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RM 8375(美國NIST)微生物基因組DNA標(biāo)準(zhǔn)品(MG-001, MG-002, MG-003, MG-004)
RM 8375 - Microbial Genomic DNA Standards for Sequencing Performance Assessment
(MG-001, MG-002, MG-003, MG-004)
該參考材料(RM)用于微生物全基因組測序的驗證,優(yōu)化,過程評估和性能評估。特別注意評估基因組序列。 RM 8375的單位由四個小瓶組成。每個小瓶含有不同的微生物基因組DNA樣品(MG-001 Salmonella Typhimurium LT2,MG-002 Staphylococcus aureus,MG-003 Pseudomonas aeruginosa和MG-004 Clostridium sporogenes)。
該材料旨在幫助評估高通量微生物DNA測序方法的性能。該基因組DNA已從細(xì)胞培養(yǎng)物中提取。因為RM是提取DNA,所以它不會評估DNA提取等預(yù)分析步驟。然而,它確實挑戰(zhàn)了測序文庫制備,測序機,堿基調(diào)用算法以及隨后的生物信息學(xué)分析。該RM不用于評估其他生物信息學(xué)步驟,如菌株鑒定,系統(tǒng)發(fā)育分析或基因組注釋。評估基因組DNA的純度適合于這些目的。
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