41、跑電泳的時候配的膠總是“縮”是什么原因呢?是有的成分不對嗎?
答:沒什么問題,就是你膠里的水分被蒸發了。過夜時拿保鮮膜包起來,在里面加點水保持濕度就可以了;也可能母液(30%聚丙酰胺)有問題,你可以重新配制一份觀察;能夠替換的試劑,盡量換一下,選用好的試劑。
42、蛋白質的分子量跨度很大,如要分離小21KD,中至66KD,大至170KD,可以一次做好嗎?
答:這么廣的分布不好轉移,一般建議:21kd和66kd可以一起轉,12%SDS-PAGE, 濕轉120mA, 45-60min就可以了, 可以根據你實驗室的經驗調節;170kd 用7%SDS-PAGE,200mA 90-120min。
43、不能很好地將大分子量蛋白轉移到膜上, 轉移效率低怎么樣解決?
答:可以考慮:轉移緩沖液中加入20%甲醇(是指終濃度),因為甲醇可降低蛋白質洗脫效率,但可增加蛋白質和PVDF膜的結合能力,甲醇可以防止凝膠變形,甲醇對高分子量蛋白質可延長轉移時間;轉移緩沖液加入終濃度0.1%SDS,也是為了增加轉移效率;用優質的轉移膜,或使用小孔徑的PVDF膜(0.2微米)。
44、我用的是可視marker,但是電泳總跑不全8條帶,請問什么原因?怎樣改善?膠用過8%,10%,12%,都是這樣。marker是新買的。
答:一般來說,是小分子量Marker跑走了,增加膠濃度或減少電泳時間試試看。當然梯度膠也是不錯的選擇。
45、是否Western Blot實驗半定量一定要加ACTIN內參?
答:半定量實驗需要有內參。
46、核內抗原Western Blot內參選擇什么合適?
答:可以選用組蛋白,組蛋白在細胞核中的表達是很穩定的,有很多都可以當成內參,在網上查查就可以選出你要的內參。
47、做半定量Western Blot,內參β-actin,GAPDH哪個好?
答:兩者均可。
48、想問一下細胞裂解液選擇蛋白酶抑制劑時有什么原則嗎?受不受組織來源的影響?胞膜和胞漿有區別嗎?
答:一般來說提取時加入廣譜的蛋白酶抑制劑就可以了,操作時保持低溫。除非有文獻特別指明用特殊的方法,一般來說都沒有區別。
49、轉膜后的脫脂奶粉封閉液是5%的TBST脫脂奶粉”,其中TBST最后那個T是Tween嗎,濃度多大?
答:是Tween,配方如下:Tris-Buffered Saline Tween-20 (TBST), NaCl:8g, Tris base:2.42g 加水 800ml溶解, 加 500-1000ul 的 Tween-20, 用HCl 調節pH 至 7.4, 加水定容至 1L。
50、封閉,一抗,二抗時的溫度有沒有什么規定呢,比如在室溫里做,或者要在4度下?
答:均可在室溫進行,如果時間不夠,一抗孵育可以先在室溫進行一個小時,然后4度過夜。
51、請問一下PVDF膜和硝酸膜結合蛋白的原理是什么?
答:一般而言,硝酸纖維素膜是通過疏水作用來和蛋白質相聯,這樣的話,反復洗幾次后,蛋白容易掉下來,結果較差。PVDF膜主要通過它膜上的正電荷和蛋白接合,同時也有疏水作用,但相對較弱。這樣的話,PVDF膜和蛋白接合較牢,不易脫落,結果較好。
52、怎樣才能把膠跑的非常漂亮,泳道都能很直,上樣的量和灌膠是否很重要,電壓有什么要求?
