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關于內參蛋白Actin,那些你不知道的事兒

來源:愛必信(上海)生物科技有限公司   2024年10月22日 11:12  

Actin(肌動蛋白)是細胞骨架蛋白的重要組成蛋白之一,分子量為43kDa,在物種之間高度保守。根據Actin的功能和組織定位的不同,主要分為三類:α-肌動蛋白(α-actin)、β-肌動蛋白(β-actin)和γ-膜肌動蛋白(γ-smooth muscle actin)。

1)α-actin存在于肌肉組織中,包括平滑肌和心肌,參與了細胞的收縮和肌肉運動;

2)β-actin廣泛存在于細胞各個部位,包括細胞質和細胞骨架,它參與了多種細胞活動,如細胞形態變化、細胞遷移和細胞分裂;

3)γ-smooth muscle actin主要表達于平滑肌細胞,參與平滑肌收縮和組織修復。

 

其中,β-actin常被用作內參蛋白,從而被大家所熟知,它可以作為實驗中蛋白負載量和表達水平的標準參照物。在WB實驗過程中,通過檢測和對比目標蛋白與β-肌動蛋白的相對表達水平,可以對目標蛋白的表達進行定量和比較。然而,Actin的作用遠遠不止內參蛋白那么簡單,根據Nature、Science、Cell等zhi名期刊上發布的相關研究結果表明,它在囊泡運動、細胞遷移、吞噬和細胞內運輸等生物過程和疾病研究中都發揮著重要的功能作用。接下來,就和大家一起來聊聊關于Actin那些你不知道的事兒~

 

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一、Actin的研究方案

 

1、肌動蛋白聚合物的檢測

 

在生理條件下,球狀肌動蛋白(G-actin)很容易聚合成絲狀肌動蛋白(F-actin),同時發生ATP水解(圖1)。肌動蛋白在體外可以從兩端聚合,由于聚合速度快慢的差異,導致肌動蛋白絲具有內在極性,我們通常將聚合速度快的一端稱為正端或倒鉤端,而聚合速度慢的那一端稱為負端或jian端。

 

圖1 肌動蛋白絲的雙螺旋結構

 

肌動蛋白的聚合取決于肌動蛋白單體對細絲末端的親和力,肌動蛋白單體存在一個臨界濃度(CC),當低于該濃度,肌動蛋白不會聚合;當單體濃度高于CC時,肌動蛋白將發生聚合,直到游離單體濃度等于CC。然而,當我們在體外研究肌動蛋白時,它的程度則取決于所使用的條件。舉個例子,在4°C條件下,肌動蛋白在2mM Mg2+和50mM KCl溶液中的CC值為0.03mg/mL,當這些離子不存在時,CC值則會超過3.0mg/mL。因此,我們可以通過改變離子類型和濃度,來改變聚合物的數量。

 

通過檢測肌動蛋白聚合物,可以評估不同化合物對肌動蛋白功能的影響,目前常用的檢測方法有以下4種:

 

1)芘結合熒光法

較通用、較靈敏、最易于操作的檢測方法,對照樣本和測試樣本與少量芘連接的肌動蛋白混合,然后用熒光計跟蹤聚合情況。芘肌動蛋白單體與聚合物結合后,熒光信號增強高達20倍。肌動蛋白聚合分為三個階段,就像微管組裝一樣,這三個階段分別是成核、生長和穩態。聚合的程度可由穩定狀態的熒光水平來表示,加入phalloidin(鬼筆環肽)可測量出上限,將CC降至0.01mg/mL以下。這種檢測方法的準確率超過95%,并且在檢測過程中不會干擾樣品。

 

圖2 通過芘肌動蛋白熒光測量肌動蛋白的聚合情況

 

2)DNase酶抑制法

DNase酶抑制法是基于G-actin與DNase 1之間高親和力的相互作用,從而抑制DNase的活性。這種檢測方法的大優勢在于它能區分G-actin和F-actin,因此,它通常被用于選擇性地測定細胞提取物中單體和絲狀肌動蛋白的量。此外,DNase酶抑制法還可以用于研究從肌動蛋白絲生成G-actin的結合蛋白。

 

