單細胞RNA測序是指在單細胞水平上對轉錄組進行測序的方法，是目前生物學研究領域的一項熱點技術。與普通高通量RNA測序相比，單細胞RNA測序可以分辨單個細胞間的生物學差異，識別出易被忽視的罕見細胞群體和細胞亞群。
測序技術與其他RNA測序的基本原理相似，流程包括細胞制備、文庫構建、測序和數據分析。其中單細胞制備和單細胞文庫構建是重要的環節，決定了數據質量、測序通量、精確度、靈敏度和可重復性。單細胞的分離制備技術目前主要有流式細胞分選術、免疫磁珠細胞分選技術、顯微操作法、微流控技術等。
單細胞RNA測序在皮膚病學研究領域的應用：
目前在皮膚相關領域使用測序技術的研究較少。有研究者首先利用這種技術研究了小鼠正常皮膚表皮的結構和組成，顯示測序技術在識別皮膚角質形成細胞亞群上的強大能力。
利用單細胞RNA測序可發現固有淋巴樣細胞（ILC）在表皮、真皮和皮下組織這3個部位有特異性的轉錄表達譜。表皮ILC可以通過抑制Notch信號通路限制皮脂腺細胞的生長，可能影響皮膚表面具有抗菌活性的游離脂肪酸的分泌，從而限制革蘭陽性菌的共生。
這為研究皮膚稀有的免疫細胞提供了技術可能，進一步探究了皮膚免疫細胞與皮脂腺、共生菌群的關系，為皮膚免疫細胞如何調節皮膚穩態提供了新的思路。
單細胞RNA測序技術是研究腫瘤細胞異質性和腫瘤微環境組成的強有力工具，已在乳腺癌、頭頸部鱗狀細胞癌、神經膠質瘤等疾病中得到了應用。
其對黑素瘤的分型和腫瘤的精準治療具有重要的指導意義，而這些結果無法通過普通高通量RNA測序得到，證明單細胞RNA測序在研究腫瘤亞群和腫瘤微環境中具有不能比擬的作用。
