圖 1:穩定 假設的膜蛋白在合成納米盤中的示意圖。在圖例中,是使用 SMA 作為穩定聚合物,但DIBMA也能起到這樣的作用。
合成納米盤是納米盤領域的第二大選擇。它們在某些關鍵點與 MSP納米盤不同,但也存在某些相似之處。
合成納米盤的制備
與MSP納米盤的三種制備方式(微信公眾號“德國庫柏生物”查閱系列文章:什么是納米盤Nanodisc?)相比,合成納米盤只能直接從完整細胞中提取。在此過程中,使用的合成聚合物具備雙重功能。首先,它溶解細胞膜,類似于去污劑。然后,使用天然細胞磷脂在膜蛋白周圍形成納米盤結構。這一過程可類比成曲奇成型刀,即通過沖壓加工,將曲奇與面團分離。
尺寸
合成納米盤的尺寸是可變的。決定合成納米盤直徑的主要因素是納米盤包圍和穩定的膜蛋白復合物的尺寸。因此,對于合成納米盤,無法給出確定的尺寸。但是,合成納米盤的尺寸范圍包含在MSP納米盤的尺寸范圍之中(表 2)。這適用于迄今為止所有已確定的聚合物。若合成納米盤復合物需要均勻的納米盤尺寸,則必須采用諸如Rho1D4-tag等類似的親和層析法對穩定后的目標膜蛋白進行純化,然后再采用排阻層析(SEC)法對納米盤尺寸進行處理。
采用哪種聚合物?
有越來越多的聚合物可用于合成納米盤。每種聚合物都有其自身的優缺點。例如,DIBMA可以吸收波長為280 nm的光,與蛋白質類似。同時,AASTY與其他聚合物相比,具有相當固定的納米盤直徑范圍。
圖2:DIBMA 與 SMA 看起來似乎可以互換,但實際上還是存在一些差異的。
選擇膜支架蛋白(MSP)還是合成納米盤?
那么,最后的問題仍然是哪種類型的納米盤適合您的項目?MSP 及合成納米盤都旨在通過模擬細胞膜環境來實現膜蛋白的增溶和穩定。但是,如前所述,二者之間存在著一些關鍵性差異。表 1 列出了所有差異及其各自的優缺點。
表 1:MSP 與合成納米之間的直接比較。
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