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北京諾博萊德科技有限公司

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211216-100天凈沙 可調式易錯 PCR 試劑盒

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  • 北京諾博萊德科技有限公司
  • 2024-11-08 09:06:34
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【簡單介紹】

品牌 其他品牌 規格 100次
供貨周期 現貨 應用領域 醫療衛生,化工,生物產業
211216-100 天凈沙 可調式易錯 PCR 試劑盒,產品簡介:
產品品牌:天凈沙
產品名稱:可調式易錯 PCR 試劑盒
產品貨號:211216-100
產品規格:100次

【詳細說明】

天凈沙211216-100可調式易錯 PCR 試劑盒

北京天凈沙基因科技有限公司,是一家聚焦科研試劑、動物檢驗檢疫、分子診斷的研發和生產企業。


211216-100 天凈沙 可調式易錯 PCR 試劑盒,產品簡介:

產品品牌:天凈沙

產品名稱:可調式易錯 PCR 試劑盒

產品貨號:211216-100

產品規格:100

211216-100 天凈沙 可調式易錯 PCR 試劑盒

產品及特點

易錯PCRError-prone PCR)是利用Taq DNA多聚酶不具有3′→5′校對功能的特性,在一定條件下(如不同的dNTP濃度、Mg濃度和MnCl2存在)能夠按較高的機率引入隨機引入突變。如果有適當的選擇方法,則可從構建的突變庫選出所需突變體。本產品是在本公司的易錯PCR試劑盒的基礎上改進而得,本

產品具有下列特點:

1. 即開即用,十分簡單方便,尤其在生物制藥和酶學研究領域顯示出了它的*性。

2. 配方經過精心優化,實驗人員在一定范圍內可以控制突變率,一輪PCR的突變率范圍在2-8突變/1000bp,更高的突變率可以通過多輪PCR達到。

3. 可用于連續易錯PCRsequential error-prone PCR),只需把上一次易錯PCR的產物用作下一次易錯PCR的模板即可,使每一次獲得的小突變累積而產生重要的有益突變。

4. 可以擴增的DNA片段更長,達到2kb,對于2kb以上的產物,建議分段擴增。

5. 本試劑盒足夠10030uL體系的易錯PCR

6. 本產品只能用于科研。

規格及成分

本產品采用五孔盒包裝

成份

編號

規格

包裝材料

可調易錯PCR專用 Taq DNA聚合酶(5U/uL

101005c

50   uL

0.5mL紅蓋管

5×可調易錯PCR Mix(含dNTP

211216a

600   uL

0.5mL黃蓋管

可調易錯PCR專用MnCl2

211216c

300   uL

0.5mL紫蓋管

可調易錯PCR專用dGTP

211216d

300   uL

0.5mL藍蓋管

10×可調易錯PCR追加dNTP

211216e

300   uL

0.5mL本色管

使用手冊

211216sc

1

運輸及保存

低溫運輸,-20℃保存, 有效期為一年

自備試劑

引物、DNA模板、常規PCR試劑盒

使用方法

1. 將引物稀釋到10uM。引物也是決定易錯PCR成敗的關鍵因素,設計引物時要保證其Tm70℃,長度在25-30nt之間,GC含量在45%-60%之間,3GC含量低,并且沒有發夾結構。

2. 用自備易錯PCR引物和自備的常規PCR試劑擴增制備易錯DNA模板(常規PCR產物),膠回收并準確確定濃度。注意:易錯PCR的模板一定要用膠回收的常規PCR產物,因為膠回收會可以把電泳不可見的非特異性擴增片段去除,否則這些片段由于也是用易錯PCR引物擴增所得,在易錯PCR擴增時也會被擴增,產生競爭抑制,降低靶分子的擴增效率。

3. 將回收的DNA片段(模板)稀釋到1ng/uL 10ng/uL100ng/uL三個濃度。注意:模板使用量是影響突變率的最重要因素,模板DNA為非突變DNA,擴增產生的DNA為突變DNA,易錯PCR體系最終DNA量是基本固定的,因此模板DNA使用量越大,則突變DNA在終產物中的相對比例就越低,突變率就越低。故建議同時測試三個模板用量。如果都成功,則優先選用模板濃度低的PCR產物進行分析。

