iTRAQ定量蛋白質組學
- 公司名稱 武漢傲星生物科技有限公司
- 品牌 其他品牌
- 型號
- 產地
- 廠商性質 經銷商
- 更新時間 2024/3/11 11:07:52
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實驗介紹
iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)技術是一種多肽體外標記技術。該技術采用4-plex或8-plex同位素的標簽,通過特異性標記多肽的氨基基團,進行LC-MS/MS分析,可同時比較多種不同樣本中蛋白質的相對表達含量
實驗流程
*包括蛋白質定量、SDS-PAGE測試、酶解和質譜分析,對樣本質量及樣本之間的平行性進行初步判斷。
應用方向
生物領域各個研究方面,如:
? 農林領域:抗逆脅迫機制,生長發育機制,育種保護研究等
? 畜牧業:肉類及乳品質研究,致病機理研究等
? 基礎醫學、臨床診斷:生物標志物,疾病機理機制,疾病分型,個性化治療等
? 生物醫藥:藥物作用機理,藥效評價,藥物開發等
? 微生物領域:致病機理,耐藥機制,病原體-宿主相互作用研究等
? 海洋水產:漁業資源,海水養殖,漁業環境與水產品安全等
? 生物能源、環境科學領域:發酵過程優化,生物燃料生產,環境危定風險評估研究等
? 食品營養:食品儲藏及加工條件優化,食品組分及品質鑒定,功能性食品開發,食品安全監檢測等
數據分析
標準數據分析內容 | |
蛋白質總鑒定數量分析 | 蛋定與定量結果統計、差異結果統計、火山圖、聚類熱圖 |
差異蛋白質功能分析 | 亞細胞定位、結構域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作網絡分析 |
質量控制分析 | 肽段離子質量偏差分布、肽段離子得分分布、蛋白質豐度比分布 |
高級數據分析內容 | |
WGCNA共表達分析 | 獲得與表型強關聯的核心蛋白質 |
趨勢聚類分析 | 探討蛋白質的表達趨勢模式 |
技術優勢
? 具有2-8 plex標簽,可同時標記2-8組樣本進行表達差異分析
? 是一種體外標記技術,可標記動物、植物、微生物、臨床、體液或細胞等多種樣本
? 不同標簽混合后上機,具有較好的平行性,避免技術誤差,提高檢測效率
? 與凝膠方法相比,iTRAQ可發現膜蛋白、核蛋白、胞外蛋白、強堿和強酸蛋白以及小于10KD和大于200KD的蛋白質,對低豐度蛋白質亦有較好的檢出率