答:影響跑膠跑的質量,有以下幾個因素:
(1)電壓,小的電壓會使膠的分子篩效應得到充分發揮。電壓越小,條帶越漂亮,濃縮膠55v,分離膠75v就能跑得很好。
(2)膠的均勻度,膠越均勻,條帶越窄,分離越均勻。倒膠之前,一定要充分混勻,玻璃板一定要干凈,雙蒸水隔離時,一定要比較輕地加上去,避免稀釋上層的分離膠.
53、為什么提高大分子量蛋白的轉移的時候,小分子量蛋白會丟失一些哪?什么原因?
答:小分子的蛋白在轉移過程中,會透過膜去,所以大分子的上去以后,有一部分小分子的就透過去了。
54.電泳中常出現的一些現象:
●︶ 條帶呈笑臉狀
原因:凝膠不均勻冷卻,中間冷卻不好; 電泳系統溫度偏高。
●︵ 條帶呈皺眉狀
原因:可能是由于裝置不合適,特別可能是凝膠和玻璃擋板底部有氣泡,或者兩邊聚合不*。
●拖尾
原因:樣品溶解不好。
●紋理(縱向條紋)
原因:樣品中含有不溶性顆粒。
●條帶偏斜
原因:電極不平衡或者加樣位置偏斜。
●條帶兩邊擴散
原因:加樣量過多。
55.Western blot結果中背景較高
可能的原因及建議:
●膜封閉不夠
延長封閉的時間;選擇更加適合的封閉液。
●一抗稀釋度不適宜
對抗體進行滴度測試,選擇最適宜的抗體稀釋度。
●一抗孵育的溫度偏高
建議4℃結合過夜。
●選擇的膜容易產生高背景
一般硝酸纖維素膜的背景會比PVDF膜低。
●膜在實驗過程中干過
實驗過程中要注意保持膜的濕潤。
●檢測時曝光時間過長
減少曝光時間。
56.Western blot結果中雜帶較多
可能的原因及建議:
●目的蛋白有多個修飾位點(磷酸化位點、糖基化位點、乙酰化位點等),本身可以呈現多條帶。
查閱文獻或進行生物信息學分析,獲得蛋白序列的修飾位點信息,通過去修飾確定蛋白實際大小。
●目的蛋白有其它剪切本
查閱文獻或生物信息學分析可能性。
●樣本處理過程中目的蛋白發生降解
加入蛋白酶抑制劑;樣本處理時在冰上操作。
●上樣量過高,太敏感
適當減少上樣量。
●一抗特異性不高
重新選擇或制備高特異性的抗體。
●一抗不純
純化抗體
●一抗或者二抗濃度偏高
降低抗體濃度。
57 . Western blot結果中無信號或顯示信號弱
可能的原因及建議:
●檢測樣本不表達目的蛋白
選擇表達量高的細胞作為陽性對照,用于確定檢測樣本是否為陰性。
●檢測樣本低表達目的蛋白
提高上樣量,裂解液中注意加入蛋白酶抑制劑。
●轉移不*或過轉移
可以用麗春紅染膜并結合染膠(考馬斯亮藍)后確定條帶是否轉至膜上或轉移過頭;適當調整轉膜的時間和電流。
●抗體不能識別測試種屬的相關蛋白
購買抗體前應當認真閱讀抗體說明書,確定其是否能夠交叉識別測試種屬的對應蛋白。
●一抗孵育時間不足
建議4℃結合過夜。
●二抗與一抗不匹配
選擇針對一抗來源的種屬的抗體。
●洗膜過度
洗膜時間不宜過長,加入的去垢劑不宜過強或過多,建議使用0.1%的弱去垢劑Tween-20。
58. 其它現象:
●膜上多處出現黑點或黑斑
原因:抗體與封閉試劑發生非特異性的結合。
●反白(條帶顯白色)
原因:目的蛋白含量太高或者一抗濃度偏高。
●蛋白分子量偏低或偏高
原因:膠濃度不適合,高分子量要用低濃度膠;小分子蛋白要用高濃度膠。
59.安全問題:
操作有毒試劑時,帶手套,且操作揮發性試劑應在通風櫥中進行。
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