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產(chǎn)品簡(jiǎn)介
詳細(xì)介紹
納米孔測(cè)序儀 MinION MK1C是一款多方位集成的、*便攜式測(cè)序和分析測(cè)序儀,利用更*的納米孔測(cè)序技術(shù),實(shí)現(xiàn)對(duì)DNA和RNA分子的高通量單分子實(shí)時(shí)測(cè)序。
原理:?jiǎn)畏肿蛹{米孔測(cè)序技術(shù)。
品牌:Oxford Nanopore Technologies(ONT),UK英國(guó)
應(yīng)用類型:全基因組測(cè)序、靶向測(cè)序、RNA測(cè)序、宏基因組測(cè)序、表觀遺傳學(xué)等。
樣本類型:基因組DNA、擴(kuò)增子/PCR產(chǎn)物、cDNA、RNA。
環(huán)境:
儲(chǔ)存環(huán)境:溫度要求:10~30℃、濕度要求:5%~95%
工作環(huán)境:野外/現(xiàn)場(chǎng)、實(shí)驗(yàn)室、移動(dòng)實(shí)驗(yàn)車
溫度要求:18~25℃
濕度要求:10%~80%
電源要求:100~240 VAC (50/60Hz)
其他要求:網(wǎng)絡(luò)
儀器參數(shù):
流動(dòng)槽(flow cell):1個(gè)MinION/Flongle測(cè)序芯片槽
體積:3*14*11.4 cm(高30mm | 寬140mm | 深114mm)
重量:420g
預(yù)裝軟件:Linux操作系統(tǒng)、MinKNOW、Guppy、EPI2ME
CPU:ARM 6核處理器
GPU:256核GPU
內(nèi)存:8 GB RAM
儲(chǔ)存:內(nèi)置1 TB固態(tài)硬盤,支持USB及SD移動(dòng)存儲(chǔ)
觸摸屏:OLED觸摸屏
網(wǎng)絡(luò)支持:Wi-Fi,GSM、UMTS及LTE模式的蜂窩網(wǎng)
儀器性能:
測(cè)序通道數(shù)量:512(2048)/MinION測(cè)序芯片槽或216/Flongle測(cè)序芯片槽;
起始樣品量:10pg~5ug;
測(cè)序樣品上樣量:≥100ng,75ul;
運(yùn)行時(shí)間:1min~48hrs(按需可控);
測(cè)序速度:450bp/s(DNA)、70bp/s(RNA);
運(yùn)行數(shù):1個(gè)flow cell實(shí)驗(yàn);
芯片使用壽命:72 hrs;
原始數(shù)據(jù)存儲(chǔ)。
性能指標(biāo)
文庫(kù)制備時(shí)間:10min(Rapid)或2hrs(Ligation);
DNA/RNA直接測(cè)序(RNA無(wú)需轉(zhuǎn)換成cDNA即可進(jìn)行測(cè)序);
獲取序列時(shí)間:運(yùn)行2min;
序列條數(shù):4.4 Million(百萬(wàn))reads(以10kb長(zhǎng)度計(jì)算);
讀長(zhǎng)長(zhǎng)度:從200bp至2Mb;
測(cè)序數(shù)據(jù)產(chǎn)量:10~30 Gb/MinION flow cel;200Mb~2Gb/Flongle flow cel;
堿基質(zhì)量:99%;
堿基修飾:直接檢測(cè)堿基修飾信息(甲基化檢測(cè));
分析Nanopore測(cè)序數(shù)據(jù)的工具:≥30種、開(kāi)源;
集成設(shè)備:儀器本身為高性能計(jì)算機(jī),可實(shí)時(shí)完成數(shù)據(jù)獲取,存儲(chǔ)以及堿基轉(zhuǎn)換(basecalling)。
納米孔測(cè)序儀 MinION MK1C優(yōu)點(diǎn):
MinION Mk1C結(jié)合了MinION實(shí)時(shí)快速可手持測(cè)序、Flongle強(qiáng)大的集成計(jì)算和高分辨率觸摸屏的優(yōu)點(diǎn), 能夠?yàn)镈NA/RNA測(cè)序提供多方位的解決方案。
安裝簡(jiǎn)便:多方位集成的、*便攜式測(cè)序和分析測(cè)序儀,沒(méi)有復(fù)雜的激光或光路系統(tǒng),直接連接電源即可使用,無(wú)需日常維護(hù)。
單分子測(cè)序:DNA/RNA可直接測(cè)序,無(wú)需PCR擴(kuò)增,免除PCR擴(kuò)增帶來(lái)的錯(cuò)誤和GC偏差,快速、實(shí)時(shí)。
直接RNA測(cè)序:提取RNA無(wú)需轉(zhuǎn)換成cDNA即可進(jìn)行測(cè)序。
甲基化檢測(cè):堿基修飾基于電信號(hào)的差異檢測(cè)堿基,在DNA/RNA測(cè)序同時(shí)可直接檢測(cè)堿基修飾。
數(shù)據(jù)產(chǎn)生快速:提供更*的單分子實(shí)時(shí)測(cè)序,上機(jī)后2分鐘產(chǎn)生堿基序列數(shù)據(jù)。并可以根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求設(shè)置測(cè)序反應(yīng)時(shí)間。
實(shí)時(shí)分析:可在測(cè)序同時(shí)完成原始電信號(hào)堿基讀取(Fast5 To FastQ)、數(shù)據(jù)質(zhì)量控制(QC)、barcode拆分(Demultiplexing)、序列比對(duì)(Alignment)、基因組組裝(Assembly)、宏基因組分析(Metagenomics)、擴(kuò)增子分析(Amplicon)、測(cè)序錯(cuò)誤校正(Error correction)、變異分析(Variant calling)、堿基修飾(Base modification