5月26日,CNHUPO|臨床蛋白質組學和糖組學學術研討會于上海勝利閉幕。此次研討會,諸多蛋白組學和糖組學專家闡述了組學技術在醫學/臨床研究中的應用,為未來從研究到臨床轉化探討了新的思路,開拓了更加廣闊的應用前景。
北京生命科學研究院邵峰院士
報告題目:Innate immunity to cytosolic LPS:Pyroptosis and beyond
報告主要內容:
大會由復旦大學陸豪杰教授致開幕詞,北京生命科學研究所邵峰院士做了題為“Innate immunity to cytosolic LPS:Pyroptosis and beyond”的報告,明晰了細胞焦亡與傳統細胞凋亡的區別,闡述了分子免疫機制:Caspase-4/5/11作為胞內LPS的受體,識別LPS的Lipid A部分,進而發生寡聚化而激活。這些細菌免疫受體活化后,均通過誘導組裝炎癥小體復合物進而激活膜打孔蛋白GSDMD,誘發細胞焦亡。
復旦大學生物醫學研究院副院長楊芃原教授
報告題目:疾病糖蛋白質組的定量質譜
報告主要內容:
從質譜技術發展歷史,到質譜如何幫助蛋白組學研究,再到質譜技術未來向臨床發展的展望:以MRM為基礎的質譜ELISA技術可以在臨床檢驗中逐步部分取代現有傳統ELISA,特別是檢驗具有群和網絡特征的關鍵蛋白。同時,運用Orbitrap技術的pGlyco 2.0提供給糖蛋白研究者又一有效的定量策略。
國家蛋白質科學中心·北京秦鈞主任
報告題目:胃癌的臨床蛋白組學研究
報告主要內容:
從蛋白質組學應用于臨床所面臨的問題,到未來蛋白質組學走向臨床的前景,秦鈞教授通過一些臨床研究實例,講述了如何在實踐中逐步克服臨床生物樣本、檢測手段等方面的局限性,描繪了蛋白質組學驅動轉化臨床的可行性。尤其是惡性腫瘤化療藥物靶點、免疫治療標志物、治療響應性標志物等,有望應用于臨床伴隨診斷。無論是在探索分子病理方面,抑或是實現臨床早診、治療領域,蛋白質組學都發揮著越來越重要的作用。蛋白質組學驅動的醫療時代(Proteomics-driven precision medicine)已經被開啟。
同濟大學田志新教授
報告題目:基于糖蛋白質組學的癌癥和癌癥干細胞生物標志物的分析
報告主要內容:
同濟大學田志新教授,做了在肝癌、乳腺癌研究中發現N-糖蛋白質標志物的報告,結合ZIC-HILIC富集、同位素二甲基標記、pentaHILIC-nESI-MS/MS(HCD,stepped NCEs)、GPseeker定性、GPseekerQuan定量,對HCC HepG2細胞中差異表達N-糖基化在完整水平上進行大規模位點和結構特異性的分離、鑒定和定量。
西湖大學郭天南教授
西湖大學的郭天南教授介紹了運用DIA技術結合PCT快速樣品前處理技術在臨床大隊列樣本研究中的應用,以及使用Orbitrap技術平臺建立人類多個組織蛋白質組學數據庫,為DIA和PRM分析提供便利。
賽默飛HRMS1-DIA方案廣受關注
大會報告中賽默飛應用經理周岳,帶來HRMS1-DIA技術在臨床大樣本蛋白質組學分析中的可行性評價:
經過來自9個國家和地區的11個實驗室,連續7天24小時運行,基于HRMS1-DIA工作流表現出長期運行中保持*的穩定性,在不同儀器及實驗室間產生的數據也有重現性以及提供蛋白質組學準確定量結果。HRMS1-DIA工作流可對醫學研究中的大隊列生物樣品進行高通量和深度的蛋白質組定量。
HRMS1-DIA方案優勢:
1、相對傳統DIA的二級碎片離子定量,基于超高分辨一級全掃描的HRMS1-DIA定量蛋白和多肽的數量和準確性都有顯著提高(蛋白鑒定數目提高10%,CV<10%)
2、在HRMS1-DIA工作流正常運行的狀態下,全部11個實驗室,平均可以鑒定到超過8000個蛋白(1% protein FDR),定量超過6000個蛋白。
3、在定量準確性方面,在1小時定量6000個蛋白,50000個肽段的超高通量下,HRMS1-DIA工作流提供93%的定量準確性。
4、超高80%的蛋白可以在每天、每個實驗室定量。
賽默飛HRMS1-DIA方案對于蛋白質組學的臨床轉化具有極為廣泛的參考價值,超高的穩定性、日間重復性成為臨床研究領域用戶值得期待的技術。
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