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TruSeq小RNA文庫制備試劑，CRISPR-Cas gRNA
閱讀：3434發(fā)布時間：2018-1-9
產(chǎn)品英文名：TruSeq Small RNA Library Prep Kit
產(chǎn)品中文名：TruSeq小RNA文庫制備試劑盒
TruSeq小RNA文庫制備試劑盒提供用于從總RNA直接生成小RNA文庫的試劑。試劑盒中附帶的改良接頭能夠靶向通過Dicer處理產(chǎn)生的MicroRNA (miRNA)。
這些試劑盒通過引入48個*的標(biāo)簽實現(xiàn)多重測序，借此檢出miRNA和小RNA，并對通量進行圖譜分析，與Illumina測序無可企及的輸出相得益彰。標(biāo)簽添加在通用擴增反應(yīng)中，從而極大降低了連接偏向性，并確保了miRNA表達的測量準(zhǔn)確度。
通過工作流程的改善，樣本制備流程得以精簡，從而可對任何物種中的所有小RNA轉(zhuǎn)錄本展開經(jīng)濟實惠的研究。兼容的應(yīng)用包括探尋新miRNA、在單堿基分辨率下對同分異構(gòu)體等變異進行特征分析，以及在不進行預(yù)先假設(shè)的情況下分析差異表達。
品牌 | 貨號 | 產(chǎn)品描述 |
Illumina | RS-200-0012 | TruSeq Small RNA Library Prep Kit -Set A (24 rxns) (Set A: indexes 1-12) TruSeq小RNA文庫制備試劑盒 - 套件A（24次反應(yīng)）（套件A：1–12個標(biāo)簽） |
Illumina | RS-200-0024 | TruSeq Small RNA Library Prep Kit -Set B (24 rxns) (Set B: indexes 13-24) TruSeq小RNA文庫制備試劑盒 - 套件B（24次反應(yīng)）（套件B：13–24個標(biāo)簽） |
Illumina | RS-200-0036 | TruSeq Small RNA Library Prep Kit -Set C (24 rxns) (Set C: indexes 25-36) TruSeq小RNA文庫制備試劑盒 - 套件C（24次反應(yīng)）（套件C：25–36個標(biāo)簽） |
Illumina | RS-200-0048 | TruSeq Small RNA Library Prep Kit -Set D (24 rxns) (Set D: indices 37-48) TruSeq小RNA文庫制備試劑盒 - 套件D（24次反應(yīng)）（套件D：37–48個標(biāo)簽） |
Illumina | 20005613 | TruSeq Small RNA Set A MiniSeq Kit (1 library prep and 2 MiniSeq reagents) TruSeq小RNA套件B MiniSeq試劑盒（1組文庫制備和2個MiniSeq試劑） |
Illumina | 20005614 | TruSeq Small RNA Set B MiniSeq Kit (1 library prep and 2 MiniSeq reagents) TruSeq小RNA套件B MiniSeq試劑盒（1組文庫制備和2個MiniSeq試劑） |
Illumina | 20005615 | TruSeq Small RNA Set C MiniSeq Kit (1 library prep and 2 MiniSeq reagents) TruSeq小RNA套件C MiniSeq試劑盒（1組文庫制備和2個MiniSeq試劑） |
Illumina | 20005616 | TruSeq Small RNA Set D MiniSeq Kit (1 library prep and 2 MiniSeq reagents) TruSeq小RNA套件D MiniSeq試劑盒（1組文庫制備和2個MiniSeq試劑） |
TruSeq小RNA樣本數(shù)據(jù)集
已使用TruSeq小RNA文庫制備試劑盒制備人類大腦參考RNA (HBRR)和人類通用參考RNA (UHRR)樣本。這些文庫已使用片段長度配置為1 x 36堿基對的MiniSeq高輸出試劑盒在MiniSeq系統(tǒng)上進行測序。總產(chǎn)量為0.91Gb，其中97%的堿基達到或超過Q30。
Specifications
Assay Time 分析時間 | 1 day 1天 |
Hands-On Time 手動操作 | 4 hours 4小時 |
Mechanism of Action 原理 | Captures small RNA with 3′ OH and 5′P modifications (like those processed by Dicer/Drosha)捕獲小RNA |
Multiplexing | 48 unique indexes are available |
Species種屬 | Any Species, Human, Mouse 任何物種，人，鼠 |
Specialized Sample Types 特殊樣本類型 | FFPE, Low Input |
System Compatibility 兼容系統(tǒng) | MiniSeq, MiSeq, NextSeq 500, NextSeq 550 |
Technology 技術(shù) | Sequencing 測序 |
Automation Capability 自動能力 | Liquid Handling Robots 液體處理機器人 |
Variant Class 突變級別 | Novel Transcripts, Transcript Variants 新轉(zhuǎn)錄字，轉(zhuǎn)錄子突變 |
Method 方法 | miRNA and Small RNA Sequencing miRNA和RNA測序 |
特別應(yīng)用推薦：
CRISPR-Cas gRNA 驗證
Cas9技術(shù)需要：II型 CRISPR–Cas 細菌免疫系統(tǒng)，包括 trans-activating CRISPR RNA (tracrRNA), CRISPR RNA (crRNA), Cas9 protein, and protospacer-adjacent motif (PAM)。
trans-activating CRISPR RNA (tracrRNA), CRISPR RNA (crRNA)作用：形成RNA雙鏈，引導(dǎo)Cas9核酸內(nèi)切酶和核酸序列配對。
Cas9和目標(biāo)PAM序列連接。
關(guān)鍵點：guide RNA 和目標(biāo)DNA的互補。
大多數(shù)商業(yè)Cas9基因編輯工具來源：Streptococcus pyogenes（鏈球菌）的II型 CRISPR–Cas 系統(tǒng)。不過自然界還存在很多具有基因編輯潛力的II型 CRISPR–Cas 系統(tǒng)。開發(fā)這種系統(tǒng)需要預(yù)測驗證天然或基因工程來源的，驅(qū)動Cas9的單雙鏈RNA。
因為導(dǎo)引RNA的長度較小（17-200堿基），適合使用TruSeq小RNA文庫制備試劑盒（Reads 150nt）進行序列驗證。
參考文獻：
Prediction and Validation of Native and EngineeredCas9 Guide Sequences,Alexandra E. Briner,et al.
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