誤區1：HPLC 柱不可以反沖
這是不正確的。通常情況下液相色譜柱所設計的耐壓值是遠高于最大操作壓力的。換柱時反沖可以清洗柱頭一些具有強吸附性質的物質，我們沖洗出這些殘留物質也是為了防止壓力增大。但是如果你購買的色譜柱在柱頭使用了大粒度的填料，這時你反沖會沖出這一部分填料。因此你要先檢查一下自己使用的液相色譜柱再選擇是否反沖。
誤區2：所有的C18（L1）色譜柱都是一樣的
這是不正確的。在早期的HPLC體系中，C18是僅有的反向色譜的鍵合固定相，因此C18就作為了反向色譜柱的標準。但是時代不會一直停滯腳步，人們對于科學的追求與理解愈發深刻，更多的固定相出現了，誕生了許多C18色譜柱。雖然同樣是選用硅膠作為基體，但各自都有自己特定的填料鍵合合成工藝，因此色譜性能也不相同。所以單純的因為名稱都是C18色譜柱，想當然覺得性能都一樣是不對的。
誤區3：色譜柱里一旦進入空氣就會損壞
我們都知道當色譜柱不與色譜儀連接的時候，需確保色譜柱被緊緊地密封。但是在實際應用中，即使色譜柱的端部進入了少量的空氣也不是很嚴重的事情。當色譜柱連接到色譜儀上使用時，在系統初始加壓階段，在很短的時間內空氣就會被溶劑擠壓排出。所以，不要因為色譜柱進入了少量空氣就認為色譜柱已被損壞。
誤區4：保護柱是沒必要的
這也是太絕對的誤區，其實使用保護柱有很多好處。HPLC的移動相中常使用各種試劑，其中會混有一些不溶解物質或不純物質。多數不溶物通過使用篩板或膜濾器過濾移動相可以除去，但極細小的粒子還是無法*過濾。此外在移動相調制之后，還有通過空氣、容器、人體等有不溶物、不純物落入的可能性。這些不溶物、不純物質會污染柱、或使堵塞、或給分析帶來不良影響等。這時通過在色譜柱前安裝分析保護柱可以防止其產生，能起保護色譜柱的作用。相較于更換一根昂貴的分析柱，添加或更換保護柱只需要很少的花費。恒譜生液相色譜保護柱幾乎無死體積、便于更換，適用于UHPLC系統的高壓，將那些強保留的、不可吸附的化合物截留下來。樣品和流動相的過濾可以維護保護柱對化學污染物的吸附容量，能夠更長時間的維護柱效，延長色譜柱的使用壽命。
誤區5：反相色譜柱不可以使用純水相
這也是不正確的，有些色譜工作者在使用低有機溶劑含量或者純水作為反相色譜柱的流動相時，發生相塌陷的現象，所以有些人認為反相色譜柱不可以使用純水相。但事實上市場上銷售的反相色譜柱（如極性嵌入和極性封端柱）都是具有水浸潤性的，其表面特性是允許使用純水的，不會導致塌陷或者保留時間移位。
誤區6：色譜柱填料粒徑越小、壓力越高，分離效果越好
色譜柱性能的好壞不能單純用填料是否是超小的粒徑以及超高的柱壓來評估。現代對于色譜柱的柱特性研究越來越深入，已經研發了一些能夠提高色譜柱柱效的方法。例如，采用新的表面多孔材料的色譜柱，其柱效與sub-2µm UHPLC柱效一樣好，與常規的LC填料色譜柱比起來，柱壓很低。
誤區7：柱壓不會影響色譜分離效果
近年來，柱壓的問題引起了很多色譜工作者的注意，柱壓是色譜的很多參數都是受柱壓影響的，包括部分溶質的摩爾體積、停滯體積、柱孔隙度、保留因子、流動相密度、介電常數、固定相結構、pH值和電離常數等。當色譜柱在約2000psi（13.789MPa）壓力下運行時，即使保留時間上存在小差異，也并不會引起我們的注意；特別是如果重復性較好及定量不受影響的時候。但是，當柱壓接近2000psi（13.789MPa）時，柱壓的影響可能就相當明顯了。
近幾十年來，液相色譜法被廣泛應用于生命科學領域，藥物分析，食品分析，環境監測等領域，人們對于液相色譜法的不斷研究，也誕生出更多的液相色譜應用以及解決方法等，相信未來液相色譜法的應用領域會更加廣闊。
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