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SRM 2372a-人類DNA定量標準
SRM 2372a - Human DNA Quantitation Standard
目的:本標準參考物質(zhì)(SRM)用于人類基因組脫氧核糖核酸(DNA)定量材料的值分配,主要用于定量聚合酶鏈反應(qPCR)。
描述:SRM 2372a的一個單元由三種在pH 8.0水性緩沖液中良好表征的人類基因組DNA材料組成。 這些成分來自人血沉棕黃層樣品,并標記為A,B和C。成分A由來自單個雄性供體的基因組DNA組成。 組分B由來自單個雌性供體的基因組DNA組成。 組分C由基因組DNA的重量混合物(1個雄性供體和3個雌性供體)組成。 一個SRM單元由一個無菌的0.5 mL每種成分的小瓶組成,每個小瓶包含約55 µL DNA溶液。 這些小瓶均貼有標簽,并用帶有顏色標記的螺帽密封。
認證值:表1中提供了認證值。這些認證值是基于8個染色體上的10個wei一靶標的液滴數(shù)字聚合酶鏈反應(ddPCR)分析計數(shù),稀釋因子和液滴體積測量值而確定的。 NIST認證值是NIST對所有已知或疑似偏差來源均已考慮在內(nèi)的值具有置信度的值。
表1. SRM 2372a(a)的數(shù)量和質(zhì)量濃度的認證值副本號的值可通過計量學溯源到自然單位計數(shù)1和比率1以及單位制(SI)得出的體積單位。 DNA質(zhì)量濃度值可從計量學上追溯到自然單位計數(shù)和比率1以及SI衍生的質(zhì)量和體積單位。
(A)該值表示為x±U95%(x),其中x是認證值,U95%(x)是認證值的擴展不確定度。相信分析物的真實值在x±U95%(x)的區(qū)間內(nèi),置信度為95%。為了傳播這種不確定性,請將認證值視為具有均值x和標準偏差U95%(x)/ 2的正態(tài)分布隨機變量。
(B)拷貝數(shù)濃度值(每納升人類單倍體基因組當量(HHGE))基于八個染色體上十個目標wei一的液滴數(shù)(ddPCR)分析,稀釋因子和液滴體積測量值。
(C)由濃度結(jié)果計算的每微升人類基因組DNA ng的質(zhì)量濃度值,是指HHGE中核苷酸堿基對(bp)的數(shù)量和鈉鹽的平均分子量構(gòu)成DNA聚合物的核苷酸單體。
表2。檢測特異性mtDNA/nDNA比值(a)這些值在計量學上可追溯到ddPCR測量方法和所使用的分析。
(a)值表示為x±U95%(x),其中x是估計值,U95%(x)是其擴展的不確定性。該比率的真實值被認為在x±U95%(x)的區(qū)間內(nèi),置信度為95%。要傳播此不確定性,請將值視為具有均值x和標準偏差U95%(x)/ 2的正態(tài)分布隨機變量。
儲存和處理:在需要使用之前,應將SRM 2372a避光保存在2°C至8°C之間。
在取出樣品等分試樣進行分析之前,應短暫混合組分小瓶并離心(不打開小瓶蓋)。為使認證值適用,應在打開樣品瓶后立即取出材料并立即進行處理。認證值不適用于加蓋的小瓶中的任何材料。該認證僅適用于初次使用,如果以后再使用其余材料,則不能保證獲得相同的結(jié)果。
使用:對于qPCR測定,相對于認證質(zhì)量濃度,為二級標準DNA溶液分配值。使用一個或多個由SRM 2372a組分制備的稀釋系列,將測定校準至SRM 2372a。對于非性別特異性qPCR分析,應將所有三個組件用作校正劑,以闡明潛在的材料分析特異性相互作用。用戶應記住,存在潛在的移液錯誤。因此,在準備校準溶液時應格外小心。
安全性:制備該產(chǎn)品時使用的每個供體單位均已通過FDA許可的測試,對人類免疫缺陷病毒(HIV-1 RNA和抗HIV 1/2),乙型肝炎(HBV DNA和HBsAg)呈陰性,丙型肝炎(HCV RNA和抗HCV),西尼羅河病毒(WNV RNA)和梅毒。此外,每個供體均根據(jù)FDA克氏錐蟲(Chagas)的指南進行了測試,發(fā)現(xiàn)為陰性/無反應性。但是,沒有已知的測試方法可以*保證這種材料中沒有傳染原。因此,應以生物安全等級1處理這種基于人類血液的產(chǎn)品。SRM 2372a組件和衍生的溶液應按照當?shù)兀莺吐?lián)邦法規(guī)進行處置。
資料來源:該SRM是在NIST對人體進行適當研究確定后開發(fā)的。
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