單細胞可視化分選系統(tǒng)——isoPick
單細胞可視化分選系統(tǒng)——isoPick是英國iotaSciences公司新推出的一款基于GRID技術、高通量、高自動化的單細胞可視化分選系統(tǒng)。isoPick采用微射流技術,利用界面張力對細胞培養(yǎng)基(或干細胞涂層)進行重塑,在培養(yǎng)皿上雕刻出單獨的細胞腔室GRID。isoPick可以在 6 厘米培養(yǎng)皿上創(chuàng)建 256 個單細胞腔室GRID陣列,并將細胞以納升體積全自動地分配到各個 GRID 單細胞腔室中,通過isoPick的光學顯微鏡可以清楚地看到 GRID 室中的單細胞?;贕RID技術和光學成像信息,isoPick可以確保分選出的細胞100%為單細胞。
設備特點
- 全自動化流程
- 操作簡單,對細胞無損傷
- 結果可追蹤
- 分離效率高達100%
- 直接轉(zhuǎn)移到PCR管或96孔板
- 結構緊湊,體積小
傳統(tǒng)單細胞分離手段無法保證所得的樣品內(nèi)只有一個單細胞,有可能有多個細胞或細胞團,導致下游的實驗出現(xiàn)誤差。單細胞可視化分選系統(tǒng)—isoPick采用的GRID技術結合圖像信息分析,結果可追蹤,保證100%準確的單細胞分選。而且isoPick分選條件溫和,可以顯著提高分選單細胞的存活率。同時isoPick可將單細胞樣品按照特定的體積直接轉(zhuǎn)移到96孔板或PCR管中,無縫銜接單細胞下游應用,確保后續(xù)單細胞組學信息完整性。
應用領域
單細胞分選 | 單細胞克隆 | 單細胞組學 | |
100%準確的單細胞分選效率 | 顯著提升單細胞克隆的存活率(單克隆率) | 極大地簡化單細胞組學步驟 | |
技術優(yōu)勢 | 傳統(tǒng)單細胞分選方法無法保證所得的樣品中只有一個單細胞,而isoPick采用GRID單細胞腔室分離與光學信號驗證相結合的分選技術,能夠保證分選所得的單細胞樣品中只有一個單細胞。 | isoPick可以高效分離hiPSCs單細胞,用于構建單克隆細胞系。isoPick對敏感單細胞處理溫和,能夠確保更高的單細胞存活率,達到更佳的克隆生長效果。 | isoPick可以將1.5~200 µl的單細胞樣品直接轉(zhuǎn)移至PCR管帶或96孔板中,無縫銜接后續(xù)單細胞測序scWGA流程,極大地簡化單細胞組學步驟。 |
單細胞分選前后的GRID細胞腔室 | 包被不同基質(zhì)的96孔板的單細胞hiPSC集落 | 單細胞的WGA結果 |
部分用戶單位
部分應用案例
人類誘導多能干細胞(hiPSCs)的單細胞克隆
人類誘導多能干細胞(hiPSCs)構建單克隆細胞系培養(yǎng)步驟繁瑣,細胞對異常的處理和操作非常敏感,傳統(tǒng)單細胞分選容易導致細胞和遺傳毒性應激的積累,進而導致不良分化和多能性喪失。
使用isoPick可以溫和、自動地將人類誘導多能干細胞(hiPSCs)進行單細胞分選,以高效率培養(yǎng)hiPSCs單克隆細胞系,顯著提高了細胞分離與克隆效率。
K562細胞單細胞測序
傳統(tǒng)單細胞測序需對單細胞進行全基因組擴增(WGA),但傳統(tǒng)單細胞WGA受限于如何獲得單個細胞并轉(zhuǎn)移到小體積的WGA反應中。
使用isoPick自動將K562細胞拾取并轉(zhuǎn)移至含3.5 µl scWGA試劑的PCR管中,并無縫銜接scWGA反應。瓊脂糖凝膠電泳結果顯示(下圖),單細胞WGA的DNA樣本(+)中兩種基因均被特異性擴增,而陰性對照(-)沒有這兩種擴增產(chǎn)物,符合預期。
對人類誘導多能干細胞 (hiPSCs) Prime 編輯構建工程細胞系
Prime 編輯可在 HEK3 基因座中高效精確插入三個核苷酸,用于構建工程細胞系hiPSCs。通過引入靶標特異性 pegRNA 來編輯單個或多個基因組位點,以進行精確有效的基因組編輯,促進疾病建模和功能遺傳學研究。
Prime 編輯使用與逆轉(zhuǎn)錄酶融合的 Cas9 切口酶,將 DNA 序列從“Prime 編輯"引導 RNA (pegRNA) 復制到特定基因座。通過Prime 編輯將多西環(huán)素誘導型 Prime Editor 蛋白 (PE2) 整合到 iPSC 細胞系的AAVS1 基因組,之后使用isoPick分選轉(zhuǎn)入靶基因的hiPSCs細胞系,以確保細胞的單克隆性。(見上圖)
該研究使用isoPick來確保工程細胞系的單克隆性與準確性。
參考文獻:Bharucha N, Ataam J A, Gavidia A A, et al. Generation of AAVS1 integrated doxycycline-inducible CRISPR-Prime Editor human induced pluripotent stem cell line[J]. Stem Cell Research, 2021, 57: 102610.
膠質(zhì)母細胞瘤(GBM)通過表觀遺傳免疫編輯獲得骨髓相關轉(zhuǎn)錄程序以引發(fā)免疫逃逸
研究人員通過將多形性膠質(zhì)母細胞瘤干細胞 (GSC) 連續(xù)移植到免疫活性宿主中,發(fā)現(xiàn) GSC 通過建立增強的免疫抑制腫瘤微環(huán)境來免疫逃逸。從機制上講,GSC通過表觀遺傳免疫編輯過程引起,其在免疫攻擊后強制執(zhí)行 GSC 中穩(wěn)定的轉(zhuǎn)錄和表觀遺傳變化。研究中使用Irf8敲除細胞系實驗證明,Irf8的激活是細胞免疫逃逸的一個重要因素,且在體內(nèi)可能通過IFNγ介導的激活發(fā)生。該研究使用isoPick構建Irf8克隆敲除系。
參考文獻:Gangoso E, Southgate B, Bradley L, et al. Glioblastomas acquire myeloid-affiliated transcriptional programs via epigenetic immunoediting to elicit immune evasion[J]. Cell。
此產(chǎn)品不用于醫(yī)療及臨床,僅用于科研或動物實驗