在高效液相分析檢測樣品的過程中，色譜柱會受到來自于樣品及色譜系統的污染，從而導致色譜柱耐用性差、壽命縮短。
來自于色譜系統的污染主要指，HPLC儀器系統中部件磨損而產生的固體顆粒，以及流動相系統過濾不*殘留的固體顆粒。來自于樣品的污染主要指，未*溶解的樣品或者已*溶解的樣品進入色譜系統中，由于樣品溶劑和流動相溶劑對樣品溶解存在的溶解度差異，導致沉淀析出污染系統。特別是對于中藥、天然產物、合成中間體及生物藥品的檢測，因基質的復雜性，色譜柱受污染的情況會更加嚴重。污染會導致色譜系統壓力升高、色譜柱塌陷、填料變色等，從而帶來檢測成本高，測試結果不準確等各種影響。
保護柱為色譜柱提供方便、經濟和有效的保護，延長了色譜柱的壽命，保證分析結果的重現性。隨著使用時間的增加，高效液相色譜柱分離效能下降，柱壓增高，其原因主要是由于色譜柱進口段的少量填料被污染引起的，而色譜柱整個柱床并未被破壞，使用保護柱，相當于在色譜柱前增加了一段額外的填料，起到了保護整個色譜柱的作用。
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