3)粘度檢測法

根據需要檢測的聚合物差異性,粘度檢測法可以分為高剪切或低剪切測量。如果是想測量短(1µm)和中(3-5µm)肌動蛋白絲之間的微小差異,那么可以選擇高剪切法;如果要確定長絲樣本的差異,則需要使用低剪切法。雖然粘度檢測法能很好地比較兩個樣品之間的細絲交聯情況,但最大的缺點是需要儀器設備、剪切細絲不太準確,并且當在測量肌動蛋白組裝的方法時會干擾反應。

 

4)Spin-down實驗

Spin-down檢測法的原理是利用沉降差異來分離F-actin和G-actin,由于檢測時間有限,這種方法的主要用途是獲得穩定狀態下肌動蛋白聚合物的定量值。該方法可與芘結合熒光法或DNase酶抑制法聯合使用,以定量測定反應時間過程中肌動蛋白聚合物的數量。由于這種方法對待測樣品具有破壞性,因此只有在對樣品進行了所有其他測量方法后才能使用。這種檢測方法還存在另一個缺點,那就是小的肌動蛋白寡聚體不會沉淀,因此定量值可能會高于實際上清液中肌動蛋白單體的數量。

 

至于選擇哪種方法來檢測肌動蛋白聚合物,則取決于實驗室可用的設備和所需的靈敏度,也為大家總結了這四種方法的對比,供大家參考選擇:

 


檢測方法

原理

優勢

缺點

芘結合熒光法

基于聚合過程中芘結合肌動蛋白的增強熒光

通用性強;靈敏度高;易于操作

需要儀器(熒光光度計)

DNase酶抑制法

基于G-actin與DNase 1之間高親和力的相互作用

能夠區分G-actin和F-actin

結果重復性可能會有10-20%的差異

粘度檢測法

通過剪切微絲來檢測的聚合物差異性

能很好地比較兩個樣品之間的細絲交聯情況

需要儀器設備;剪切細絲不太準確;有干擾反應

Spin-down實驗

利用沉降差異來分離F-actin和G-actin

可與其它方法聯合使用;易于操作

對待測樣品具有破壞性;定量值不夠準確


表1 肌動蛋白聚合物的檢測方法對比

 

2、肌動蛋白的染色

 

肌動蛋白另一個重要的研究方案,就是它在細胞或組織中的熒光成像,最常見熒光染料是鬼筆環肽偶聯物(phalloidins)。鬼筆環肽,又稱鬼筆鵝膏素,最初是從毒蘑菇鬼筆鵝膏(Amanita phalloides)中分離到的一種七肽毒素,以ji高的親和力和特異性結合F-actin,不會結合G-actin。鬼筆環肽對大小纖維的親和力相近,在許多不同的動植物物種的肌肉和非肌肉細胞中,基本都按照一個肌動蛋白亞基與一個鬼筆環肽分子的化學計量比結合。鬼筆環肽的非特異性結合幾乎可忽略,染色和未染色區域的差異極其明顯。此外,還有上文提到的,鬼筆環肽使得肌動蛋白聚合CC值降至1μg/mL,可用作一種聚合增強劑,產生的復合物高度穩定(解離常數約3×10–8M),能夠抑制細胞松弛素、碘化鉀和溫度上升引起的去聚合和去組裝活性。

 

由于熒光標記的鬼筆環肽不具有細胞透性,因此多用于固定細胞的肌動蛋白染色。帶正電或負電的熒光染料會通過非特異性的離子相互作用與其他蛋白質結合,導致產生更高的背景;Actin-stain系列的鬼筆環肽熒光探針是非離子型的,因此更有助于獲得理想的低背景結果。

 

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3、肌動蛋白的翻譯后修飾

 

目前,關于肌動蛋白的翻譯后修飾(PTM)研究也越來越多,PTM是高度動態且通常可逆的過程,其中蛋白質的功能特性能夠通過在其氨基酸殘基上添加化學基團或另一種蛋白質而改變。肌動蛋白是PTMs的主要底物,它可以經歷至少17個PTMs,包括ADP-ribosylation、arginylation、dimethylation、phosphorylation、oxidation、nitration、O-GlcNAcylation、ubiquitination、SUMOylation、acetylation、carbonylation、isaspartylation、transglutamination、malonylation、glutathionylation、nitrosylation、crosslinking/isopeptide bonding。在研究翻譯修飾后的肌動蛋白時,常用到的就是生物素肌動蛋白,它是一種具有多種用途的衍生物,可與鏈霉親和素結合使用,作為細胞中肌動蛋白動態的探針。生物素肌動蛋白還可用于體外檢測,標記肌動蛋白或使用鏈霉親和素磁珠從復雜的混合物中選擇性地純化肌動蛋白。

