siRNA轉染的常見問題解答
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如何優化siRNA轉染?轉染少量的siRNA為何很重要?在siRNA轉染過程中為何應當避免細胞毒性?本文收錄了與siRNA轉染相關的常見問題,并附上專家的解答,希望能對您的實驗有幫助。
Q:我該如何優化siRNA轉染?
A:在實驗室中建立RNAi和研究每一種新的細胞系時,應當優化siRNA的轉染。HiPerFect Transfection Reagent Handbook中包含優化的有用信息(www.qiagen.com/HB/HiPerFect)。在優化實驗中,轉染效率可通過陽性對照(如AllStars Cell Death Control siRNA)的轉染來監控。應當優化的轉染因素包括:
試劑和siRNA的量
轉染時的細胞匯合度
分析前細胞和復合物的孵育時間
Q:轉染少量的siRNA為何很重要?
A:高濃度的siRNA轉染可能產生脫靶效應,即siRNA影響了部分同源或非同源基因的表達。研究表明,可能會對RNAi實驗產生誤導結果的脫靶效應可通過降低siRNA濃度而在很大程度上避免(1,2)。HiPerFect Transfection Reagent有助于siRNA的吸收,實現了低濃度下的基因沉默,而不損害knockdown的效率。
Q:在siRNA轉染過程中為何應當避免細胞毒性?
A:siRNA導入所引起的細胞毒性干擾了RNAi后的數據分析,因為表型分析不再可靠。影響數據分析的因素包括轉染試劑所引起的表型改變,壓力所引起的基因表達改變,以及不應當用于分析的死細胞的存在。
HiPerFect Transfection Reagent對細胞無毒性,不會引起液泡形成(這標志著細胞進程的破壞)。詳細的細胞周期和細胞形態學分析顯示mock轉染的細胞(只有HiPerFect Transfection Reagent)和未轉染的細胞之間無差異。
Q:順式轉染和反式轉染之間有什么差別?
A:在反式轉染的步驟中,siRNA先加在平板的孔中,然后才是轉染試劑。在復合物形成之后,加入細胞。順式轉染則相反,先在孔中加入細胞,然后才是復合物。反式轉染使用廣泛,特別對于高通量實驗,因為它容易自動化,轉染前siRNA可儲存在孔中,且使用了較少的材料,因為不需要在一塊單獨的板上開展siRNA-轉染試劑復合物的形成。
順式轉染 反式轉染
第1步 細胞 第1步 核酸
第2步 轉染復合物 第2步 HiPerFect Reagent
第3步 細胞
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