育種值（breeding value）在數量遺傳學中是占有重要位置的，其在動物育種實踐中已被廣泛采用，發掘育種值在植物育種中的價值，對植物育種有重要意義。

（一）育種值定義

表現型值 = 基因型值 + 環境效應 + 隨機誤差

P = G + E + e

G = M + A

表現型值：對表現型的測量值稱為該個體的表現型值。以P表示。

基因型值：由個體的基因型所決定的數值稱為該個體的基因型值。以G表示。

基因的平均效應：群體內接受了某個基因的所有個體的平均基因型值距群體平均的離差稱為該基因的平均效應。

育種值

理論定義：一個個體的育種值，就是它所攜帶的基因的平均效應的總和。

如果將圖中的群體內每一個個體的育種值求累加和，結果=0.

按照育種值的理論定義，一個個體的育種值是跟所在群體有關的，對個體育種值的計算度量離不開所在群體，否則沒有意義。也就是說，無法用理論定義來比較兩個群體間的育種值，比如，選擇前群體和選擇后群體。

但是育種值又是跟加性效應對應，這樣就好理解為什么數量遺傳學給出了育種值的“實際定義”。

實際定義：如果一個個體與來自群體內的許多個體隨機交配，則該個體的育種值為其子代均值與群體平均離差的兩倍。

實際育種中，通常不清楚控制性狀的基因型，群體內的基因頻率、基因型頻率也是未知，因此理論育種值是不能夠直接度量的，能夠知道的只是包含育種值在內的各種遺傳效應和環境效應共同作用得到的表型值，因此只能利用統計分析方法，通過表型值和個體間的親緣關系來對育種值進行估計，這就是估計育種值（EBV）。基因型值的加性效應就是育種值。

（二）理論定義與實際定義辨析

1、育種值的理論定義定位于一個群體內部，一個群體內，不同個體間由于基因差異存在不同的育種值，但是一個群體內，所有個體的育種值總和=0.

2、育種值的實際定義立足于子代群體和親代群體間的均值離差。

3、如果考慮選擇育種中的選擇響應，在只考慮加性效應，不考慮上位性等其他效應的前提下，估計育種值是選擇響應的2倍。選擇育種，本質上，就是依據選擇前群體和選擇后群體間，群體均值、基因加性效應的變化在進行育種選擇。

4、常規育種或者雜交育種選育自交系，依據基因的加性效應選擇，就是依據育種值在進行選擇，因為只有加性效應可以穩定遺傳給子代；一個育種材料內在基因加性效應的改良提升，就是育種值的積累，外在就是群體均值的改變，這也是差值選擇育種法的含義。

5、BLUP計算植物育種的育種值，一定意義上可以認為是從育種值理論定義出發計算一個群體內不同個體的育種值，盡管其沒有采用基因頻率，只要模型設置合理，符合群體效應實際情況。因為其分析模型來自數量遺傳學的基本模型，并且符合一個群體內所有個體育種值合計=0.

6、BLUP計算植物育種的育種值，比采用群體間均值差異的方式更加合理、數據更準確，因為群體內個體間親緣關系，以及群體的環境影響，都被納入了模型，因此計算得到的育種值更接近真實的育種值。

簡單的說，就是選擇育種和BLUP育種值方法都是利用育種值在進行育種，一個從實際定義出發一個從理論定義出發，一個算的粗糙一些，一個算的更準確一些。

對植物育種來說，只要選擇，就可以用育種值。

對雜交育種來說，選自交系，除去早期配合力測定，其余時候用育種值。后期配組合用配合力。

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