Fragment Analyzer 全自動毛細管電泳儀是由美國AATI公司研發生產的新型突變檢測及核酸片段分析系統。此系統是基于熒光檢測技術和毛細管電泳技術發展而來的新型DNA/RNA段分析儀器，它采用敏感的嵌入染料以及強大的LED光源，相較于傳統方法系統檢測靈敏度高、分辨率強、通量大和分析速度快。

Fragment Analyzer 全自動毛細管電泳儀采用并行毛細管電泳（CE）與熒光檢測技術相結合，能夠對DNA和RNA電泳分離檢測。毛細管列陣是并行毛細管電泳的基礎，根據毛細管列陣的毛細管數量分為96和12通道，每個毛細管首先注入可導電的分離膠，然后對毛細管兩端施加電場，96孔板中的預檢測樣品開始毛細管電泳。依據核酸片段長度不同在凝膠電泳中遷移速度不同的原理核酸樣品被分離檢測。當毛細管中核酸片段通過位于LED和CCD探測器組件之間的檢測窗口時被實時檢測。核酸檢測組件是由一個LED光源（470納米激發）、照相機鏡頭和CCD探測器組成的光學平臺。LED光源（470納米激發）激發核酸樣品中的嵌入染料產生熒光信號，然后通過相機鏡頭和特定的濾光器立體成像到CCD檢測器，把實時熒光信號轉換為實時電信號被軟件實時讀取，由此測繪每個樣品完整的核酸片段分布峰圖。