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QExactive一小時DDA鑒定DIA定量Hela 蛋白

閱讀:764      發布時間:2017-09-21
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數據非依賴性的掃描模式(data-independent acquisition, DIA)是
近幾年來發展的一種新的質譜數據采集方式 [1] 。它的理念是用二
級碎片離子進行蛋白相對/定量。DIA 掃描模式中,超高分辨
質譜對特定質量范圍內的所有母離子進行碎裂,采集所有母離
子的碎片離子,并快速地依次掃描相鄰的母離子寬口內的所有碎
片離子。DIA 的數據中包含了所有碎片離子的保留時間和強度信
息。用非常小的質量偏差寬口(如 10 ppm)目標性地抽提同一
肽段的多個子離子,計算子離子的強度,就能對該肽段進行鑒定
和定量。DIA 定量相比傳統的基于母離子強度的 DDA 定量有選
擇性好,定量準確等優點 [1] ,所以 DIA 成為定量蛋白組學新的發
展方向。
Q Exactive HF 是賽默飛世爾科技在 2014 年的 ASMS 上推出的全
新靜電場軌道阱超高分辨質譜儀(圖 1) [2,3] 。Q Exactive HF 采用
了分段式四極桿技術(Advanced Quadrupole Technology,AQT)
使離子傳輸效率至少提高了 2 倍;超高場 Orbitrap 技術,提高了
Orbitrap 掃描速度,在 15000 分辨率時,二級譜圖的掃描速度是
20 Hz。這兩項技術提高了 QE HF 進行 DDA、DIA 數據的采集能
力。本文用 1 小時快速色譜梯度對 QE HF 的 DDA 鑒定能力和 DIA
定量能力進行考察,同時從定量肽段數目和 CV 兩方面對 DDA 定
量和 DIA 定量能力進行比較。

使用儀器:Q Exactive HF 

 

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