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孕婦游離DNA的胎兒染色體非整倍體無創產前檢測(高通量測序法)產品
閱讀:4168發布時間:2018-1-24
染色體非整倍體是指相對于人正常的 46 條染色體而言,細胞中的某一條或幾條染色體數目增加或減少。新生兒中染色體異常的發病率為1/160,其中 21- 三 體 綜 合 征(trisomy 21,T21)、18-三體綜合征(trisomy 18,T18)和 13-三體綜合征(trisomy 13,T13)是3種zui主要常染色體非整倍體疾病。
對孕婦外周血中游離 DNA 進行高通量測序(Next Generation Sequencing, NGS),并分析孕婦外周血中攜帶的胎兒的染色體突變異常風險,特別是染色體非整倍體變異的檢測,是近幾年出現的無創產前篩查新技術。
由于基于 NGS 技術的 無創產前檢測(NIPT)具有無創取樣、無流產風險、高靈敏度、高準確性(≥99%)等特點,成為目前染色體非整倍體產前篩查與診斷技術的主要手段。
基于孕婦游離DNA的胎兒染色體非整倍體檢測(高通量測序法)流程及產品
血液標本采集、運輸、保存
血漿游離DNA提取純化
血漿游離DNA基因文庫構建
文庫產物純化
基因測序
外周血游離DNA標本采集、運輸、保存
孕婦外周血血漿游離DNA采集:EDTA 抗凝管或者 Streck Cell-Free DNA BCT 管
Streck Cell-Free DNA BCT® 血漿游離DNA采血管
產品英文名稱:Streck Cell-Free DNA BCT® BLOOD COLLECTION TUBE
產品中文名稱:Streck BCT® 血漿游離DNA采血管
Streck 血漿游離DNA采血管是一種直接提取的全血收集管,用于收集、運輸和儲存血液樣本。Streck 血漿游離DNA采血管內含防腐劑,它能穩定有核血細胞,防止細胞基因組DNA的釋放,保護血漿游離循環DNA和循環腫瘤細胞(CTC)。
230253是218962的升級版,是Streck公司新推將玻璃和塑料的*性能融合在一起的Fusion2TM混合塑料管。
品牌 | 貨號 | 產品描述 | 包裝 |
Streck | 218962 | Cell-Free DNA BCT® BLOOD COLLECTION TUBE Cell-Free DNA BCT®血漿游離DNA采血管 | 100管/盒 |
Streck | 230253 | Cell-Free DNA BCT® BLOOD COLLECTION TUBE Cell-Free DNA BCT®血漿游離DNA采血管(混合塑料) | 100管/盒 |
EDTA抗凝管參見BD真空采血管分類 血清 血漿 單個核細胞 RNA 肝素 EDTA
血漿游離DNA提取純化
磁珠法或離心柱法
離心柱法產品:
QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit 循環核酸純化試劑盒
貨號: 55114 品牌:Qiagen
QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit (50)
For 50 preps: QIAamp Mini Columns, Tube Extenders (20 ml), QIAGEN Proteinase K, Carrier RNA, Buffers, VacConnectors, and Collection Tubes (1.5 ml and 2 ml)
樣品處理量:5mL
洗脫體積:20-150μL
可以洗去PCR抑制物,如:二價陽離子和蛋白
血漿游離DNA文庫構建
ThruPLEX® Plasma-seq Kit血漿游離DNA文庫構建試劑
ThruPLEX® Plasma-seq基于ThruPLEX技術,并用于血漿來源cfDNA高品質NGS文庫構建。該試劑專門針對cfDNA進行優化,在保持樣本GC代表性的基礎上,提升了文庫的信息容量。文庫構建后可用于CNV分析、全基因組測序分析或是采用一些panel針對目標區域進行捕獲富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect® and Roche NimbleGen SeqCap® EZ。
血漿樣品采用ThruPLEX Plasma-seq試劑盒制備文庫,能有更好的靈敏度、更準確的基因變異分析結果。與其它液態活檢的樣品一樣,血漿由于其易獲得、價值高的特點,深受研究腫瘤學或者孕婦血漿中胎兒游離DNA科研工作者的重視。
品牌 | Code No. | 包裝量 |
Rubicon | R400490 | 12 Rxns |
Rubicon | R400491 | 48 Rxns |
Rubicon | R400492 | 96 Rxns |
文庫產物純化
Agencourt AMPure XP 核酸純化試劑盒
Agencourt AMPure XP核酸純化試劑盒是一種能夠獲得高質量DNA產物的純化試劑盒,純化后的核酸純度高,無鹽離子殘留,無需離心或過濾,目前廣泛應用于NGS文庫構建。該試劑的應用為產物純化,如:NGS文庫構建過程中酶聯體系的純化、PCR產物純化等。既可以手工操作,也可以使用自動化工作平臺以96孔或384孔板的形式完成。
品牌 | 貨號 | 產品名稱 | 包裝 |
BeckMan | A63882 | Agencourt AMPure XP核酸純化試劑盒 | 450 mL |
基因測序
參考文獻:
[1] 染色體非整倍體無創產前檢測技術質控要點及臨床應用進展.曲守方; 于婷; 孫楠; 李麗莉; 陳芳; 吳英松; 黃杰.分子診斷與治療雜志.
[2] 基于孕婦游離DNA的胎兒染色體非整倍體檢測試劑質量控制技術評價指南(高通量測序法)
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