 

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二、Actin的最新研究進展

 

最新研究表明,衰老會導致肌動蛋白表達和動力學發生變化,從而引發多種與年齡相關的疾病,包括癌癥、血管疾病和神經退行性疾病1。對酵母的研究發現,肌動蛋白細胞骨架對營養代謝甚至決定壽命都至關重要2

研究表明,隨著年齡的增長,卵母細胞的數量和質量都會下降,從35歲到更年期,生育能力會明顯下降。能量代謝是導致卵母細胞質量下降的機制之一3,其中肌動蛋白對哺乳動物的繁殖至關重要,肌動蛋白動力學的變化會直接影響與年齡相關的生育能力和生殖結果。

 

1、肌動蛋白在減數分裂中的作用

 

哺乳動物的單倍體卵子由二倍體卵母細胞通過減數分裂發育而成,受精后,卵子進行第二次染色體分裂,分離姐妹染色單體,染色體和隨后姐妹染色單體的分離取決于紡錘體的功能。紡錘體由微管組成,而微管由微管蛋白亞基構成。紡錘體微管負責染色體排列,以促進分裂。最近的研究表明,除微管蛋白外,紡錘體肌動蛋白對紡錘體的正常功能也至關重要4。紡錘體肌動蛋白有助于將微管捆綁成功能性k纖維,而紡錘體肌動蛋白缺失則會導致k纖維穩定性降低和染色體分離錯誤5。除了紡錘體的功能外,肌動蛋白的動力學對細胞分裂也至關重要,因為肌動蛋白會形成一個收縮環,將新形成的子細胞分開。減數分裂和受精之后,新形成的胚胎進行有絲分裂,細胞有絲分裂所需的紡錘體微管與減數分裂紡錘體微管的不同之處在于,它是從中心體上成核的。因此,肌動蛋白還參與了有絲分裂,而不僅僅局限于減數分裂,這凸顯了肌動蛋白在胚胎發育過程中的重要性6

 

2、與年齡相關非整倍體的肌動蛋白動力學

 

在分離之前,同源染色體通過黏連蛋白固定在一起,與此同時,姐妹染色單體在其中心粒上仍被黏連蛋白結合。在減數第一次分裂過程中,同源染色體之間的黏連蛋白被裂解,但姐妹染色單體之間的黏連蛋白受到保護。姐妹染色單體的過早分離會導致染色體分離錯誤,造成卵子中染色體數目不正確,從而產生非整倍體7

 

在人類中,最常見的非整倍體導致的疾病是三體綜合征,比如21-三體綜合征(也叫唐氏綜合征)和克氏綜合征(47,XXY)。在高齡產婦中,非整倍體的發生率較高,造成這一現象的可能原因是衰老卵母細胞中黏連蛋白的耗竭8。然而,Dunkley和Mogessie認為,僅靠黏連蛋白的耗竭并不能wan全解釋非整倍體迅速增加的原因,就在去年,他們的研究揭示了肌動蛋白能夠有效降低與年齡相關的卵子非整倍體的發生9。結果表明,F-actin負責在衰老卵子的黏連蛋白耗竭后維持姐妹染色單體的結合,此外,破壞年輕卵子中的F-actin會導致與衰老卵子類似的染色體過早分離。為了證實這一作用,他們還發現穩定的F-actin可減少衰老卵子中染色體的過早分離,更重要的是,這些結果都有依賴于肌動蛋白的動力學。作者推測,F-actin可能抵消了紡錘體微管的拉力。

 

圖3 破壞F-actin會加速幼卵中類似衰老的染色體過早分離(Dunkley et al. 2023)

 

3、衰老表觀基因組和肌動蛋白動力學

 

表觀遺傳變化是指在不改變基因本身的情況下導致基因表達發生變化的修飾,這些改變包括甲基化、乙酰化、磷酸化和Sumo化,可在DNA、RNA和組蛋白上被發現10。DNA甲基化是衰老的一種生物標志物,能夠確定組織在整個生命周期中的年齡11

