這是微納立方第32篇微流控推文。
Bavli等人基于液滴微流控技術,研發了一種名為“CloneSeq”的高靈敏單細胞分析平臺,可用于3D細胞培養的全面表征,揭示了新的癌癥特異性亞群的存在,并于2021年在Dev. Cell期刊發表論文(影響引子12.861,論文鏈接見文末)。
(科學家和他們的微流控實驗平臺:為了實現穩定又精確的微流體控制,獲取誤差最小的數據,他們采購了幾十個法國Fluigent的壓力泵、流量計和旋轉閥等部件,搭建了一套通用型微流控綜合實驗平臺)
Bavli等人的實驗大致可分為兩步:
第1步,在3D水凝膠中完成單細胞的封裝,并進行克隆擴增,流速范圍為8至34μL/min,每秒生成700個水凝膠微球。
(水凝膠單細胞封裝方案示意圖)
(單細胞封裝與克隆示意圖)
第2步,進行克隆分析,作者設計了另一種微流體方案來捕獲微滴中的克隆,并使用InDrops protocol對其進行條碼化。
(InDrops protocol的微流體方案)
(捕捉到的圖像:Single Clone和Barcode Bead被封裝于同一微滴)
實驗完成后,作者使用Fluigent十轉一閥門M-Switch清洗方案,自動完成實驗儀器和管路的清洗。
論文:Bavli, D. et al. CloneSeq: A highly sensitive analysis platform for the characterization of 3D-cultured single-cell-derived clones. Dev. Cell (2021).
DOI: 10.1016/j.devcel.2021.04.026
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