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柱壓過高是液相色譜在使用過程中較常出現的問題，指的是壓力突然升高，一般都是由于流路中有堵塞的原因。此時，我們應該分段進行檢查。
1、先斷開真空泵的入口處，此時PEEK管里充滿液體，使PEEK管低于溶劑瓶，看液體是否自由滴下，如果液體不滴或緩慢滴下，則是溶劑過濾頭堵塞。
處理方法：用30%的硝酸浸泡半個小時，在用超純水沖洗干凈。如果液體自由滴下，溶劑過濾頭正常，再檢查;
2、打開Purge閥，使流動相不經過柱子，如果壓力沒有明顯下降，則是過濾白頭堵塞。
處理方法：將過濾白頭取出，用10%的異丙醇超聲半個小時。如果壓力降至100 PSI(6.7 Bar)以下，過濾白頭正常，再檢查;
3、把色譜柱出口端取下，如果壓力不下降，則是柱子堵塞。
處理方法：如果是緩沖鹽堵塞，則用95%的水沖至壓力正常。如果是一些強保留的物質導致堵塞，則要用比現在流動相更強的流動相沖至壓力正常。假如按上面的方法長時間沖洗壓力都不下降，則可考慮將柱子的進出口反過來接在儀器上，用流動相沖洗柱子。這時，如果柱壓仍不下降，只有換柱子入口篩板，但一旦操作不甚，很容易造成柱效下降，所以盡量少用。
液相色譜儀日常的維護與保養：
1、儲備液（流動相） 首先要使用HPLC級的溶劑和試劑，同時要保持流動相儲存液的清潔，特別是儲液器內的過濾頭要定期清洗，必要時進行更換。在使用含有緩沖鹽的流動相后一定要時進行相應比例的水和有機溶劑進行充分的沖洗。正反相流動相相互交換時要用互溶的中性溶劑進行中介替換。另外：流動相不可長期儲存，要用多少配多少以防生長微生物和組分改變。
2、泵 泵內的密封圈、單向閥、柱塞桿及在線過濾器都是易磨損的部件，特別是密封圈的損壞可引起系統的許多故障。所以有人建議定期更換但也不能一概而論，要看墊圈的材料質量，使用壓力的大小以及緩沖液用后的處理情況而定。
3、進樣系統 對進樣器首先注意嚴禁用尖針頭的針進樣，以防劃壞轉子密封墊。另處使用后要充分清洗進樣器，將進樣器內沉積的樣品以及無機鹽清洗干凈。對自動進樣器要定期對針定量環和進樣密封墊進行清潔，更換以保證進樣量的準確一致。
4、色譜柱 在色譜柱的使用中要注意：①輕拿輕放以防破壞柱內固定相的粒子。②在柱前安裝預柱，防止柱污染，延長色譜柱的使用壽命。③最大限壓不要設的太高，防止柱壓力過高沖擊過大。④使用的溶劑要符合色譜柱使用的各種要求。
5、檢測器 首先要保證檢測池的清潔，不僅每天用后要對檢測器進行充分的沖洗，而且還要定期的用強溶劑反向沖洗檢測池。另外，檢測器用的燈是有一定壽命的，在清洗泵等其它不用檢測器時可將檢測器關上。使用脫過氣的流動相，防止池內進入氣泡。
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