽序列中,但可能性較小。




歸根到底,想要高質量的多肽產品,就一定需要高品質的原料和試劑。





END






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