氣相色譜儀主要由載氣系統、進樣系統、分離系統（色譜柱）、檢測系統以及數據處理系統構成。氣相色譜法是利用色譜柱中裝入擔體及固定液，用載氣把欲分析的混合物帶入色譜柱，在一定的溫度與壓力條件下，各氣體組分在載氣和固定液薄膜的氣液兩相相中的分配系數不同，隨著載氣的向前流動，樣品各組分在氣，液兩相中反復進行分配，使脂肪酸各組分的移動速度有快有慢，從而可將各組分分離開。然后進行分別測定。

氣相色譜儀進樣器和進樣技術

1、填充柱進樣口
是簡單的進樣口，所有汽化的樣品均進入色譜柱，可接玻璃和不銹鋼填充柱，也可接大口徑毛細管柱進行直接進樣。
2、分流/不分流進樣口
是常用的毛細管柱進樣口。分流進樣為普通，操作簡單，但有分流歧視和樣品可能分解的問題。不分流進樣雖然操作復雜一些，但分析靈敏度高，常用于痕量分析。
3、冷柱上進樣口
樣品以液體形態直接進入色譜柱，無分流歧視問題。分析精度高，重現性好。尤其適用于沸點范圍寬或熱不穩定的樣品，也常用于痕量分析（可進行柱上濃縮）。
4、程序升溫汽化進樣口
將分流/不分流進樣和冷柱上進樣結合起來，功能多，適用范圍廣，是較為理想的GC進樣口。
5、大體積進樣
采用程序升溫汽化或冷柱上進樣口，配合以溶劑放空功能，進樣量可達幾百微升，甚至更高，可大大提高分析靈敏度，在環境分析中應用廣泛，但操作較為復雜。
6、閥進樣
常用六通閥定量引入氣體或液體樣品，重現性好，容易實現自動化。但進樣對峰展寬的影響大，常用于*氣體的分析，以及化工工藝過程中物料流的監測。
7、頂空進樣
只取復雜樣品基體上方的氣體部分進行分析，有靜態頂空和動態頂空（吹掃-捕集）之分，適合于環境分析（如水中有機污染物）、食品分析（如氣味分析）及固體材料中的可揮發物分析等。
8、裂解進樣
在嚴格控制的高溫下將不能汽化或部分不能汽化的樣品裂解成可汽化的小分子化合物，進而用GC分析，適合于聚合物樣品或地礦樣品等。