在氣相色譜的使用過程中，氫氣的用途主要有以下幾種：一方面使用氫氣作為氣相色譜分析的載氣，進行樣品分離和分析；另一方面，當使用毛細柱進行分析時，一般需要使用與載氣相同的氣體作為尾吹氣；再則，使用FID、FPD和NPD做檢測器時候，需要使用氫氣作為燃氣，和空氣燃燒以提供火焰；此外，當儀器使用轉化爐時候，需要額外的氫氣用作反應氣體和CO、CO2發生反應生成甲烷。常用的氫氣供給方式包括使用鋼瓶氫氣和使用氫氣發生器來提供。出于安全考慮，不少的實驗室目前使用氫氣發生器進行供氣。除了安全的特點之外，氣體發生器可以放在儀器旁邊，避免了布置氣路管道等問題。
實驗室常用的氫氣發生器是采用堿性電解槽+硅膠/分子篩凈化系統的氫氣發生器(點擊鏈接，查看詳細內容：第08篇氣相色譜中的氫氣發生器)，使用之前向氫氣發生器的電解液儲液桶加入合適量的KOH水溶液，連接好儀器管路，打開開關即可長期使用。
正常使用時候，應當保持氫氣發生器液位在上下液位線之間；當氫氣發生器正常工作時，氫氣發生器輸出流量會顯示儀器實際使用的氫氣流量(大致示數，有偏差)；如果未使用氫氣，輸出流量示數為0，且電解指示燈不亮。
使用氫氣發生器時，打開電源開關之后，流量示數往往很大，顯示為該裝置的z大產氣量，往往會引起對氫氣發生器儀器狀態的疑慮。
實際上，打開氫氣發生器之后，為了達到氫氣發生器本身預設的氫氣輸出壓力，其會以z大的功率電解水產氫；由z大電解水功率計算為氫氣流量，顯示在示數上則為該氫氣發生器的z大輸出流量。待達到氫氣發生器本身預設的輸出壓力之后，輸出流量示數則為實際使用的氫氣流量。
在室溫情況下，打開氫氣發生器，6min左右即可達到輸出壓力設定值；如果室溫較低(冬季)，則需要更長的時間。
當然，如果長時間氫氣發生器達不到預定的輸出壓力，或儀器顯示輸出流量超出實際使用量較大/持續顯示為z大輸出流量，則需要排查儀器故障。常見的儀器故障為氣路系統漏氣、氫氣發生器的過濾器或過濾器上蓋沒有擰緊、氫氣電解池反漏等。
氣路系統漏氣指的是氫氣發生器與氣相色譜連接的管線可能漏氣，此時需要擰緊管路連接的螺帽、更換管路密封O型圈、壓環等。
氫氣發生器常使用硅膠/分子篩來凈化電解產生的氫氣，如果更換了凈化用的硅膠和分子篩，或長期使用導致密封不嚴、密封圈老化，可能會漏氣。
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