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SRM2372a人DNA定量標準(美國nist標準品) 旨在用于人類基因組脫氧核糖核酸 (DNA) 定量材料的價值分配,主要用于定量聚合酶鏈反應 (qPCR)。
一個標準物質 NIST SRM 2372a 單元由三種在 pH 8.0 水性緩沖液中充分表征的人類基因組 DNA 材料組成。這些成分來自人類血沉棕黃層樣本并標記為 A、B 和 C。成分 A 由來自單個男性供體的基因組 DNA 組成。組分 B 由來自單個女性供體的基因組 DNA 組成。組分 C 由基因組 DNA 的重量混合物組成(1 份男性供體對 3 份女性供體)。一個 SRM 單元由一個裝有每種成分的 0.5 mL 無菌小瓶組成,每個小瓶中含有大約 55 µL 的 DNA 溶液。這些小瓶中的每一個都貼有標簽,并用顏色編碼的螺帽密封。
認證值在表 1 中提供。這些認證值是根據液滴數字聚合酶鏈反應 (ddPCR) 對八條染色體上十個*目標的測定計數、稀釋因子和液滴體積測量值確定的。 NIST 認證值是 NIST 對所有已知或可疑的偏差來源都已考慮在內的最高置信度的值。
表 1. SRM2372a人DNA定量標準(美國nist標準品) 數量和質量濃度的認證值 拷貝數值在計量上可追溯到自然單位計數 1 和比率 1 以及國際單位制 (SI) 導出的體積單位。 DNA 質量濃度值在計量學上可追溯到自然單位計數和比率 1 以及 SI 導出的質量和體積單位。
(a) 值表示為 x ± U95%(x),其中 x 是認證值,U95%(x) 是認證值的擴展不確定度。分析物的真實值被認為位于區間 x 內 ± U95%(x),置信度為 95%。 要傳播這種不確定性,請將認證值視為具有平均值 x 和標準偏差 U95%(x)/2 的正態分布隨機變量。
(b) 拷貝數濃度值、每納升人類單倍體基因組當量 (HHGE) 是基于八條染色體上十個*目標的液滴數字 (ddPCR) 分析計數、稀釋因子和液滴體積測量值。
(c) 質量濃度值,即每微升人類基因組 DNA 的納克數,是根據數量濃度結果、參考 HHGE 中核苷酸堿基對 (bp) 的數量以及核苷酸單體鈉鹽的平均分子量計算得出的 包含 DNA 聚合物。
表 2 列出了 SRM 2372a 組件中線粒體基因組 (mtDNA) 數量相對于核單倍體基因組 (nDNA) 數量的值。 由于它們基于數量有限的獨立 ddPCR 檢測,因此這些值不符合 NIST 的認證標準,但卻是目前可用的最佳估計值。
在需要使用之前,標準參考物質 NIST SRM 2372a 應儲存在 2 °C 至 8 °C 之間的黑暗中。在取出樣品等分試樣進行分析之前,組分小瓶應簡單混合并離心(不打開小瓶蓋)。為使認證值適用,打開小瓶后應立即取出材料并立即處理。認證值不適用于重新封蓋的小瓶中剩余的任何材料。該認證僅適用于初次使用,如果以后使用剩余材料,則不能保證相同的結果。
對于 qPCR 分析,根據認證的質量濃度分配二級標準 DNA 溶液的值。使用由 SRM 2372a 組件制備的一個或多個稀釋系列,將檢測校準到 SRM 2372a。對于非性別特異性 qPCR 檢測,所有三種成分都應用作校準物,以闡明潛在的材料檢測特異性相互作用。用戶應記住存在移液錯誤的可能性;因此,在制備校準溶液時應適當小心。
用于制備本產品的每個供體單位都經過 FDA 許可的測試,發現人類免疫缺陷病毒(HIV-1 RNA 和抗 HIV 1/2)、乙型肝炎(HBV DNA 和 HBsAg)呈陰性、丙型肝炎(HCV RNA和抗HCV)、西尼羅河病毒(WNV RNA)和梅毒。此外,根據 FDA 對克氏錐蟲(南美錐蟲)的指導方針對每個捐贈者進行了測試,發現它們呈陰性/無反應。然而,沒有已知的測試方法可以*保證這種材料中不存在傳染性病原體。因此,這種基于人類血液的產品應按照生物安全級別 1 進行處理。SRM 2372a 組件和衍生溶液應按照當地、州和聯邦法規進行處理。
SRM2372a人DNA定量標準(美國nist標準品) 是在 NIST 進行適當的人類受試者研究確定后開發的。
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