殺菌鍋從控制方式分有五種，分為手動控制型、電氣自控型、電腦自控型、電腦半自動控制型、電腦全自動控制型（遠程控制型）等五種。手動控制型；所有閥門和水泵均由手動控制，包括加水、升溫、保溫、降溫等工序。電氣半自動型；壓力由電接點壓力表(一表控兩閥，補氣閥和排氣閥）控制，溫度由傳感器（pt100）和進口溫控儀控制（精度為±1℃），降溫過程由人工操作。電腦半自動型；采用PLC和文本顯示器將采集的壓力傳感器信號和溫度信號進行處理，可以儲存殺菌工藝，控制精度高，溫控可達±1℃，（主要控制補氣，排氣，溫度，時間）降溫過程由人工操作。電腦全自動控制型；全部過程都有PLC和觸摸屏控制，可以儲存殺菌工藝，操作工只需按啟動按鈕即可，殺菌完畢后自動報警，溫控精度可達±0.5℃。（整個殺菌過程形成了數字化，機械化）基本上達到了一指通。（除去進出貨物和開關鍋門）電腦全自動控制型（遠程控制型）；在電腦半自動的基礎上，整機和前后的輸送線自動連接，整機具備自動進出料，自動開關鍋門，鍋內導軌可前后自動伸縮，（整機達到了數字化，機械化）可形成遠程控制或操作，為車間的無人化操作鑒定基礎。遠程控制的使用為售后服務節省了時間。