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腸炎沙門氏菌(SE)核酸檢測試劑盒說明書
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上海晅科生物科技有限公司
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【產(chǎn)品名稱】
商品名稱:腸炎沙門氏菌(SE)核酸檢測試劑盒(熒光 PCR 法)
Name :Salmonella Enteritidis Detection Kit (Real-Time PCR Method)
【包裝規(guī)格】25T/盒、50T/盒
【預(yù)期用途】
腸炎沙門氏菌不但能引起肉雞和蛋雞的發(fā)病,造成嚴(yán)重的經(jīng)濟損失,而且是人食物中毒的主要病原菌之一。 日、美等發(fā)達(dá)國家發(fā)生食物中毒事件 40%-80%是由禽沙門氏菌引起的,其中主要病原菌為腸炎沙門氏菌,也是我國食物中毒事件的常見菌。由于該菌引起雞群發(fā)病的癥狀和病理學(xué)冰花與雞白痢沙門氏菌非常相似,所以在生產(chǎn)中往往把雞腸炎沙門氏菌感染誤診為雞白痢或傷寒。但 SE 宿主譜比白痢沙門氏菌廣泛,該病的防治和普查要比雞白痢困難的多,建立腸炎沙門氏菌快速特異性檢測方法在養(yǎng)殖業(yè),醫(yī)學(xué)以及公共衛(wèi)生有重要意義。
腸炎沙門氏菌(Salmonella Enteritidis, SE)是引起人與動物急性胃腸炎的主要病原菌,感染后典型癥狀包括發(fā)熱、腹瀉等。SE 具有廣泛寄主譜,
本試劑盒適用于檢測水樣糞便,疑似污染的水、食物等樣本中的雞腸炎沙門氏菌,用于雞腸炎沙門氏菌感 染的輔助診斷。
【檢驗原理】
本試劑盒采用 TaqMan 探針法實時熒光 PCR 技術(shù),設(shè)計一對雞腸炎沙門氏菌特異性引物,結(jié)合一條特異性探針,用熒光 PCR 技術(shù)對雞腸炎沙門氏菌的 DNA 進行體外擴增檢測,用于臨床上對可疑感染病料的病原學(xué)診斷。
【試劑組成】
包裝規(guī)格25T/盒50T/盒
SE 反應(yīng)液500μL×1 管500μL×2 管
酶液25μL×1 管50μL×1 管
SE 陽性質(zhì)控品50μL ×1 管50μL ×1 管
陰性質(zhì)控品250μL ×1 管250μL ×1 管
說明:不同批號的試劑盒組分不可交互使用。
【儲存條件及有效期】
-20℃±5℃,避光保存、運輸、反復(fù)凍融次數(shù)不超過 5 次,有效期 12 個月。
【適用儀器】
ABI7500、安捷倫 MX3000P/3005P、LightCycler、Bio-Rad、eppendorf 等系列熒光定量 PCR 檢測儀。
【標(biāo)本采集】
水樣便取 0.5~1mL;疑似污染的食物取 1g
【保存和運輸】
采集或處理好的樣品在 2℃~8℃條件下保存應(yīng)不超過 24 h;若需長期保存,應(yīng)放置-70℃以下保存,凍融不超過 3 次。
【使用方法】
1.樣品處理(樣本處理區(qū))
1.1樣本前處理
水樣便 13000rpm 離心 2min,去盡上清;疑似污染的食物用手術(shù)剪剪碎混勻后取 0.5g 于研磨器中研磨, 加入 1.5mL 生理鹽水后繼續(xù)研磨,待勻漿后轉(zhuǎn)至 1.5mL 滅菌離心管中,8000rpm 離心 2min,取上清液 100μL 于 1.5mL 滅菌離心管中;疑似污染的水直接取 100μL。
1.2核酸提取
推薦采用上海晅科生物科技有限公司生產(chǎn)的核酸提取或純化試劑(磁珠法或離心柱法)進行核酸提取, 請按照試劑說明書進行操作。
2.試劑配制(試劑準(zhǔn)備區(qū))
