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培養基，是指供給微生物、植物或動物（或組織）生長繁殖的，由不同營養物質組合配制而成的營養基質。一般都含有碳水化合物、含氮物質、無機鹽（包括微量元素）、維生素和水等幾大類物質。培養基既是提供細胞營養和促使細胞增殖的基礎物質，也是細胞生長和繁殖的生存環境。
1、天然培養基；天然培養基是指一類利用動物、植物或微生物體包括其提取物制成的培養基。例如。牛肉膏蛋白胨培養基、麥芽汁培養基和LB培養基等。常用的天然有機營養物質包括豆芽汁、玉米粉、土壤浸液、麩皮、牛奶、血清、椰子汁等。天然培養基成本較低，除在實驗室經常使用外，也適于用來進行工業上大規模的微生物發酵生產。
2、組合培養基合成培養基是根據天然培養基的成分，用化學物質模擬合成、人工設計而配制的培養基。例如，高氏1號培養基和查氏培養基等。合成培養基有一定的配方，配制合成培養基時重復性強，但與天然培養基相比其成本較高，微生物在其中生長速度較慢，一般適于在實驗室用來進行有關微生物營養需求、代謝、分類鑒定、生物量測定、菌種選育及遺傳分析等方面的研究工作。
3、半組合培養基指一類主要以化學試劑配制，同時還加有某種或某些天然成分的培養基。例如，馬鈴薯蔗糖培養基。
微生物分類
選擇性培養基：一類根據某微生物的特殊營養要求或其對某化學、物理因素的抗性而設計的培養基，具有使混合菌樣中的劣勢菌變成優勢菌的功能，廣泛用于菌種篩選等領域。
鑒別培養基：一類在成分中加有能與目的菌的無色代謝產物發生顯色反應的指示劑，從而達到只須用肉眼辨別顏色就能方便的從近似菌落中找出目的菌菌落的培養基。例如，伊紅美藍乳糖培養基（EMB）。
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