4. 根據每1000bp的預期突變數按下表確定30uL易錯PCR體系中MnCl2dGTP的用量(這是在模板DNA不超過1ng的前提下的數據)。表中的Mn表示可調易錯PCR專用的MnCl2, dG表示可調易錯PCR專用的dGTP

預期突變數

2

3

4

5

6

7

8

Mn用量(uL

0

1.0

2.5

4.0

4.0

4.0

4.0

dG用量(uL

0

0

0

1.0

2.0

3.0

4.0

5. 設置30uL體系的可調易錯PCR:第一次建議設置3個模板濃度。在3干凈的PCR管中,分別加入下列成分。最后加可調易錯PCR專用MnCl2

成分

模板用量1

模板用量2

模板用量3

可調易錯PCR   Mix, 5×

6   uL

6   uL

6   uL

可調易錯PCR 專用dGTP

根據上步用量表表選擇

根據上步用量表表選擇

根據上步用量表表選擇

自備DNA模板

1   uL 1ng/uL

1   uL 1ng/uL

1   uL 1ng/uL

自備PCR引物 (10 uM each)

1   uL each

1   uL each

1   uL each

可調易錯PCR專用 Taq DNA聚合酶

0.5   uL

0.5   uL

0.5   uL

可調易錯PCR 專用MnCl2

根據上步用量表表選擇

根據上步用量表表選擇

根據上步用量表表選擇

自備超純水

補水到30uL

補水到30uL

補水到30uL

6. 按已經優化的常規PCR條件進行易錯PCR

PCR前變性

94 3分鐘

易錯PCR(循環30-60

94 1分鐘

60 1分鐘

72 3-10分鐘

注:由于易錯PCR含高濃度的鎂離子,因此容易形成引物二聚體,因此需要使用較高的復性溫度,以避免小片段擴增產物競爭性抑制PCR。易錯PCR一般不需要熱啟動,也不需要在易錯PCR結束后做延伸處理。易錯PCR循環次數越多,突變DNA(擴增產物)與非突變DNA(原始模板)的比例就越高。此外在突變率和模板長度恒定的情況下,擴增次數越多,發生突變的絕對數就越高,在同一模板上發生的突變位點數就越多,所以如果需要,可以做303540455055607個循環數的比較

7. 易錯PCR結束后,取3uL進行電泳檢查。

8. 如果有預期大小的PCR產物,則全部電泳,進行膠回收,再進行克隆和測序等后續操作。如果需要增加突變率,可以選擇一個突變后的DNA為模板,再進行下一輪易錯PCR

9. 如果沒有預期大小的PCR產物,可以按下列操作追加進行一輪常規PCR(追加PCR)。

10. PCR管中,加入3uL 10×可調易錯PCR專用追加dNTP27uL電泳剩下的PCR體系中,按下表進行追加PCRchasing PCR)。注意追加PCR只做20次循環。

步驟

參數

循環數

追加PCR

94 1分鐘

循環20

60 1分鐘

72 1分鐘

11. 追加PCR結束后,再電泳檢測。如果有條帶,再進行克隆和測序等后續操作。如果需要增加突變率,可以選擇一個突變后的DNA為模板,再進行下一輪易錯PCR

12. 如果沒有預期大小的PCR產物,則需要分析原因

疑難解答

Q:現象:沒有PCR產物。

A:可能原因:一是引物沒有優化,可以重新設計引物;二是模板DNA太少,可以增加用量;三是模板不純,最好先膠回收;四是DNA溶液中有EDTA,可以適當補加Mg++

Q:現象:太多的PCR條帶或PCR條帶模糊一片。

A:可能原因:一是模板有膠回收、二是PCR循環數太多;三是復性溫度太低;四是引物沒有優化;五是PCR條件沒優化,可以使用touch-down PCR

Q: 如果需要更高的突變率,如何辦?

A: 可以使用連續多次易錯PCR來提高突變率。但最好先用膠純化回收易錯PCR片段,再用于下一輪易錯PCR

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