根據(jù)待檢測樣本總數(shù),設(shè)所需要的 PCR 反應(yīng)管管數(shù)為 N(N=樣本數(shù)+1 管陰性對照+1 管陽性對照;反應(yīng)管數(shù)每滿 10 份,多配制 1 份),每測試反應(yīng)體系配制如下表:
試劑SE 反應(yīng)液酶液
用量(樣本數(shù)為 N)19μL1μL
將混合好的測試反應(yīng)液分裝到 PCR 反應(yīng)管中,20μL/管。
3.加樣(樣本處理區(qū))
將步驟 1 提取的核酸、陽性質(zhì)控品、陰性質(zhì)控品各取 5μL,分別加入相應(yīng)的反應(yīng)管中,蓋好管蓋,混勻, 短暫離心。
4.PCR 擴增(核酸擴增區(qū))
4.1將待檢測反應(yīng)管置于熒光定量 PCR 儀反應(yīng)槽內(nèi);
4.2設(shè)置好通道、樣品信息,反應(yīng)體系設(shè)置為 25μL;
熒光通道選擇:檢測通道(Reporter Dye)FAM,淬滅通道(Quencher Dye)NONE,請勿選擇 ROX 參比熒光。
4.3推薦循環(huán)參數(shù)設(shè)置:
步驟循環(huán)數(shù)溫度時間收集熒光信號
11 cycle95℃2min否
245 cycles95℃15sec否
60℃30sec是
5.結(jié)果分析判定
5.1結(jié)果分析條件設(shè)定(請參照各儀器使用說明書進行設(shè)置,以分析 ABI7500 儀器為例)
反應(yīng)結(jié)束后自動保存結(jié)果,根據(jù)分析后圖像調(diào)節(jié) Baseline 的 Start 值、End 值以及 Threshold 值(用戶可根據(jù)實際情況自行調(diào)整,Start 值可設(shè)在 3~15、End 值可設(shè)在 5~20,使閾值線位于擴增曲線指數(shù)期,陰性質(zhì)控品的擴增曲線平直或低于閾值線),點擊 Analyze 自動獲得分析結(jié)果。
5.2結(jié)果判斷
陽性:檢測通道 Ct 值≤40,且曲線有明顯的指數(shù)增長曲線; 陰性:樣本檢測結(jié)果 Ct 值>40 或無 Ct 值。
5.3質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)
陰性質(zhì)控品:無特異性擴增曲線或無 Ct 值顯示;
陽性質(zhì)控品:擴增曲線有明顯指數(shù)增長期,且 Ct 值≤32; 以上條件應(yīng)同時滿足,否則實驗視為無效。
6.檢測方法的局限性
1.樣本檢測結(jié)果與樣本收集、處理、運送以及保存質(zhì)量有關(guān);
2.樣本提取過程中沒有控制好交叉污染,會出現(xiàn)假陽性結(jié)果;
3.陽性對照、擴增產(chǎn)物泄漏,會導(dǎo)致假陽性結(jié)果;
4.病原體在流行過程中基因突變、重組,會導(dǎo)致假陰性結(jié)果;
5.不同的提取方法存在提取效率差異,會導(dǎo)致假陰性結(jié)果;
6.試劑運輸,保存不當(dāng)或試劑配制不準(zhǔn)確引起的試劑檢測效能下降,出現(xiàn)假陰性或定量檢測不準(zhǔn)確的結(jié)果;
7.本檢測結(jié)果僅供參考,如須確診請結(jié)合臨床癥狀以及其他檢測手段。
【注意事項】
1.所有操作嚴(yán)格按照說明書進行;
2.試劑盒內(nèi)各種組分使用前應(yīng)自然融化,完-全混勻并短暫離心;
3.反應(yīng)液應(yīng)避光保存;
4.反應(yīng)中盡量避免氣泡存在,管蓋需蓋緊;
5.使用一次性吸頭、一次性手套和各區(qū)專用工作服;
6.樣本處理、試劑配制、加樣需在不同區(qū)進行,以免交叉污染;
7.實驗完畢后用 10%次氯酸或 75%酒精或紫外燈處理工作臺和移液器;
8.試劑盒里所有物品應(yīng)視為污染物對待,并按照《微生物生物醫(yī)學(xué)實驗室生物安全通則》進行處理。