用以檢查機體器官、組織或細胞中的病理改變的病理形態學方法。為探討器官、組織或細胞所發生的疾病過程，可采用某種病理形態學檢查的方法，檢查他們所發生的病變 ，探討病變產生的原因、發病機理、病變的發生發展過程，后做出病理診斷。病理形態學的檢查方法，首先觀察大體標本的病理改變，然后切取一定大小的病變組織，用病理組織學方法制成病理切片，用顯微鏡進一步檢查病變。

病理檢查已大量應用于臨床工作及科學研究。在臨床方面主要進行尸體病理解剖及手術病理檢查（包括手術切除的標本檢查以及為診斷而采取的較小活體標本檢查）（見活體組織檢查）。手術病理檢查的目的有多種。一為明確診斷及驗證術前診斷提高臨床診斷的水平。若腫瘤診斷已明確，對切除組織進行病理檢查可決定下一步治療方案（如應進行放射治療、化學治療還是進一步手術）及估計預后。二為了解術前各種治療方法的效果，借以提高臨床治療水平。后，對所有病理標本進行的檢查都有科研的意義，同樣疾病的病理標本累積多了，即可進行臨床病理分析，借以獲得極有價值的科研資料。

對動物實驗科研標本進行病理檢查的方法與上述一致。但在不同的科研，檢查目的可以大不相同。有的是為了建立各種疾病的動物模型，探討該種疾病的病因學、發病機理、病理過程和發展、結局等；有的是為了探索治療方法，有的是為了鑒定某種藥物的作用、療效和毒性等。