1953年,科學家詹姆斯-沃森和弗朗西斯-克里克發現了DNA分子的雙螺旋結構,遺傳學的研究進入到分子層次,人們可以更深層的了解遺傳信息的構成和傳遞途徑(圖1A)。近年,科學家在人類癌癥細胞中發現一種四重螺旋體DNA分子——G-四鏈體(G-quadruplex)。它是由富含串聯重復鳥嘌呤(G)的DNA或RNA折疊形成的高級結構。G-四分體(G-quartet)是四鏈體的結構單元,由Hoogsteen氫鍵連接4個G形成環狀平面,兩層或以上的四分體通過π-π堆積形成四鏈體(圖1B)。
有研究表明,G-四鏈體更多的出現在癌細胞等快速分裂的細胞中,與癌基因的啟動子區域和DNA鏈的端粒區域相互作用。因此,G-四鏈體結構與DNA復制過程有著緊密聯系,對于細胞分裂和增殖非常關鍵[1]。那么,通過靶向調控G-四鏈體結構將有望成為選擇性抑制癌細胞增殖的新途徑,G-四鏈體也成為了癌癥治療藥物的重要靶標。
圖1.A:James Dewey Waston(左)& Francis Harry Compton Crick(右)
B:G4-DNA的3D結構
鑒于G4-DNA參與到很多生物過程當中,開發用于檢測和可視化細胞中 G4-DNA 結構的工具也尤為重要。倫敦帝國理工學院的研究人員開發了一種能夠在活細胞中檢測G4-DNA的熒光探針——DAOTA-M2,為人們揭開了這種結構的神秘面紗 [2]。
這種探針具備良好的活細胞滲透性和低細胞毒性,在與G4-DNA結合時會發出熒光,可以用來觀察G4-DNA是如何與活細胞內的其他分子相互作用的。并且當DAOTA-M2與不同的核酸拓撲結構結合時,將顯示出不同的熒光壽命信息,進而可以非常精準的區別雙螺旋DNA和G4 DNA(圖2),因為與四鏈體結合時熒光壽命更長(圖3)。
圖2. 熒光壽命置換測定的示意圖:競爭對手結合后,DAOTA-M2 從 G4-DNA 轉移到 dsDNA環境,導致其熒光壽命縮短
圖3 DAOTA-M2染色的活細胞U2OS細胞核DNA的FLIM分析(a)以 512 × 512 分辨率(λex=477 nm,λem=550–700 nm)記錄的熒光強度圖像,紅線表示用于 FLIM 分析的核分割(b) 來自 a 的 FLIM 圖,顯示在平均壽命 (τw) 9ns(紅色)和 13ns(藍色)之間(c) 平均核強度與平均核壽命(藍點)的二維相關性(d)單個原子核的放大 FLIM 圖 - 顏色代表壽命,由 9ns(紅色)和 13ns(藍色)之間的顏色梯度條定義
G4-DNA的生物功能是通過動態的折疊和打開實現。在細胞內,G4-DNA可以自發折疊,但其打開是由專門的解旋酶來完成。并且在接下來的研究中,科學家發現哺乳類動物中的DNA 解旋酶 FancJ 和 RTEL1的表達量減少將會導致DAOTA-M2熒光壽命變長(圖4)[3]。因此可以直接利用DAOTA-M2熒光壽命的變化監測G4-DNA在活細胞中的動態變化。
圖4,減少 FancJ或RTEL1 解旋酶表達如何導致更長的 DAOTA-M2 壽命 (τw)的示意圖
G4-DNA被認為是潛在癌癥治療藥物靶點,因此評估給定的 G4-DNA靶向藥物與該結構結合的能力將非常有用。通過不同處理后DAOTA-M2的熒光壽命變化,結果顯示雙羧酸功能化的Ni(Ni-salphen)與G4-DNA有很強的靶向結合能力,會在短時間內導致DAOTA-M2熒光壽命迅速下降。(圖5)
圖5. 加入結合劑1-7hr的DAOTA-M2 的代表性 FLIM 成像結果(顯示在 6ns(紅色)和 14ns(藍色)之間)共孵育后 使用 DMSO(對照)、Zn-salphen、Nisalphen 。比例尺:20 μm
在以上的科研工作中,不難發現,精準的檢測方法是必須的,比如貫穿于整篇文獻中的FLIM技術。FLIM(Fluorescence Lifetime Imaging,熒光壽命成像):是一種基于熒光壽命的顯微成像技術,其成像結果提供像素位點的壽命信息,使得我們在熒光強度成像之外,能更加深入地對樣品進行功能性測量。熒光壽命成像具有不同于熒光強度成像的眾多優點,如不受熒光物質濃度、光漂白、激發光強度等因素的影響。會因為分子構象、分子間相互作用、分子微環境、生理狀態等條件改變而發生變化。Leica全新STELLARIS 8 FALCON熒光壽命成像系統,搭載新一代白激光(440-790nm)以及HyD X高靈敏度專用檢測器,提供超快速、多維度熒光壽命成像解決方案。
將特異性探針與FLIM相結合使用,不僅可以用來監測活細胞細胞核中G4-DNA的形成,以及判定小分子藥物與G4-DNA的相互作用,還可以應用于G4-DNA靶向藥物的篩選。這些信息將為癌癥的診斷和治療帶來了新啟示,更有助于靶向性新療法新藥物的開發。
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