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制備液相色譜是使用制備色譜柱從混合物中提取目標化合物的一種分離純化技術。與其他的色譜分離方法，如薄層色譜法相比，現代制備液相色譜法具有柱效高、分離速度快等特點，是制備純化天然產物和化學合成產物的很好手段。
制備色譜常用的色譜模式有低壓，中壓，高壓三種，以應對不同類型和不同純度要求的樣品的分離，同時盡可能減少成本。
低壓：一般而言，低壓適合易分離化合物，但分離時間長很容易造成敏感化合物分解。
中壓：中壓一般采用恒流泵提供恒定的流動相流速，填料顆粒更小，分辨率更高，耐受更高壓力和更快流速，同時操作與低壓和Flash基本一致。
高壓：高壓通常在分離制備的最后階段采用，應用于分離困難的樣品，純度甚至能達到99.9%。
實驗室級別的制備液相色譜主要用于以下領域：
1.天然藥物化學、中藥化學。這是國內目前廣泛的使用方法，為了弄清楚植物中的微量有效成分，開放手工色譜柱早已不夠用了，幾乎每個搞天然藥化的實驗室都至少有一臺液相，土豪實驗室人手一臺液相。
2.蛋白純化。相對于前者，蛋白純化的起步要稍微晚一點，但是發展很迅速。同時，由于外國儀器廠家在這個領域的優勢不算太大，目前國內也在這個領域加快發展，搶占地盤。
3.藥物雜質純化。由于合成工藝并不能做到100%的產率，往往伴有副產品，如何獲得微量的雜質并確定結構和含量，這就得靠液相色譜。
4.手性化合物的制備。這個主要是有機合成和方法學的在用。
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