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Omega-質粒提取試劑盒
操作步驟:
使用前請先在漂洗液中加入無水乙醇,加入體積請參照瓶上的標簽。溶液YP1在使用前先加入RNaseA(將試劑盒中提供的 RNaseA全部加入),混勻,置于 2-8℃保存。如非指明,所有離心步驟均為使用臺式
離心機在室溫下離心。
1、取1-5ml酵母培養物(不超過 5×107cells),12000rpm離心 1min,盡量吸除上清(菌液較多時可以通過多次離心將菌體沉淀收集到一個離心管中)。
2、酵母細胞壁的破除:
A、酶法:向酵母菌體中加入 470ul 山梨醇 Buffer,充分懸浮菌體,加入 25ul 酵母破壁酶和 5ul β-巰基乙醇,充分混勻,30℃處理 1-2h,期間可顛倒離心管混勻數次。12000rpm 離心 1min,棄上清,收集沉淀。向沉淀中加入 250ul 溶液 YP1(請先檢查是否已加入 RNaseA) ,充分懸浮沉淀。注意:如果菌塊未*混勻,會影響裂解導致質粒提取量和純度偏低。
B、玻璃珠法:向酵母菌體中加入 250ul 溶液 YP1(請先檢查是否已加入 RNaseA) ,充分懸浮沉淀。加入 150-200ul酸洗玻璃珠(自備),漩渦振蕩 10min。簡短離心使玻璃珠沉降到離心管底,吸取上清(如上清有所損失,請用溶液 YP1 補足 250ul)于另一干凈離心管中。
3、向離心管中加入 250ul溶液 YP2,溫和地上下翻轉 6-8 次使菌體充分裂解。注意:混勻一定要溫和,以
免污染細菌基因組 DNA,此時菌液應變得清亮粘稠,作用時間不要超過 5 min,以免質粒受到破壞。
4、向離心管中加入 350ul溶液 YP3,立即溫和地上下翻轉 6-8次,充分混勻,此時會出現白色絮狀沉淀。12000rpm離心 10 min,用移液器小心地將上清轉移到另一個干凈的離心管中,盡量不要吸出沉淀。注意:溶液 YP3 加入后應立即混合,避免產生局部沉淀。如果上清中還有微小白色沉淀,可再次離心后取上清。
5、將上一步所得上清液加入吸附柱中,室溫放置 2min,12000rpm 離心 1min,倒掉收集管中的廢液,吸附柱重新放回收集管中。
6、向吸附柱中加入 700ul 漂洗液(使用前請先檢查是否已加入無水乙醇),12000rpm 離心 1min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中。
7、向吸附柱中加入 500ul漂洗液,12000rpm離心 1min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中。
8、12000rpm 離心 2min,將吸附柱敞口置于室溫或 50℃溫箱放置數分鐘,目的是將吸附柱中殘余的漂洗液去除,否則漂洗液中的乙醇會影響后續的實驗如酶切、PCR 等。
9、將吸附柱放入一個干凈的離心管中,向吸附膜中央懸空滴加 50-200ul 經 65℃水浴預熱的洗脫液,室溫放置 2min,12000rpm離心 1min。
10、為了增加質粒的回收效率,可將得到的洗脫液重新加入吸附柱中,室溫放置 2min, 12000rpm離心 1min。
注意事項:
1、使用前請先檢查溶液 YP2 和溶液 YP3 是否出現混濁,如有混濁現象,可在 37℃水浴中加熱幾分鐘,待溶液恢復澄清后再使用。
2、洗脫緩沖液體積不應少于 50ul,體積過小影響回收效率;洗脫液的 pH值對洗脫效率也有影響,若需要用水做洗脫液應保證其 pH 值在 8.0 左右(可用 NaOH 將水的 pH 值調此范圍),pH 值低于 7.0 會降低。洗脫效率;DNA產物應保存在-20℃,以防 DNA降解。
3、質粒得率與酵母菌株、質粒拷貝數、培養條件等因素有關。通常酵母質粒拷貝數都很低,一般通過電泳或分光光度計法都很難檢測到,可通過 PCR或轉化大腸桿菌來檢測。
4、DNA濃度及純度檢測:得到的基因組DN**段的大小與樣品保存時間、操作過程中的剪切力等因素有關。回收得到的DN**段可用瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計檢測濃度與純度。DNA應在OD260處有顯著吸收峰, OD260值為 1 相當于大約 50 μg/ml雙鏈DNA、40 μg/ml單鏈DNA。OD260/OD280比值應為1.7-1.9,如果洗脫時不使用洗脫緩沖液,而使用去離子水,比值會偏低,因為pH值和離子存在會影響光吸收值,但并不表示純度低。
Omega-質粒提取試劑盒