實時熒光定量PCR
定量PCR已經(jīng)從基于凝膠的低通量分析發(fā)展到高通量的熒光分析技術(shù),即實時定量PCR。實時熒光定量PCR技術(shù)于1996年推出,由于該技術(shù)不僅實現(xiàn)了PCR從定性到定量的飛躍,而且與常規(guī)PCR相比,它具有特異性更強、有效解決PCR污染問題、自動化程度高等特點。實時定量PCR (real-time quantitative PCR)是指在PCR指數(shù)擴增期間通過連續(xù)監(jiān)測熒光信號強弱的變化來即時測定特異性產(chǎn)物的量,并據(jù)此推斷目的基因的初始量,不需要取出PCR產(chǎn)物進行分離。目前實時定量PCR作為一個極有效的實驗方法,已被廣泛地應用于分子生物學研究的各個領(lǐng)域。
實時熒光定量PCR 技術(shù)的主要應用:
1. DNA 或RNA 的絕對定量分析:包括病原微生物或病毒含量的檢測,轉(zhuǎn)基因動植物轉(zhuǎn)基因拷貝數(shù)的檢測,RNAi 基因失活率的檢測等。
2. 基因表達差異分析:例如比較經(jīng)過不同處理樣本之間特定基因的表達差異(如藥物處理、物理處理、化學處理等 ),特定基因在不同時相的表達差異以及cDNA 芯片或差顯結(jié)果的確證。
3. 基因分型:例如SNP 檢測,甲基化檢測等。
Realtime PCR 常用的兩種方法
SYBR Green(熒光染料摻入法)
在PCR反應體系中,加入過量SYBR熒光染料,SYBR熒光染料特異性地摻入DNA雙鏈后,發(fā)射熒光信號,而不摻入鏈中的SYBR染料分子不會發(fā)射任何熒光信號,從而保證熒光信號的增加與PCR產(chǎn)物的增加*同步。
此方法特點:
1、靈敏度高:使用SYBR可使熒光效果增強到1000倍以上
2、通用性好,不需要設計探針,方法簡便,省時,價格低廉。
3、通用型方法,在國內(nèi)外科研中普遍使用。
4、高通量大規(guī)模的定量PCR檢測.
5、專一性要求不高的定量PCR檢測。
Taqman probe (探針法)
PCR擴增時在加入一對引物的同時加入一個特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標記一個報告熒光基團和一個淬滅熒光基團。探針完整時,報告基團發(fā)射的熒光信號被淬滅基團吸收;PCR擴增時,Taq酶的5’-3’外切酶活性將探針酶切降解,使報告熒光基團和淬滅熒光基團分離,從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到熒光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,實現(xiàn)了熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物形成*同步。
此方法特點:
1、具有高適應性和可靠性,實驗結(jié)果穩(wěn)定重復性好,特異性更高。
2、適用于擴增序列專一的體系的檢測。
3、樣品中靶基因含量過低的定量PCR檢測。
4、靶基因的特異序列較短,無論怎樣優(yōu)化引物設計條件都不能解決。
5、存在與靶基因同源的序列,在PCR中容易出現(xiàn)非特異性擴增,對特異性要求較高的定量。
6、廣泛用于人類傳染病的診斷和病原定量,在動物病原體基因的檢測,畜禽產(chǎn)品的檢驗檢疫,生物制品的鑒定。
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