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核酸提取儀，是應用配套的核酸提取試劑來自動完成樣本核酸的提取工作的儀器，核酸提取儀分為兩類:一類是大型的自動化的，一般稱為自動液體工作站;另一類是小型自動核酸提取儀，利用封裝好的配套試劑自動完成提取純化過程。
目前市場上面的核酸提取儀的種類比較多，如何選擇到自己心儀的儀器需要你在市場上面進行一些比較：
1. 根據儀器型號大小不同劃分
1) 自動液體工作站
自動液體工作站是功能非常強大的設備，液體分液、吸液等自動完成，甚至能通過整合擴增、檢測等功能，實現標本提取、擴增、檢測全自動化。提取核酸只是其功能的一個應用，不太適合常規實驗室提取核酸，一般都應用在單一類標本并且一次提取標本量非常大(至少96個，一般幾百個)的實驗需求上。自動工作站的平臺建立及平臺的運作，需要比較大的資金。
2) 小型自動核酸提取儀
小型的自動化儀器是通過運行結構的特殊性來達到自動提取核酸的目的，可以在任何實驗室得到應用。
2. 根據提取原理不同劃分
1) 采用離心柱法的儀器
離心柱法核酸提取儀主要采用離心機和自動移液裝置相結合的方法，通量一般在1-12個樣本，操作時間和手工提取差不多，并不能提高實際工作效率，且價格昂貴，不同型號儀器的耗材也不能通用，僅適合經費充足的大型實驗室使用。
2) 采用磁珠法的儀器
以磁珠為載體，利用磁珠在高鹽低PH值下吸附核酸，在低鹽高PH值下與核酸分離的原理，再通過移動磁珠或轉移液體來實現核酸的整個提取純化過程。所以可設計成很多種通量，既可以單管提取，也可以提取8-96個樣本，且其操作簡單快捷，提取96個樣本僅需30-45min，大大提高了實驗效率，且成本低廉，因而可以在不同實驗室使用，是目前市場上的主流儀器。
磁珠法自動核酸提取儀又分為磁棒法和抽吸法
先說抽吸法：顧名思義，抽吸法就是通過自動移液裝置來進行，通過自動移液裝置來加入裂解液、磁珠吸附；抽走裂解液，加入漂洗液，磁珠吸附，抽走漂洗液，加入洗脫緩沖液。從步驟上好像沒什么問題，但是抽吸法最大的問題在于，為了在去除廢液的時候不抽走磁珠，移液器不能靠磁珠太近，以防磁珠連同廢液被抽掉，這樣每一次抽廢液的時候總有一小部分不能全部的抽走，特別是磁鐵在底部的裝置，因為磁珠被磁鐵吸附在底部，所以移液器不能靠底部太近，這樣漂洗液就不能全部去除，殘留的漂洗液中的鹽和乙醇會影響后面的洗脫效率和PCR成功率；磁鐵在側面的裝置殘留的液體會少些，但是洗脫的效率也不好，依靠DNA自行溶解到洗脫緩沖液中，除非等上半小時以上，所以有些96自動核酸提取工作站，提取一輪的時間需要150分鐘，32磁棒法的同樣的時間可以提5輪了。
再說磁棒法核酸提取儀：通量通常有8、16、32、96通道，相對于抽吸法，磁棒法的優點是每一步的液體不殘留，因為磁棒只帶走磁珠，轉移到下一個步驟相應的反應孔中，另外選擇磁棒法的提取儀器最好要功能更齊全的，比如可以加熱，每個加熱槽最好獨立溫控，這樣可以設置加熱、裂解、洗脫的不同溫度，另外很重要的一點是，帶動磁棒的電機要能帶動磁棒進行液體的快速混勻和攪拌，這樣才有利于自動化和有助于裂解和漂洗干凈。磁棒法的通量選擇最好是32通道，96通道的看似通量更高，但是有個很現實的問題，96個磁力棒在從一個板轉移至另外一個板的時候，磁力棒上面的液體中途滴下來怎么辦，它會滴到別的孔中造成污染，而32通道的磁力棒運行軌跡不經過其他樣本的上空，這樣不會交叉污染。
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