qPCR軟件報錯了?別慌,這篇文章會給你答案!
在運行qPCR實驗或分析數(shù)據(jù)時,有時候會遇到軟件報錯,在這里列舉了Applied BiosystemsTM 品牌儀器軟件的常見報錯,分析了可能的原因和解決辦法,如果您正在使用我們的儀器,希望本文能給您提供一些解決軟件報錯問題的思路。
一、通用報錯(多款機型軟件均可能出現(xiàn))
1. 打開數(shù)據(jù)分析軟件報錯:java.lang.IIIegalArgumentException: One of the raw spectra is null。點擊OK接受后,擴增曲線是空白(如圖stepone plus軟件)。
1,問題分析:
可能是單次數(shù)據(jù)異常,導致校正文件丟失。在軟件上點擊Analysis > override calibration > Use another calibration file 下選擇同儀器相同類型實驗文件做校正 ,重新分析后可以恢復正常數(shù)據(jù)。出現(xiàn)該報錯的原因可能是雙擊了start run, 或者分析/保存數(shù)據(jù)過程被中斷,例如分析/保存過程中關閉軟件或拔出U盤。
2. 打開數(shù)據(jù)分析軟件報錯:Analysis cannot proceed: not enough sample definded(如圖stepone plus軟件,此報錯僅限stepone,stepone plus,7300 plus,7500 v2.0以上版本軟件)。
2,問題分析:
plate setup步驟未給樣品孔設置sample信息,設置好sample信息后重新分析,數(shù)據(jù)可以恢復正常。
3. 打開數(shù)據(jù)分析軟件報錯:Analysis cannot proceed: not enough targets definded(如圖stepone plus軟件,此報錯僅限stepone,stepone plus,7300 plus,7500 v2.0以上版本軟件)。
3,問題分析:
plate setup步驟未給樣品孔設置target信息,設置好target信息后重新分析,數(shù)據(jù)可以恢復正常。
4. 打開數(shù)據(jù)分析軟件報錯:Analysis failed due to: GExSession doesn't exist in context。點擊OK 接受后,擴增曲線是空白(如圖stepone plus軟件)。
4,問題分析:
擴增循環(huán)階段未采集信號,需要打開信號收集標識。
5. 在多重反應程序設置中,給樣品孔添加ROX作為reportor 的探針時,報錯:Dye "ROX" already used in passive reference(如圖Q5軟件)。
5,問題分析:
儀器默認passive reference選擇ROX作為參比熒光,如果實驗中ROX是作為探針的報告基團,則需要將passive reference改成None,之后就可以在target設置中選擇ROX作為探針了。
6. 打開數(shù)據(jù)分析軟件報錯:The selected file cannot be opened, cannot open the file because file contents are not recognized(如圖Q5軟件)。
6,問題分析:
可能的原因包括:
1. 通過導入文件(import plate setup)在實驗中添加了重復的樣本,使用了相同的sample name,建議編輯樣品名稱時不要使用相同的sample name 命名樣品。
2. 實驗名稱包含不合要求的字符,例如空格,括號等,建議實驗名稱不要使用不符要求的字符。
3. 文件受損,數(shù)據(jù)不完整,建議儀器運行過程中不要操作軟件。
4. 拷貝數(shù)據(jù)的U盤有故障,導致拷貝數(shù)據(jù)不完整,建議更換U盤重新拷貝數(shù)據(jù)。
二、7500報錯
7500-1. 運行程序時報錯:1404 Hold duration too short for read。
7500-1,問題分析:
數(shù)據(jù)采集時間太短,PCR循環(huán)階段data collection step 時間設置不小于31秒,melt curve 階段data collection step請勿修改。
7500-2. 運行程序時報錯:Java Platform SE Binary has stopped working,實驗中斷。
7500-2,問題分析:
如果通過直接雙擊已保存的edt模板文件去運行實驗程序,可能會出現(xiàn)報錯。建議先打開7500軟件,通過New Experiment > From Template導入edt文件進行實驗。
7500-3. 點擊start run時報錯"The instrument type for the experiment is not compatible with the connected instrument"。
7500-3,問題分析:
實驗中選擇的儀器類型與實際使用的儀器不符,需要到Setup界面重新修改為正確的儀器類型。
7500-4. 程序設置報黃色提醒 "number of data collection points is not valid"
7500-4,問題分析:
運行程序設置了多個信號采集點,定量實驗中只能設置一個信號采集點,可以設置在cycling stage 。
7500-5. eds文件導入PTS軟件,報錯"cannot import any experiment file(s) because of the following error(s): "
7500-5,問題分析:
使用7500 v2.4版本軟件產生的數(shù)據(jù)與PTS軟件不兼容,可以將eds數(shù)據(jù)先用7500 v2.3的軟件打開,分析后保存,然后再導入PTS軟件。
三、Q3/5報錯
Q35-1. 數(shù)據(jù)打開后擴增曲線是空白,點擊Analyze分析后報錯:The analysis cannot proceed because the experiment is missing required plate setup information. Go to 'Define' and 'Assign' page to creat and assign targets and samples. 點擊OK接受后,擴增曲線仍是空白。
Q35-1,問題分析:
plate setup步驟未給樣品孔設置target或者sample name信息,設置好target或者sample name信息后重新分析,數(shù)據(jù)可以恢復正常。
Q35-2. 運行PTS實驗報錯:Star run validation: The filter set has not been selected for following target: ROX(x4-m4)。
Q35-2,問題分析:
含melt curve的實驗程序中,軟件默認melt curve filter只選擇X1M1,PTS實驗需要從軟件進入Method-action-optical filter settings, 在melt curve filter選項中將x4m4選中(Q5也可以嘗試x1m3)。
Q35-3. 打開數(shù)據(jù)分析軟件報錯:Analysis failed due to insufficient data。
Q35-3,問題分析:
4.3之前版本的軟件有bug, 部分染料法實驗結果擴增曲線是空白,解決方法是在analysis setting 點擊apply,即可恢復正常顯示。1.4.3之后的軟件版本無此問題。
四、stepone/stepone plus 報錯
Step0ne-1. 開始運行實驗前報錯:You must first download experiment"XXX"before you can start another run on this instrument.
stepone-1,問題分析:
上次運行實驗沒有正常傳輸?shù)诫娔X端,需先將上次實驗數(shù)據(jù)下載到電腦然后才能開始運行。在軟件上點擊Instrument > Download Experiment from Instrument下載數(shù)據(jù)后,即可重新開始運行試驗。
stepone-2. 打開數(shù)據(jù)點擊analyze分析軟件報錯:Cannot calculate Pure Dye Matrix。
stepone-2,問題分析:
該報錯指示運行結果文件中有原始數(shù)據(jù)丟失,可能是實驗程序沒有運行結束或在運行過程中被終止所導致。例如客戶將反應程序最后一步設置為infinite holding stage,最后通過點擊STOP結束程序容易導致該問題。針對這樣的數(shù)據(jù),可以聯(lián)系技術支持尋求幫助。
stepone-3. 查看熔解曲線時出現(xiàn)黃色報錯:No derivative curve for all selected wells due to excessive noise in fluorescence data.
stepone-3,問題分析:
熔解曲線程序設置錯誤,如下圖中數(shù)據(jù)誤刪掉了60度的步驟,設成了95度升溫到95.3度。建議使用SYBR Green染料法做實驗時,不要修改熔解曲線步驟,使用儀器默認程序即可。
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