Ultrospec 3100 pro可見光分光光度計功能有：蛋白質測定（Bradford、Biuret、Lowry 和 BCA）及核酸量化/鑒定（DNA、RNA、寡核苷酸、理論™計算）用存儲方案。

Ultrospec 3100 pro可見光分光光度計具有內置的應用軟件，可測定和計算 Cy3、Cy5、熒光素或其它用戶的染料與 cDNA 探針的結合情況。 這些數據是在微陣列結合研究前對各標記探針進行濃度優化的必需數據。

各個探針的紫外線/可見光掃描數據顯示在高分辨率顯示器上，這樣都可檢查各探針獲得的核酸和熒光團成分的完整性情況。 啟動 RNA 含量并輸入稀釋因子時，將自動計算和顯示產量、熒光團含量，以及結合效率。 此軟件對于標記了CyScribe 熒光素的探針套件特別有用。

隨儀器提供 8-位置樣本更換器標準件；儀器可將數據打印到標準 Centronics 并行打印機，并可將結果導出到 PC 上。 基于其選擇豐富的內置軟件、各種各樣的附件（包括吸液器）以及 GLP 自檢診斷功能，Ultrospec 3100 pro 成為了一套可靠、精巧的一體化系統，用于操作繁忙的實驗室，包括那些需要將數據存儲到 PC 機的實驗室。 Ultrospec 3100 pro 在需要時也可與 SWIFT II 應用軟件共用。