由于轉子的加工誤差和離心機安裝誤差造成轉子在不同程度上偏離離心機主軸，因此，在轉子旋轉時會產生振動，從而引起整個機身強烈振動。出現這種現象時的轉速稱為臨界轉速。  

     高速離心機的振動是衡量離心機性能優劣的重要標志之一。邁皋科學儀器總結了兩大高速離心機減震的方法： 高速離心機減震分為主動減振和被動減振。主動減振就是在設計中將離心機工作實際轉速小于臨界轉速。只有離心機的工作轉速不在臨界轉速時，轉子才能平穩動轉。對工作轉速不高的低速離心機，一般都盡可能提高臨界轉速，使離心機在臨界轉速以下運轉，這個需要廠家在設計生產時確定。臨界轉速與離心機和與之配用的轉子有關。一臺離心機可配用數種轉子，因此設計離心機時應考慮離心機的減振設計對各種轉子的兼容性。高速離心機的工作范圍很寬，從幾千轉／分鐘至幾萬轉／分鐘，離心機振動發生的轉速越高，其危險性就越大。人類加工任何東西肯定會有誤差，所以在加工精度越高，誤差就越小。離心機設計時用多種知識的綜合利用來達到允許一定的加工誤差，使離心機的振動控制在正常范圍之內。但是若使用不當，就會破壞這種平衡，導致發生嚴重事故。

    被動減振就是以各種型式的減振器將可能產生的振動與機架和基礎隔開。橡膠減振器一般即可滿足高速離心機的減振要求。在減振器結構已定的情況下，橡膠硬度越大，系統的臨界轉速就越高。硬度太低的減振器，強度不能滿足要求，容易損壞。這種高速離心機的軸很粗，剛度很大，稱為剛性軸。當轉速要求很高時，盡可能降低臨界轉速，軸做得細一些，剛度小，稱為撓性軸，現代的超速離心機都采用撓性軸。

    由于用戶的操作不當引起的這種事故屢屢發生，設有不平衡保護功能。即離心機啟動時一旦轉子的振動大于設定值，離心機就自動降速停機，具有這種性能的離心機有時也漏報，不能確保不出事故。

一旦在高轉速下發生振動，應立即按停止鍵，以zui快的降速檔使離心機停轉，所有人員應快速離開現場，以免發生斷軸等事故時的人員傷害。絕不能斷電，一斷電，快速降速功能就失效了，轉子停轉很慢。

事故一般是由于離心機操作不當引起的，如轉子在主軸上沒放好、轉子的蓋子沒蓋好、甩開轉子的吊籃沒放好等。這種事故的結構是伴隨著巨大聲音和震動。打開蓋子可看到轉子躺在腔內，取出轉子可觀察到轉子的外緣面嚴重刮傷變色，離心腔內壁也會受損。有時轉子和轉子蓋分離，試管中的液體灑在腔內，主軸斷開或嚴重彎曲。