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進(jìn)階的PCR,了解一下
盤點(diǎn)PCR技術(shù)
PCR技術(shù)是模擬體內(nèi)DNA的天然復(fù)制過(guò)程,在體外擴(kuò)增DNA分子的一種分子生物學(xué)技術(shù),主要用于擴(kuò)增位于兩段已知序列之間的DNA區(qū)段。
PCR技術(shù)自1983年Kary Mullis發(fā)明以來(lái),在經(jīng)典的梯度PCR基礎(chǔ)上,又拓展了新的PCR技術(shù)。不同PCR技術(shù)的涌入,急速壯大了PCR家族。
篇幅有限,先從入門級(jí)PCR涉及到的Hot start PCR(熱啟動(dòng)PCR)、Long PCR(長(zhǎng)片段PCR)、Touchdown PCR(降落PCR)開始講起。
在模塊溫度到達(dá)設(shè)定的變性溫度之前,模塊內(nèi)的樣品往往要一起經(jīng)歷加熱的過(guò)程,此時(shí)Taq酶仍具有一定活性,部分的引物和模板會(huì)在酶的作用下進(jìn)行非特異性的結(jié)合、延伸,消耗反應(yīng)物, 導(dǎo)致特異性擴(kuò)增減少。目前一般采用溫控系統(tǒng)或使用特殊Taq酶避免此現(xiàn)象的發(fā)生,稱之為熱啟動(dòng)PCR。
Long PCR(長(zhǎng)片段PCR)則可以滿足較長(zhǎng)片段的DNA片段的擴(kuò)增需求,常用Taq酶和Pfu酶混合使用并配以特殊的緩沖液,避免錯(cuò)誤的dNTP加入到片段中。在正常10-15個(gè)循環(huán)之后,每一個(gè)循環(huán)的延伸時(shí)間都要上一次循環(huán)的延伸時(shí)間多出10秒左右,以此配合完成正確的延伸。
由于影響PCR效率的因素有很多,比如引物、退火溫度,循環(huán)次數(shù)等,逐一驗(yàn)證選擇適條件會(huì)花費(fèi)大量的時(shí)間及成本,因此,降落PCR是針對(duì)一系列不太的退火時(shí)間來(lái)考量的:退火溫度的起始值高于T值15℃,每一個(gè)(或n個(gè))循環(huán)后比之前的循環(huán)的退火溫度都要低,直到溫度等于或低于T值,此后,在低溫環(huán)境下再進(jìn)行幾個(gè)循環(huán),以此達(dá)到特異性擴(kuò)增的目的。高溫環(huán)境能使部分特異性結(jié)合發(fā)生,再降溫,某些非特異性擴(kuò)增已不具備優(yōu)勢(shì),因此能夠擴(kuò)增。
以上三種PCR都可以在寶予德FastAmp 基因擴(kuò)增儀上得以實(shí)現(xiàn),不僅如此,美國(guó)Marlow半導(dǎo)體具備的溫控性能,大變溫速率為6.5℃/S,三種模塊可選擇,10英寸顯示觸摸屏帶給您更好地操作體驗(yàn)!