蛋白組學技術服務之iTRAQ
iTRAQ(Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation)是一種用于蛋白質組學研究中的同位素標記技術**。這種技術使得研究者能夠同時對多達
8個不同樣本中的蛋白質進行相對和絕對定量分析。iTRAQ技術自2004年由美國應用生物系統公司推出以來,已成為蛋白質組學研究的重要工具。下面將進一步探討
iTRAQ技術的工作原理、主要特點及其在科學研究中的應用:
1. iTRAQ技術的工作原理
標簽試劑結構:iTRAQ試劑由三部分組成:報告基團、平衡基團和肽反應基團。報告基團的質量分別為113Da、114Da、115Da、116Da、117Da、118Da、
119Da和121Da(對于8-plex試劑),平衡基團則通過不同的質量來確保所有標記肽段在一級質譜中具有相同的總質量[^1^][^2^]。
一級質譜:在不同樣本中的同一肽段被不同iTRAQ試劑標記后,由于總質量相同,它們在一級質譜中表現為一個峰。這樣可以將不同樣本中的同一肽段在質譜圖中
合并為一個信號,簡化了后續的分析。
二級質譜:在二級質譜分析中,iTRAQ標簽試劑化學鍵斷裂,釋放出報告基團的信號。這些信號的強度用于定量分析,而肽段碎片離子則用于定性分析。通過比較
不同報告基團的信號強度,可以獲得不同樣本中相同肽段的相對定量信息。
2. iTRAQ的主要特點
高通量:iTRAQ技術能夠同時對多達8個樣本進行定量分析,大大提高了實驗通量。這使得研究者可以在單次實驗中比較多個條件下的蛋白質表達差異。
高靈敏度:相比傳統的二維凝膠電泳,iTRAQ能夠檢測到更低豐度的蛋白,并且能準確測量較小的蛋白變化(在1.3至1.6倍之間),從而提供了更高的靈敏度。
廣泛的應用范圍:iTRAQ不僅能夠檢測胞漿蛋白,還能檢測膜蛋白、核蛋白等。無論是高分子量、酸性、還是堿性蛋白,iTRAQ技術都能有效地進行鑒定。
定性與定量同步:iTRAQ技術在一次實驗中即可完成蛋白質的定性和定量分析,提高了實驗效率。
3. iTRAQ技術的應用
醫學研究:iTRAQ技術已廣泛應用于腫瘤標志物的篩選,通過比較腫瘤組織和正常組織的差異蛋白,研究者能夠找到潛在的診斷和治療靶標。
藥物作用機制:利用iTRAQ技術,可以篩選出與藥物作用相關的蛋白,進而研究藥物的作用靶點和機制。
疾病機理研究:iTRAQ技術有助于揭示疾病的發生和進展機制,發現新的生物學標志物,為疾病的預防和治療提供新的思路。
綜上所述,蛋白組學技術服務之iTRAQ在蛋白質組學研究中具有重要作用,其高通量、高靈敏度和廣泛的適用范圍使其成為研究蛋白質表達差異的重要工具。
從醫學研究到藥物開發,再到環境科學,iTRAQ技術的應用前景廣闊。研究者能夠更全面地了解蛋白質在不同生理和病理條件下的動態變化,從而為生命科學研究和
相關應用領域帶來新的見解和機遇。