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1、形態
原生動物門屬真核原生生物界，是單細胞的微型動物，由原生質和一個或多個細胞核組成。原生動物和多細胞動物相同，具有新陳代謝、運動、繁殖、對外界刺激的感應性和對環境的適應性等生理功能。原生動物個體很小，長度一般在100～300μm之間。它們都具有細胞膜。多數種屬的細胞膜結實而富有彈性，從而使原生動物本體保持一定的體形。但也有一些種屬，例如變形蟲，只有一層極薄的原生質膜，不能保持固定的體形。原生動物一般具有一個或兩個以上的細胞核，其形狀多種多樣，它們在其細胞內產生形態的分化，形成了能夠執行各項生命活動和生理功能的胞器。在運動胞器方面有鞭毛、偽足和纖毛；在營養胞器方面有胞口、胞咽和食物泡；用以排出廢料和調節滲透壓的胞器有伸縮泡等。有些種類的原生動物的細胞膜內分布著肌絲，具有收縮變形的功能。
2、營養方式
原生動物的營養方式分為以下幾類：①動物性營養，以吞食細菌、真菌、藻類或有機顆粒為生，絕大多數原生動物為動物性營養，有些具有胞口、胞咽等攝食器；②植物性營養，在有陽光的條件下，一些含色素的原生動物可利用二氧化碳和水進行光合作用合成碳水化合物，如植物性鞭毛蟲，但種類和數量都很少；③腐生性營養，以死的機體或無生命的可溶性有機物質為生；④寄生性營養，以其它生物的機體(即寄主)作為生存的場所，并獲得營養和能量。
3、分類
1981年原生動物學會公布了原生動物分類系統，其中在水處理中常見的有三類：
①肉足類，其細胞質可伸縮變動而形成偽足，作為運動和攝食的胞器，運動速度達3μm/s，典型的肉足類為變形蟲屬、簡便蟲屬、表殼蟲屬和鱗殼蟲屬等；
②鞭毛類，具有一根或一根以上的鞭毛。鞭毛長度與其體長大致相等或更長些，是運動器官，鞭毛蟲又可分為植物性鞭毛蟲和動物性鞭毛蟲，常見的植物性鞭毛蟲有滴蟲屬、屋滴蟲屬和眼蟲屬等，常見的動物性鞭毛蟲有波豆蟲屬、尾波蟲屬等，鞭毛蟲的運行速度達15～300μm/s；
③纖毛類，原生動物周身表面或部分表面具有纖毛，作為行動或攝食的工具，具有胞口、口圍、口前庭和胞咽等司吞食和消化的細胞器官，分為游泳型和固著型兩種，游泳型包括漫游蟲屬、草履蟲屬、腎形蟲屬、斜管蟲屬等，固著型常見的有鐘蟲屬、累枝蟲屬、蓋蟲屬、聚縮蟲屬、盾纖蟲屬和殼吸管蟲屬等，纖毛類運動速度較快，可達200～1000μm/s。
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