Chromatin Isolation via RNA Precipitation

Chromatin Isolation via RNA Precipitation

基本信息

ChIRP是一種快速技術，可發現與RNA相關的DNA序列，并以高靈敏度和低背景定位與染色質相關的長非編碼RNA（lncRNA）的基因組結合位點.

通過這種方法，您可以定位哪些染色質區域在一起進行協調表達，確定哪些基因一起表達，并了解lncRNA在染色質調節中的作用。使用我們的ChIRP探針設計者設計的反義寡核苷酸捕獲目標lncRNA的親和力，并對與lncRNA相關的DNA染色質進行測序以創建測序文庫。利用DNA序列數據，可以生成幾百個堿基分辨率的基因組結合位點圖。ChIRP是一種快速技術，可發現與RNA相關的DNA序列，并以高靈敏度和低背景定位與染色質相關的長非編碼RNA（lncRNA）的基因組結合位點。通過這種方法，您可以定位哪些染色質區域在一起進行協調表達，確定哪些基因一起表達，并了解lncRNA在染色質調節中的作用。使用我們的ChIRP探針設計者設計的反義寡核苷酸捕獲目標lncRNA的親和力，并對與lncRNA相關的DNA染色質進行測序以創建測序文庫。利用DNA序列數據，可以生成幾百個堿基分辨率的基因組結合位點圖。

ChIRP寡核苷酸集可在LGC Biosearch的基于Web的設計師中進行設計并直接訂購。寡核苷酸以每孔5 nmol每個寡核苷酸的平板形式交付，因此可以將它們組合成合適的組。我們建議每組使用8至48個寡核苷酸。我們使用的連接子是C3（生物素）；3'修改與初使用的修改不同，但已被該技術的發起者批準。完整的ChIRP方法的緩沖液和其他試劑由EMD / Millipore提供。