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色譜更穩定的保留，更好的分離效率以及更加對稱的峰形都離不開柱溫箱的幫助。通常來說，色譜分析過程是利用流動相中的樣品和固定相的結合-分離差異來使得分離物質的目的達到。結合-分離過程會受到溫度的影響，因此溫度會對分析過程產生影響。柱溫的改變會影響分離度和峰形。
色譜柱溫度控制在高效液相色譜分析系統中有著越來越高的要求，藥典和很多新的分析方法對于柱溫也給出條件，因為色譜柱的使用溫度能夠由色譜柱恒溫箱(液相色譜柱柱溫箱)精確、穩定的控制，其對于反壓的降低，保留時間的縮短，色譜峰的分離度的改善以及色譜柱的柱效的提高，從而使分析樣品結果的重復性得到保證的作用不可忽視，使其變成液相色譜儀的重要配套裝置。
使用柱溫箱有哪些好處？
1.溫度低的時候，由于流動相黏度增加而延長了檢測時間，同時使泵的磨損增加了，對設備的使用壽命產生了影響。
2.當溫度比較低的時候，還由于溶解度相對下降而有緩沖鹽結晶出現，導致泵進樣閥、管道、色譜柱被堵塞。
3.當溫度比較低的時候，還由于降低了溶解度，而在填料上吸附了雜質，洗脫困難，從而對色譜柱的使用壽命產生影響。到目前為止，暫時還沒有比較好的方法來對流動相溫度進行控制。就算在整個室內使用空調，保持流動相的溫度相同也比較困難，所以，到目前為止，控制柱溫是Z常被采用的方法。使用柱溫箱有著比較低的能耗以及比較高的控溫精度，為液相色譜儀所需的輔助設備,藥品標準中,有不少品種對柱溫也有明確要求。
4.能夠保持保留時間的相對恒定，能夠使需要進行的定性鑒的可信度得以提高。
5.定量的進行是基于保留時間的相對恒定，如果保留時間不一樣，不但不可以對其成分的一致性進行判斷，與此同時，因為不一樣的保留時間，也會改變峰面積，使得檢測結果的可信度降低。
6.當存在比較大的溫度差的時候，由于保留時間不穩定，將會使得檢測工作的麻煩增加。
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