 

白藜蘆醇(resveratrol)是一種存在于葡萄皮和紅葡萄酒中的多酚,一直以來都被認為是抗衰老劑和對多種疾病有益的補充劑12。根據臨床前的動物研究,白藜蘆醇能夠改善生殖衰老13-14。一些研究強調,人類的生育能力仍存在很多未知數15,并且白藜蘆醇在生殖衰老中的作用機制仍不甚明了。

 

最近,白藜蘆醇能改善雌性小鼠生殖能力的機制終于被證實了,它能逆轉與衰老相關的基因表達變化,并減少衰老卵母細胞的整體甲基化16。在比較年輕小鼠、中年小鼠和老年小鼠的卵母細胞時,作者發現了許多差異表達的基因,主要是許多參與肌動蛋白動力學過程的基因表達下調。白藜蘆醇逆轉了衰老卵母細胞的這種效應,消除了肌動蛋白相關基因啟動子區域的甲基化,并恢復了它們的表達。

 

綜上所述,在卵子形成和胚胎發育過程中,肌動蛋白對正常的減數分裂和有絲分裂至關重要。此外,有跡象表明肌動蛋白直接參與染色質重塑17,這一點仍有待在生殖衰老的背景下進行探索。

 

參考文獻:

[1] Lai WF, Wong WT. Roles of the actin cytoskeleton in aging and age-associated diseases. Ageing Res Rev. 2020;58:101021.

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[3] Bao S, Yin T, Liu S. Ovarian aging: energy metabolism of oocytes. J Ovarian Res. 2024;17(1):118.

[4] Mogessie B, Scheffler K, Schuh M. Assembly and Positioning of the Oocyte Meiotic Spindle. Annu Rev Cell Dev Biol. 2018;34:381-403.

[5] Mogessie B, Schuh M. Actin protects mammalian eggs against chromosome segregation errors. Science. 2017;357(6353).

[6] Plessner M, Knerr J, Grosse R. Centrosomal Actin Assembly Is Required for Proper Mitotic Spindle Formation and Chromosome Congression. iScience. 2019;15:274-81.

[7] Nagaoka SI, Hassold TJ, Hunt PA. Human aneuploidy: mechanisms and new insights into an age-old problem. Nat Rev Genet. 2012;13(7):493-504.

[8] Herbert M, Kalleas D, Cooney D, Lamb M, Lister L. Meiosis and maternal aging: insights from aneuploid oocytes and trisomy births. Cold Spring Harb Perspect Biol. 2015;7(4):a017970.

[9] Dunkley S, Mogessie B. Actin limits egg aneuploidies associated with female reproductive aging. Sci Adv. 2023;9(3):eadc9161.

[10] Chen X, Xu H, Shu X, Song CX. Mapping epigenetic modifications by sequencing technologies. Cell Death Differ. 2023.

[11] Salameh Y, Bejaoui Y, El Hajj N. DNA Methylation Biomarkers in Aging and Age-Related Diseases. Front Genet. 2020;11:171.

[12] Berman AY, Motechin RA, Wiesenfeld MY, Holz MK. The therapeutic potential of resveratrol: a review of clinical trials. NPJ Precis Oncol. 2017;1.

[13] Liu M, Yin Y, Ye X, Zeng M, Zhao Q, Keefe DL, et al. Resveratrol protects against age-associated infertility in mice. Hum Reprod. 2013;28(3):707-17.

[14] Okamoto N, Sato Y, Kawagoe Y, Shimizu T, Kawamura K. Short-term resveratrol treatment restored the quality of oocytes in aging mice. Aging (Albany NY). 2022;14(14):5628-40.

[15] Ochiai A, Kuroda K. Preconception resveratrol intake against infertility: Friend or foe? Reprod Med Biol. 2020;19(2):107-13.

[16] Gou M, Li J, Yi L, Li H, Ye X, Wang H, et al. Reprogramming of ovarian aging epigenome by resveratrol. PNAS Nexus. 2023;2(2):pgac310.

[17] Klages-Mundt NL, Kumar A, Zhang Y, Kapoor P, Shen X. The Nature of Actin-Family Proteins in Chromatin-Modifying Complexes. Front Genet. 2018;9:398.

 

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